248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1621 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1621  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 270 aa  560  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0092  LuxR family transcriptional regulator  83.67 
 
 		 267 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1275  transcription regulator LuxR family protein  82.26 
 
 		 268 aa  425  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.41093  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1595  LuxR family transcriptional regulator  83.19 
 
 		 254 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1512  LuxR family transcriptional regulator  84.26 
 
 		 252 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.150572  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0164  LuxR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 246 aa  183  3e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0153554  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07094  histidine kinase  38.46 
 
 		 239 aa  172  6.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001015  transcriptional regulator LuxR family  40.33 
 
 		 184 aa  139  4.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1927  hypothetical protein  30.84 
 
 		 223 aa  112  6e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0852  transcriptional regulator, LuxR family  28.04 
 
 		 226 aa  93.6  3e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0422  transcriptional regulator, LuxR family  25.11 
 
 		 227 aa  78.2  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0371  transcriptional regulator, LuxR family  24.23 
 
 		 227 aa  77  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4193  LuxR family transcriptional regulator  23.35 
 
 		 229 aa  75.1  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3202  transcriptional regulator, LuxR family  24.67 
 
 		 229 aa  68.9  0.00000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0816  transcriptional regulator, LuxR family  22.36 
 
 		 229 aa  67.8  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2098  hypothetical protein  34.44 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3280  transcriptional regulator, LuxR family  23.79 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.158452  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1045  transcriptional regulator, LuxR family  20.76 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1205  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.56 
 
 		 212 aa  52.4  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3437  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.94 
 
 		 248 aa  52.4  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.39912  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2987  LuxR family two component transcriptional regulator  40.3 
 
 		 231 aa  51.6  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4984  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.45 
 
 		 201 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0145131 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2528  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.45 
 
 		 201 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0341229 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4032  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.91 
 
 		 1036 aa  52  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.661545 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4491  two component LuxR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 233 aa  51.6  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.697305 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0667  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.97 
 
 		 1036 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1860  two component LuxR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 235 aa  51.2  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0301  two component LuxR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 231 aa  50.8  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.54347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2943  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.55 
 
 		 201 aa  50.4  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3643  LuxR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 239 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00106494  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4724  LuxR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 239 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000522863  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5576  LuxR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 239 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000012464  normal  0.015154 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1919  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 		 862 aa  50.4  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.592004  normal  0.385421 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1673  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.55 
 
 		 201 aa  50.4  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.619826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4581  LuxR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 239 aa  50.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000141763  hitchhiker  0.0000089809 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1157  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 248 aa  50.1  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3764  response regulator receiver  36.99 
 
 		 217 aa  50.1  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.321181  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1520  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.32 
 
 		 777 aa  49.7  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4116  LuxR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 239 aa  49.7  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0201758  hitchhiker  0.00877352 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3606  regulatory protein, LuxR  27.48 
 
 		 229 aa  49.7  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.527821  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2437  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.31 
 
 		 218 aa  49.7  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5726  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 228 aa  49.3  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.451347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5323  transcriptional regulator two component heavy metal regulatory response ZniR  32.46 
 
 		 206 aa  49.7  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.844748 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1632  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 232 aa  49.3  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5557  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.46 
 
 		 223 aa  49.3  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.496641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4627  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.62 
 
 		 226 aa  49.3  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1052  LuxR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 239 aa  49.3  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000445716  normal  0.182523 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1406  DNA-binding response regulator  42.37 
 
 		 215 aa  48.5  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.253896  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 		 986 aa  48.5  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0721424  decreased coverage  0.00000190438 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3971  LuxR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 239 aa  48.1  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000126265  normal  0.0321799 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3576  two component LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 228 aa  48.5  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3711  LuxR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 637 aa  48.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.731459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4214  two component LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 228 aa  48.5  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0601429  normal  0.0532868 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46850  putative transcriptional regulator  23.26 
 
 		 230 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000531033 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3835  two component LuxR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 217 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.760782  normal  0.0940778 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1812  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.14 
 
 		 231 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4037  putative transcriptional regulator  23.72 
 
 		 230 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.586307  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01871  two-component response regulator  38.46 
 
 		 242 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0819  LuxR family two component transcriptional regulator  38.36 
 
 		 227 aa  47.4  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.633548  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1838  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.14 
 
 		 231 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3275  response regulator FixJ  44.44 
 
 		 205 aa  47  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0591  two component LuxR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 301 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477799  hitchhiker  0.00469436 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2955  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.94 
 
 		 231 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.800941 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2604  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 1254 aa  47.4  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.545668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3824  response regulator receiver  44.64 
 
 		 228 aa  47.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2136  two component LuxR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 240 aa  47.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0154869 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1238  competence protein A, putative  40.91 
 
 		 219 aa  47  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00092764  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1035  two-component response regulator  40.91 
 
 		 219 aa  47  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00258137  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4126  transcriptional regulator, LuxR family  40.32 
 
 		 210 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353041 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3002  LuxR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 210 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000242381  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0859  two component LuxR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 210 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.883984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02441  two-component response regulator  35.06 
 
 		 242 aa  46.2  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.72299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0029  two component LuxR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 214 aa  46.2  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.317943  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0822  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.85 
 
 		 223 aa  46.2  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.628591  normal  0.692285 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1537  two component LuxR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 242 aa  46.2  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3585  two component LuxR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 306 aa  46.2  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.295986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1737  regulatory protein LuxR  27.01 
 
 		 231 aa  46.2  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117285  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3175  LuxR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 148 aa  45.8  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3105  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.32 
 
 		 223 aa  45.8  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0962  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 304 aa  45.8  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.512477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3153  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.82 
 
 		 224 aa  45.8  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4648  two component LuxR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 219 aa  45.8  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2977  response regulator receiver protein  40.79 
 
 		 208 aa  45.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.286368 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3229  LuxR family DNA-binding response regulator  37.1 
 
 		 229 aa  45.4  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6109  two component LuxR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 210 aa  45.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0400  two component LuxR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 202 aa  44.7  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1382  two component LuxR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 232 aa  45.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3499  transcriptional regulator LuxR family  24.14 
 
 		 312 aa  45.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1714  two component LuxR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 213 aa  45.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.975164  hitchhiker  0.000785935 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0562  two component LuxR family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 297 aa  45.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2290  two component LuxR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 215 aa  45.4  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2744  two component LuxR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 201 aa  45.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1221  LuxR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 910 aa  45.4  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1782  two component LuxR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 214 aa  45.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000360675 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0679  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 213 aa  45.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0922  two component LuxR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 210 aa  45.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.114328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3094  putative PAS/PAC sensor protein  27.78 
 
 		 519 aa  45.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01981  two-component response regulator  42.37 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.125891  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1744  response regulator receiver protein  38.27 
 
 		 213 aa  45.4  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.933486  normal  0.721753 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4226  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.24 
 
 		 210 aa  45.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>