More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5536 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5536  LuxR response regulator receiver  100 
 
 
209 aa  420  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.882777  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5940  LuxR family response regulator  61.72 
 
 
220 aa  264  7e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000781929  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2928  two component LuxR family transcriptional regulator  59.33 
 
 
213 aa  256  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4331  two component LuxR family transcriptional regulator  59.02 
 
 
212 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.748519  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5714  two component LuxR family transcriptional regulator  58.85 
 
 
210 aa  248  4e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6883  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.4 
 
 
213 aa  247  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.239531  normal  0.170628 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4470  two component LuxR family transcriptional regulator  57.89 
 
 
232 aa  232  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.370568  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2093  putative two-component response regulator  45.67 
 
 
207 aa  175  5e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12780  putative two-component response regulator  42.65 
 
 
209 aa  174  7e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000436161  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24710  putative two-component response regulator  45.19 
 
 
207 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1643  two component LuxR family transcriptional regulator  40.57 
 
 
205 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.003137  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1160  putative two-component response regulator  42.86 
 
 
209 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0122525  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1620  two component LuxR family transcriptional regulator  41.78 
 
 
206 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0222153 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4322  two component LuxR family transcriptional regulator  42.16 
 
 
207 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1090  LuxR family DNA-binding response regulator  42.16 
 
 
207 aa  171  9e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3638  two component LuxR family transcriptional regulator  40.09 
 
 
205 aa  171  9e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.489861 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2101  LuxR family DNA-binding response regulator  40.09 
 
 
207 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00862279  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1131  two component LuxR family transcriptional regulator  42.16 
 
 
236 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.796271  normal  0.799889 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1119  two component LuxR family transcriptional regulator  43.41 
 
 
208 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4151  DNA-binding response regulator, LuxR family  42.65 
 
 
208 aa  166  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.35782  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3890  LuxR response regulator receiver  42.65 
 
 
208 aa  166  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4515  two component LuxR family transcriptional regulator  42.65 
 
 
208 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00786387 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2114  LuxR response regulator receiver  41.15 
 
 
212 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0036  putative two-component response regulator  44.71 
 
 
207 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.035019  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00430  putative two-component response regulator  44.71 
 
 
207 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.247974 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3974  two component LuxR family transcriptional regulator  40.19 
 
 
208 aa  159  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2160  LuxR family DNA-binding response regulator  40.58 
 
 
210 aa  154  8e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2269  two component LuxR family transcriptional regulator  40.58 
 
 
210 aa  154  8e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2113  LuxR family DNA-binding response regulator  40.1 
 
 
210 aa  151  5.9999999999999996e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.616678 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0174  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.51 
 
 
208 aa  148  6e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1808  two component LuxR family transcriptional regulator  36.41 
 
 
207 aa  144  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000516369  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0602  transcriptional regulator FimZ  35.41 
 
 
210 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379869  normal  0.0923244 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0659  transcriptional regulator FimZ  35.41 
 
 
210 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.611229  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0594  transcriptional regulator FimZ  35.41 
 
 
210 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.627077  hitchhiker  0.00790766 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0595  transcriptional regulator FimZ  34.3 
 
 
210 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.447967  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0304  two component LuxR family transcriptional regulator  38.76 
 
 
207 aa  143  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0598  transcriptional regulator FimZ  34.3 
 
 
210 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.110504 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6866  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.28 
 
 
202 aa  135  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.140006  normal  0.169631 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00485  predicted DNA-binding transcriptional regulator  31.88 
 
 
210 aa  134  7.000000000000001e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3087  transcriptional regulator FimZ  31.88 
 
 
210 aa  134  7.000000000000001e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0610  transcriptional regulator FimZ  31.88 
 
 
210 aa  134  7.000000000000001e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00490  hypothetical protein  31.88 
 
 
210 aa  134  7.000000000000001e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3078  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.88 
 
 
210 aa  134  9e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0580  transcriptional regulator FimZ  31.88 
 
 
210 aa  134  9e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0636  transcriptional regulator FimZ  31.88 
 
 
210 aa  134  9e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.931873  normal  0.250092 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0577  transcriptional regulator FimZ  31.88 
 
