More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6196 on replicon NC_012852
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012852  Rleg_6196  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 
275 aa  568  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6376  transcriptional regulator, LuxR family  91.41 
 
 
258 aa  490  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.888984 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4539  transcriptional regulator, LuxR family, autoinducer-regulated  50.42 
 
 
254 aa  260  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.542388  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4216  regulatory protein, LuxR  51.26 
 
 
254 aa  260  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02209  transcriptional regulator AhyR/AsaR family  41.11 
 
 
254 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0933251  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2179  LuxR family transcriptional regulator  43.33 
 
 
239 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2417  LuxR family transcriptional regulator  27.31 
 
 
244 aa  83.6  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4114  putative transcriptional activator  32.6 
 
 
213 aa  82.8  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  0.314154 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3098  transcriptional regulator, LuxR family  31.86 
 
 
254 aa  81.6  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.521704  normal  0.269359 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0460  transcriptional regulator, LuxR family  30.29 
 
 
253 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.343765 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0097  transcriptional regulator, LuxR family  31.72 
 
 
244 aa  78.2  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3500  LuxR family transcriptional regulator  27.67 
 
 
247 aa  77.4  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.547243 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1997  regulatory protein, LuxR  31.12 
 
 
278 aa  74.3  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0282  transcriptional regulator, LuxR family  28.06 
 
 
246 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.419752  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4439  LuxR family transcriptional regulator  28.49 
 
 
234 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1443  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.14 
 
 
238 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0542  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.14 
 
 
238 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0854  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.14 
 
 
238 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.777865  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2171  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.14 
 
 
238 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0944598  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0444  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.14 
 
 
238 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.853961  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5725  DNA-binding HTH domain-containing protein  26.18 
 
 
307 aa  72.8  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000726612  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4359  regulatory protein, LuxR  23.11 
 
 
301 aa  72.8  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5576  LuxR family transcriptional regulator  26.48 
 
 
239 aa  72  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000012464  normal  0.015154 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3643  LuxR family transcriptional regulator  26.48 
 
 
239 aa  72  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00106494  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4724  LuxR family transcriptional regulator  26.48 
 
 
239 aa  72  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000522863  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1863  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.42 
 
 
394 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00465528  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4116  LuxR family transcriptional regulator  26.48 
 
 
239 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0201758  hitchhiker  0.00877352 
 
 
-
 
NC_004310  BR0190  LuxR family transcriptional regulator  26.69 
 
 
235 aa  71.2  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.195449  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3395  LuxR family transcriptional regulator  32.16 
 
 
260 aa  71.2  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2087  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.6 
 
 
425 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.417065  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1052  LuxR family transcriptional regulator  26.09 
 
 
239 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000445716  normal  0.182523 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0323  transcriptional regulator, LuxR family  29.2 
 
 
243 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0183  LuxR family transcriptional regulator  26.27 
 
 
235 aa  69.3  0.00000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0816251  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2215  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  30 
 
 
230 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.311283  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4581  LuxR family transcriptional regulator  26.09 
 
 
239 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000141763  hitchhiker  0.0000089809 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1576  LuxR family transcriptional regulator  30 
 
 
230 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.893939  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0617  LuxR family transcriptional regulator  30 
 
 
230 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0241474  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2128  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  30 
 
 
230 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.423434  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0702  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  30 
 
 
230 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.669136  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2024  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30 
 
 
230 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.896026  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0920  LuxR family transcriptional regulator  29.23 
 
 
268 aa  68.9  0.00000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.81926  normal  0.148698 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0198  autoinducer-binding domain-containing protein  27.43 
 
 
235 aa  68.6  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00000129067  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3796  LuxR family transcriptional regulator  26.86 
 
 
237 aa  67.8  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00301827 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0805  LuxR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
230 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.565309  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0610  LuxR family transcriptional regulator  28.8 
 
 
234 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.317613 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2084  LuxR family transcriptional regulator  25.27 
 
 
269 aa  67  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.730902  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01929  transcriptional activator of quorum sensing autoinducer synthesis transcription regulator protein  27.6 
 
 
248 aa  66.6  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.746701 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4277  transcriptional regulator, LuxR family  27.07 
 
 
234 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.343912 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3971  LuxR family transcriptional regulator  25.79 
 
 
239 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000126265  normal  0.0321799 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2210  LuxR family transcriptional regulator  26.34 
 
