94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl2098 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl2098  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  312  9.999999999999999e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0852  transcriptional regulator, LuxR family  53.42 
 
 
226 aa  74.7  0.0000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1595  LuxR family transcriptional regulator  33.11 
 
 
254 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1275  transcription regulator LuxR family protein  32.89 
 
 
268 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.41093  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1512  LuxR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
252 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.150572  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0092  LuxR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
267 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07094  histidine kinase  43.06 
 
 
239 aa  65.1  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1621  LuxR family transcriptional regulator  34.44 
 
 
270 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001015  transcriptional regulator LuxR family  41.67 
 
 
184 aa  63.5  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0164  LuxR family transcriptional regulator  43.66 
 
 
246 aa  62  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0153554  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1926  hypothetical protein  34.21 
 
 
270 aa  58.2  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1927  hypothetical protein  39.71 
 
 
223 aa  55.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6408  LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 
248 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6378  LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 
248 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1403  hypothetical protein  42.86 
 
 
252 aa  52  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3549  regulatory protein, LuxR  37.7 
 
 
255 aa  48.9  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2627  hypothetical protein  37.7 
 
 
227 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2482  hypothetical protein  37.7 
 
 
227 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3835  two component LuxR family transcriptional regulator  29.87 
 
 
217 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.760782  normal  0.0940778 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2084  LuxR family transcriptional regulator  27.35 
 
 
269 aa  47.4  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.730902  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0033  LuxR family regulatory protein  34.33 
 
 
84 aa  47  0.00009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2002  LuxR family transcriptional regulator  34.33 
 
 
84 aa  47  0.00009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1549  LuxR transcriptional regulator  30.53 
 
 
201 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.355184  normal  0.152747 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0761  LuxR family transcriptional regulator  39.29 
 
 
881 aa  47  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2525  LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
276 aa  45.4  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.853805  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0533  two component LuxR family transcriptional regulator  31.34 
 
 
219 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.405575  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38900  putative two-component response regulator  30.12 
 
 
225 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.899747  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2744  two component LuxR family transcriptional regulator  36.51 
 
 
201 aa  46.2  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1935  LuxR family transcriptional regulator  31.88 
 
 
254 aa  45.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0226826  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4179  response regulator receiver protein  24.48 
 
 
309 aa  45.1  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.15819 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1997  regulatory protein, LuxR  33.87 
 
 
278 aa  44.7  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1406  DNA-binding response regulator  40.98 
 
 
215 aa  45.1  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.253896  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1854  LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
310 aa  44.7  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2667  transcriptional regulator, LuxR family  26.32 
 
 
241 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.530563  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1565  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.34 
 
 
200 aa  44.7  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2928  transcriptional regulator, LuxR family  31.58 
 
 
241 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.258432  normal 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4984  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.16 
 
 
201 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0145131 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2136  two component LuxR family transcriptional regulator  33.75 
 
 
240 aa  43.9  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0154869 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1362  LuxR family transcriptional regulator  25.37 
 
 
257 aa  43.9  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2528  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.16 
 
 
201 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0341229 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3314  putative two-component response regulator  32.86 
 
 
225 aa  43.9  0.0009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2317  hypothetical protein  31.67 
 
 
267 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1550  putative regulatory protein  31.03 
 
 
260 aa  43.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.496959 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0243  regulatory protein LuxR  33.78 
 
 
245 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.537224 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6196  transcriptional regulator, LuxR family  35.09 
 
 
275 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3341  response regulator receiver protein  21.43 
 
 
275 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0108642  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5323  transcriptional regulator two component heavy metal regulatory response ZniR  32.26 
 
 
206 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.844748 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4290  two component LuxR family transcriptional regulator  43.1 
 
 
218 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2290  two component LuxR family transcriptional regulator  40.98 
 
 
215 aa  43.1  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3992  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.06 
 
 
214 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82671  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2710  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.15 
 
 
230 aa  42.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248821  normal  0.606697 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4359  regulatory protein, LuxR  31.67 
 
 
301 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3779  regulatory protein, LuxR  29.27 
 
 
248 aa  42.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2791  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.42 
 
 
213 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0590322  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6376  transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 
258 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.888984 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003136  transcriptional regulator LuxR family protein  33.87 
 
 
212 aa  42  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12843  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1269  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.15 
 
 
226 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00432991 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2373  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.07 
 
 
192 aa  42  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2003  LuxR family transcriptional regulator  38.98 
 
 
127 aa  42  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2417  LuxR family transcriptional regulator  30.38 
 
 
244 aa  42  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0034  LuxR family regulatory protein  38.98 
 
 
127 aa  42  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1626  two component LuxR family transcriptional regulator  34.43 
 
 
194 aa  41.6  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.947018 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4193  LuxR family transcriptional regulator  27.08 
 
 
229 aa  41.6  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3357  two component LuxR family transcriptional regulator  42.62 
 
 
238 aa  41.6  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.1255  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4439  LuxR family transcriptional regulator  36.07 
 
 
234 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4277  transcriptional regulator, LuxR family  36.07 
 
 
234 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.343912 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1673  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.16 
 
 
201 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.619826  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2943  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.16 
 
 
201 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1407  LuxR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
241 aa  41.6  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.959158  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0505  transcriptional regulator, LuxR family  31.67 
 
 
244 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3838  transcriptional regulator, LuxR family  28.81 
 
 
161 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696628  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0610  LuxR family transcriptional regulator  36.07 
 
 
234 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.317613 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4067  two component LuxR family transcriptional regulator  52.78 
 
 
233 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.836498  normal  0.141664 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0548  transcriptional regulator, LuxR family  31.67 
 
 
244 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.216848  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0376  two component LuxR family transcriptional regulator  28.04 
 
 
240 aa  41.2  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3098  transcriptional regulator, LuxR family  30.99 
 
 
254 aa  41.2  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.521704  normal  0.269359 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1575  transcriptional regulator, LuxR family  28.57 
 
 
234 aa  41.2  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.629023  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2301  LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
267 aa  41.2  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3524  two component LuxR family transcriptional regulator  30 
 
 
353 aa  41.2  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.406085  normal  0.428998 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01320  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  31.25 
 
 
261 aa  40.8  0.006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2469  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.88 
 
 
214 aa  40.8  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126163  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4539  transcriptional regulator, LuxR family, autoinducer-regulated  35.59 
 
 
254 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.542388  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0591  two component LuxR family transcriptional regulator  30.65 
 
 
301 aa  40.8  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477799  hitchhiker  0.00469436 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1516  LuxR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
182 aa  40.4  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0300196  normal  0.667528 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2087  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.67 
 
 
247 aa  40.4  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.73112  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6040  LuxR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
228 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.917081 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0105  two component LuxR family transcriptional regulator  36.67 
 
 
219 aa  40.4  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0920509 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2507  LuxR family transcriptional regulator  30 
 
 
239 aa  40.4  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.883175  normal  0.509717 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5810  LuxR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
228 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.809704  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0655  two component LuxR family transcriptional regulator  31.15 
 
 
194 aa  40.4  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2737  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.57 
 
 
227 aa  40.4  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418014  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0822  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.26 
 
 
223 aa  40.4  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.628591  normal  0.692285 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0418  LuxR family transcriptional regulator  31.67 
 
 
242 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1309  two component LuxR family transcriptional regulator  28.36 
 
 
206 aa  40  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000148999  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>