71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3280 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3280  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 229 aa  472  1e-132  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.158452  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3202  transcriptional regulator, LuxR family  70.31 
 
 		 229 aa  355  2.9999999999999997e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0816  transcriptional regulator, LuxR family  63.76 
 
 		 229 aa  324  6e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1045  transcriptional regulator, LuxR family  64.25 
 
 		 229 aa  323  1e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4193  LuxR family transcriptional regulator  60.73 
 
 		 229 aa  296  1e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0414  transcriptional regulator, LuxR family  46.61 
 
 		 222 aa  226  2e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0422  transcriptional regulator, LuxR family  24.15 
 
 		 227 aa  91.7  9e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0371  transcriptional regulator, LuxR family  23.67 
 
 		 227 aa  88.2  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46850  putative transcriptional regulator  25.73 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000531033 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0372  putative PAS/PAC sensor protein  28.71 
 
 		 221 aa  67  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0423  transcriptional regulator, LuxR family  26.7 
 
 		 221 aa  64.7  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4037  putative transcriptional regulator  24.51 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.586307  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1621  LuxR family transcriptional regulator  23.79 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1275  transcription regulator LuxR family protein  23.58 
 
 		 268 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.41093  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0164  LuxR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 246 aa  58.9  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0153554  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0852  transcriptional regulator, LuxR family  27.18 
 
 		 226 aa  58.5  0.00000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1595  LuxR family transcriptional regulator  23.11 
 
 		 254 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0092  LuxR family transcriptional regulator  23.11 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1512  LuxR family transcriptional regulator  23.11 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.150572  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1927  hypothetical protein  23.98 
 
 		 223 aa  50.8  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1736  DNA-binding response regulator NarL  36.11 
 
 		 233 aa  49.7  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1519  DNA-binding response regulator NarL  36.11 
 
 		 233 aa  49.7  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.281442  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2630  nitrate/nitrite response regulator protein NarL  36.11 
 
 		 233 aa  49.7  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.14617  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3072  DNA-binding response regulator NarL  36.11 
 
 		 233 aa  49.7  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2246  DNA-binding response regulator NarL  36.11 
 
 		 233 aa  49.7  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2764  DNA-binding response regulator NarL  36.11 
 
 		 233 aa  49.7  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.922757  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2686  nitrate/nitrite response regulator protein NarL  36.11 
 
 		 233 aa  49.7  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6717  transcriptional regulator, LuxR family  37.31 
 
 		 509 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.440846  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1849  DNA-binding response regulator NarL  35.21 
 
 		 233 aa  48.1  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3936  two component LuxR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 213 aa  47.4  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00507176  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0972  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 227 aa  46.6  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.299836  normal  0.0302219 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3120  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.51 
 
 		 218 aa  46.2  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.954631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1243  transcriptional regulator, LuxR family  36.07 
 
 		 550 aa  45.4  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3813  PAS sensor protein  26.74 
 
 		 500 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2881  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.55 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0367  transcriptional regulator, LuxR family  38.1 
 
 		 556 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1580  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 		 216 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1605  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 		 216 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2791  LuxR family transcriptional regulator  25 
 
 		 180 aa  44.7  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0228  LuxR family two component transcriptional regulator  35 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 208 aa  44.3  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3423  sensor protein  31.82 
 
 		 496 aa  43.9  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5428  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.7 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358603 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1023  transcriptional regulator, LuxR family  24.18 
 
 		 684 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0210  transcriptional regulator, LuxR family  27.27 
 
 		 500 aa  44.3  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.252259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1292  transcriptional regulator, LuxR family  36.54 
 
 		 845 aa  43.5  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000215082 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39510  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  27.87 
 
 		 216 aa  43.1  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.657091 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3188  LuxR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 368 aa  43.1  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0110301  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4558  LuxR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 266 aa  43.5  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3826  transcriptional regulator, LuxR family  33.87 
 
 		 519 aa  43.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.553807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0581  two component LuxR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 235 aa  43.1  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.706783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7055  two component transcriptional regulator, LuxR family  21.84 
 
 		 219 aa  43.5  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2482  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 208 aa  43.1  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0211915  normal  0.642006 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2158  LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 491 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3042  two component LuxR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 222 aa  42.7  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.280021 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 225 aa  42.4  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.717242  normal  0.142765 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17720  LuxR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 261 aa  42.4  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000142633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1884  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.74 
 
 		 219 aa  42.4  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0279  response regulator receiver protein  27.87 
 
 		 216 aa  42.4  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1406  DNA-binding response regulator  35 
 
 		 215 aa  42.4  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.253896  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1542  putative transcriptional regulator  43.14 
 
 		 262 aa  42.4  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2887  LuxR family two component transcriptional regulator  32.73 
 
 		 225 aa  42.4  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.526109  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3359  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.26 
 
 		 219 aa  42  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00321115  hitchhiker  0.000132937 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0799  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.2 
 
 		 226 aa  42  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0373  response regulator receiver  26.15 
 
 		 220 aa  41.6  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6057  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.94 
 
 		 217 aa  42  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2604  transcriptional regulator, LuxR family  39.22 
 
 		 74 aa  42  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2443  LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 497 aa  41.6  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.218456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1984  two component LuxR family transcriptional regulator  30 
 
 		 220 aa  41.6  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178457  normal  0.123783 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2114  transcriptional regulator, LuxR family  35 
 
 		 191 aa  41.6  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000451621  normal  0.459179 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3373  two component LuxR family transcriptional regulator  24.67 
 
 		 262 aa  41.6  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.492418  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>