 
240 aa  65.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0122  LuxR family transcriptional regulator  26.38 
 
 
233 aa  65.9  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1758  autoinducer-binding domain-containing protein  26.38 
 
 
233 aa  65.9  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0965  transcriptional activator protein LuxR  23.88 
 
 
248 aa  65.5  0.0000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.266935  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1345  N-acyl homoserine lactone transcriptional regulator  27.71 
 
 
239 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1223  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  27.71 
 
 
239 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0607  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  27.71 
 
 
239 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.83559  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2485  BpsR  27.71 
 
 
239 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0962  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  27.71 
 
 
239 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0329  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  27.71 
 
 
239 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1295  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  27.71 
 
 
239 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.312538  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1510  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.71 
 
 
239 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.08907  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6408  LuxR family transcriptional regulator  33.52 
 
 
248 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6378  LuxR family transcriptional regulator  33.52 
 
 
248 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5029  transcriptional regulator, LuxR family  29.29 
 
 
243 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.771298  normal  0.575652 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0958  transcriptional activator protein LuxR  25.98 
 
 
247 aa  64.3  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3779  regulatory protein, LuxR  28.12 
 
 
248 aa  63.9  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3549  regulatory protein, LuxR  26.02 
 
 
255 aa  63.2  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4977  transcriptional regulator, LuxR family  30.73 
 
 
243 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.142556 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5040  LuxR family transcriptional regulator  26.82 
 
 
229 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350334  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0797  transcriptional regulator, LuxR family  30.16 
 
 
240 aa  63.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205827  normal  0.24043 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3863  transcriptional regulator PsyR  26.56 
 
 
247 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.831721  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4514  autoinducer-binding domain-containing protein  30.05 
 
 
243 aa  62.4  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.447162  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0359  LuxR family transcriptional regulator  27.1 
 
 
248 aa  62.4  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.870907  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5194  LuxR family transcriptional regulator  26.97 
 
 
242 aa  62  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1003  transcriptional regulator, LuxR family  29.26 
 
 
245 aa  62.4  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383688  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3810  LuxR family transcriptional regulator  26.18 
 
 
242 aa  61.6  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1709  autoinducer-binding domain-containing protein  28.72 
 
 
233 aa  60.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.781724  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5810  LuxR family transcriptional regulator  29.48 
 
 
228 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.809704  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2028  LuxR family transcriptional regulator  26.11 
 
 
242 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6040  LuxR family transcriptional regulator  29.48 
 
 
228 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.917081 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0418  LuxR family transcriptional regulator  27.2 
 
 
242 aa  60.1  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0505  transcriptional regulator, LuxR family  28.85 
 
 
244 aa  60.1  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1559  regulatory protein LuxR  30.77 
 
 
246 aa  59.7  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.509292 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5762  LuxR family transcriptional regulator  28.64 
 
 
242 aa  59.3  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.225342  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5781  response regulator receiver protein  26.56 
 
 
243 aa  59.3  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305702  hitchhiker  0.00700374 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2414  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.57 
 
 
215 aa  58.9  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1836  transcriptional regulator, LuxR family  24.75 
 
 
245 aa  58.2  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.28867  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1690  two component LuxR family transcriptional regulator  40.45 
 
 
215 aa  58.5  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.104312 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2588  LuxR family transcriptional regulator  29.83 
 
 
250 aa  58.2  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2852  transcriptional regulator  28.81 
 
 
236 aa  57.4  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1815  putative transcriptional regulator  28.65 
 
 
265 aa  57.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.319475  normal  0.33301 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0440  regulatory protein LuxR  31.98 
 
 
246 aa  57  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0539143 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0548  transcriptional regulator, LuxR family  27.69 
 
 
244 aa  57  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.216848  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0918  transcriptional regulator LuxR family  36.57 
 
 
230 aa  56.6  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1622  LuxR transcriptional regulator  27.18 
 
 
247 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.831315  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0087  two component transcriptional regulator, LuxR  50 
 
 
210 aa  56.2  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.197031  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1442  transcriptional regulator, LuxR family  23.9 
 
 
245 aa  55.8  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.600459  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1676  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 
210 aa  55.8  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.123322  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0175  LuxR family transcriptional regulator  27 
 
 
254 aa  55.8  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.508003  normal  0.575618 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1723  two component LuxR family transcriptional regulator  45.16 
 
 
240 aa  55.8  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>