 
210 aa  134  9e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2781  two component LuxR family transcriptional regulator  34.12 
 
 
204 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0993  transcriptional regulator FimZ  31.6 
 
 
210 aa  131  7.999999999999999e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000287084 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0459  two component LuxR family transcriptional regulator  38.68 
 
 
207 aa  131  9e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.957088  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0522  LuxR response regulator receiver  39.42 
 
 
212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000276468  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4334  two component LuxR family transcriptional regulator  37.98 
 
 
209 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255025  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2906  two component LuxR family transcriptional regulator  35.89 
 
 
203 aa  126  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2350  two component LuxR family transcriptional regulator  36.1 
 
 
204 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3412  LuxR family DNA-binding response regulator  35.61 
 
 
204 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1863  two component LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
209 aa  123  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207146  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2528  two component LuxR family transcriptional regulator  35.61 
 
 
204 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0522002 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2738  DNA-binding transcriptional activator EvgA  33.96 
 
 
204 aa  120  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02279  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with EvgS  33.96 
 
 
204 aa  119  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1288  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.96 
 
 
204 aa  119  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2519  DNA-binding transcriptional activator EvgA  33.96 
 
 
204 aa  119  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2655  DNA-binding transcriptional activator EvgA  33.96 
 
 
204 aa  119  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3600  DNA-binding transcriptional activator EvgA  33.96 
 
 
204 aa  119  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0441797 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2506  DNA-binding transcriptional activator EvgA  33.96 
 
 
204 aa  119  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00265649  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1300  DNA-binding transcriptional activator EvgA  33.96 
 
 
204 aa  119  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02240  hypothetical protein  33.96 
 
 
204 aa  119  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0462  transcriptional regulator FimZ  30.26 
 
 
199 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.739138  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3271  response regulator  31.43 
 
 
214 aa  118  7.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0222898  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1429  two component LuxR family transcriptional regulator  33.01 
 
 
211 aa  116  3e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.85494 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1909  response regulator receiver protein  32.55 
 
 
220 aa  116  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.631594  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.85 
 
 
211 aa  114  6.9999999999999995e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0998  response regulator  30.95 
 
 
214 aa  114  7.999999999999999e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2571  transmission activator LetA  29.05 
 
 
219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1191  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.259161  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0896  LuxR family transcriptional regulator  30.95 
 
 
214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2699  transmission activator LetA  29.05 
 
 
219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0703  LuxR family transcriptional regulator  32.7 
 
 
211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000151408  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0677  two component LuxR family transcriptional regulator  32.7 
 
 
211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00533706  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1614  response regulator  29.67 
 
 
214 aa  112  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000746753  normal  0.505035 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1293  LuxR family DNA-binding response regulator  32.7 
 
 
216 aa  112  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0815  two component LuxR family transcriptional regulator  31.4 
 
 
213 aa  112  5e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1850  two component LuxR family transcriptional regulator  33.97 
 
 
216 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2943  two component LuxR family transcriptional regulator  34.16 
 
 
215 aa  111  7.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1782  response regulator  29.19 
 
 
214 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0381154  hitchhiker  0.0000000750596 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2562  response regulator  29.19 
 
 
214 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0171044  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2677  response regulator  29.19 
 
 
214 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0738952  normal  0.957867 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2600  response regulator  29.19 
 
 
214 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000388579  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3790  two component LuxR family transcriptional regulator  33.82 
 
 
226 aa  111  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1860  response regulator  29.19 
 
 
214 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3024  DNA-binding response regulator GacA  32.55 
 
 
214 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.26082  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0480  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.21 
 
 
214 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1676  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.78 
 
 
228 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1547  response regulator  29.19 
 
 
214 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000288339  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2649  response regulator  29.67 
 
 
214 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1608  response regulator  29.19 
 
 
214 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000660452  normal  0.150334 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1168  LuxR family transcriptional regulator  33.01 
 
 
216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0828  response regulator  33.01 
 
 
216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0183204  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0726  response regulator  30 
 
 
211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1436  response regulator  29.19 
 
 
214 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.794512  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4516  two component LuxR family transcriptional regulator  35.58 
 
 
214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0463384  normal  0.0270495 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2141  response regulator  29.27 
 
 
214 aa  109  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.126922  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>