37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4193 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4193  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 229 aa  479  1e-134  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3202  transcriptional regulator, LuxR family  61.64 
 
 		 229 aa  303  1.0000000000000001e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1045  transcriptional regulator, LuxR family  60.27 
 
 		 229 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0816  transcriptional regulator, LuxR family  59.83 
 
 		 229 aa  301  6.000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3280  transcriptional regulator, LuxR family  60.73 
 
 		 229 aa  296  1e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.158452  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0414  transcriptional regulator, LuxR family  46.58 
 
 		 222 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0371  transcriptional regulator, LuxR family  28.04 
 
 		 227 aa  99.4  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0422  transcriptional regulator, LuxR family  28.5 
 
 		 227 aa  99  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4037  putative transcriptional regulator  29.13 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.586307  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1621  LuxR family transcriptional regulator  23.35 
 
 		 270 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46850  putative transcriptional regulator  28.43 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000531033 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0372  putative PAS/PAC sensor protein  26.87 
 
 		 221 aa  68.2  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0423  transcriptional regulator, LuxR family  26.87 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1927  hypothetical protein  24.3 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1512  LuxR family transcriptional regulator  21.62 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.150572  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1275  transcription regulator LuxR family protein  21.83 
 
 		 268 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.41093  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0164  LuxR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0153554  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1595  LuxR family transcriptional regulator  21.62 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0092  LuxR family transcriptional regulator  21.4 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07094  histidine kinase  20.91 
 
 		 239 aa  52  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0852  transcriptional regulator, LuxR family  25.84 
 
 		 226 aa  48.9  0.00006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3948  LuxR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 181 aa  45.4  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3855  LuxR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 181 aa  45.1  0.0009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3936  two component LuxR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 213 aa  44.3  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00507176  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3890  transcriptional regulator, LuxR family protein  31.58 
 
 		 174 aa  43.9  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2791  LuxR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 180 aa  43.9  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3763  LuxR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 176 aa  44.3  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.415447 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1676  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  25.23 
 
 		 996 aa  42.7  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2158  LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 491 aa  42.4  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4063  LuxR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 181 aa  42  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4298  response regulator receiver protein  28.95 
 
 		 181 aa  42  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2881  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.43 
 
 		 212 aa  42  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4438  LuxR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 181 aa  42  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1580  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 216 aa  41.6  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1605  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 216 aa  41.6  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0102  response regulator receiver protein  28.95 
 
 		 175 aa  41.6  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2098  hypothetical protein  27.08 
 
 		 154 aa  41.6  0.01  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>