49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene COXBURSA331_A2003 on replicon NC_010117
Organism: Coxiella burnetii RSA 331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010117  COXBURSA331_A2003  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 
127 aa  264  2.9999999999999995e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0034  LuxR family regulatory protein  100 
 
 
127 aa  264  2.9999999999999995e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2071  LuxR family regulatory protein  56.25 
 
 
73 aa  74.3  0.0000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0680507  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2002  LuxR family transcriptional regulator  43.66 
 
 
84 aa  65.9  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0033  LuxR family regulatory protein  43.66 
 
 
84 aa  65.9  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1927  hypothetical protein  37.5 
 
 
223 aa  46.2  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6057  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.3 
 
 
217 aa  45.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1621  LuxR family transcriptional regulator  37.7 
 
 
270 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1466  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.84 
 
 
215 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.25338  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02079  hypothetical protein  27.84 
 
 
215 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0748  transcriptional regulator NarP  27.84 
 
 
215 aa  44.3  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.251733  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2341  transcriptional regulator NarP  27.84 
 
 
215 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.277554 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1457  transcriptional regulator NarP  27.84 
 
 
215 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.956805 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2492  transcriptional regulator NarP  27.84 
 
 
215 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2331  transcriptional regulator NarP  27.84 
 
 
215 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02120  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with NarQ or NarX  27.84 
 
 
215 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1406  DNA-binding response regulator  38.1 
 
 
215 aa  43.9  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.253896  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3330  transcriptional regulator NarP  27.84 
 
 
215 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1559  two component regulator  38.36 
 
 
959 aa  43.5  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2943  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.79 
 
 
201 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2711  transcriptional regulator NarP  34.25 
 
 
210 aa  43.5  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.281479  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2406  transcriptional regulator NarP  34.25 
 
 
210 aa  43.5  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1673  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.79 
 
 
201 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.619826  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3120  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.54 
 
 
218 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.954631  normal 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4984  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.79 
 
 
201 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0145131 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1403  hypothetical protein  40.82 
 
 
252 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2528  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.79 
 
 
201 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0341229 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2589  transcriptional regulator NarP  37.04 
 
 
215 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.167087 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2381  transcriptional regulator NarP  37.04 
 
 
215 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0279  response regulator receiver protein  36.54 
 
 
216 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3972  two component LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
251 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.111106  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2472  transcriptional regulator NarP  37.04 
 
 
215 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2430  transcriptional regulator NarP  37.04 
 
 
215 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.426027  normal  0.504703 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2098  hypothetical protein  38.98 
 
 
154 aa  42  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2486  transcriptional regulator NarP  37.04 
 
 
215 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187807  normal  0.0115945 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1026  response regulator protein  41.07 
 
 
217 aa  42  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0852  transcriptional regulator, LuxR family  35.48 
 
 
226 aa  41.2  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0700  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.38 
 
 
218 aa  40.8  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00980919  normal  0.316207 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3273  LuxR family transcriptional regulator  31.88 
 
 
185 aa  40.8  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0901  two component response regulator  36.54 
 
 
196 aa  40.8  0.007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4334  transcriptional regulator, LuxR family  26.32 
 
 
160 aa  40.8  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1276  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.67 
 
 
209 aa  40.4  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.161375  normal  0.335829 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0679  two component LuxR family transcriptional regulator  36.54 
 
 
213 aa  40.4  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3701  two component LuxR family transcriptional regulator  36.73 
 
 
253 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.567008  normal  0.770716 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0559  transcriptional regulator, LuxR family  27.59 
 
 
788 aa  40.4  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3863  transcriptional regulator PsyR  28 
 
 
247 aa  40.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.831721  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2290  two component LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
215 aa  40  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0805  LuxR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
230 aa  40  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.565309  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5233  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.04 
 
 
223 aa  40  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.114456  hitchhiker  0.000738291 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>