More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3153 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3153  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 224 aa  439  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2943  two component LuxR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 215 aa  117  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3120  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.43 
 
 		 218 aa  109  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.954631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0074  response regulator receiver protein  38.73 
 
 		 207 aa  106  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0279  response regulator receiver protein  38.07 
 
 		 216 aa  106  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6596  two component LuxR family transcriptional regulator  39.65 
 
 		 249 aa  105  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0827  response regulator receiver protein  35.96 
 
 		 217 aa  105  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7055  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.79 
 
 		 219 aa  105  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3509  two component LuxR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 239 aa  104  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4516  two component LuxR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 214 aa  102  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0463384  normal  0.0270495 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0163  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.15 
 
 		 213 aa  101  8e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.107009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1216  two component LuxR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 215 aa  101  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1230  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.11 
 
 		 215 aa  101  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2832  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.5 
 
 		 210 aa  101  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.988429  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4304  response regulator receiver  36.15 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.894661  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0175  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.11 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0648  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.5 
 
 		 215 aa  99.4  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3541  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.84 
 
 		 211 aa  99.4  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.485125  normal  0.513005 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5018  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.41 
 
 		 209 aa  99  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0717  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.82 
 
 		 209 aa  98.2  9e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.854815  normal  0.189113 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4108  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.2 
 
 		 210 aa  97.8  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.755468  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1881  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.78 
 
 		 218 aa  97.4  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0160211  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1966  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.78 
 
 		 218 aa  97.4  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0029  two component LuxR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 214 aa  98.2  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.317943  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7117  two component LuxR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 214 aa  97.1  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0730  two component LuxR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 214 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.47186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0901  two component LuxR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 235 aa  96.7  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2782  two component LuxR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 214 aa  96.7  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.834695  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1997  two component LuxR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 218 aa  96.3  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0354  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.23 
 
 		 222 aa  96.3  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0228  LuxR family two component transcriptional regulator  30.43 
 
 		 206 aa  95.9  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6314  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.33 
 
 		 216 aa  95.9  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4951  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.67 
 
 		 210 aa  95.5  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.710213  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4132  response regulator receiver  36.74 
 
 		 235 aa  95.5  6e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.232221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6057  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.02 
 
 		 217 aa  95.1  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2486  two component LuxR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 208 aa  95.1  8e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0324  response regulator receiver protein  36.41 
 
 		 268 aa  94.7  9e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3862  two component LuxR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 210 aa  94.7  9e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.734244  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1293  LuxR family DNA-binding response regulator  31.6 
 
 		 216 aa  94.4  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1810  two component LuxR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 218 aa  94.7  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0881  two component LuxR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 210 aa  94.4  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464883  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4248  two component LuxR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 215 aa  94.7  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.206342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3774  two component LuxR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 215 aa  94.7  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2836  two component LuxR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 207 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.644859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4119  response regulator receiver  31.67 
 
 		 230 aa  94  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1652  two component LuxR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 215 aa  94  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.187578  normal  0.308689 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1824  response regulator  29.33 
 
 		 229 aa  93.6  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.152948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5903  two component LuxR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 215 aa  93.6  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.68975  normal  0.398777 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0105  two component LuxR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 215 aa  94  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0303042  normal  0.309888 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4365  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 215 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.902614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5989  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 215 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1103  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.78 
 
 		 216 aa  94  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0032  two component LuxR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 210 aa  93.6  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.245451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0905  putative nitrate/nitrite DNA-binding response regulator  29.33 
 
 		 206 aa  94  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0826046  hitchhiker  0.00000533581 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3579  two component LuxR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 217 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.393396  normal  0.0540104 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1971  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.37 
 
 		 216 aa  93.2  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4002  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 215 aa  93.2  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 212 aa  92.8  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0306  two component LuxR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 215 aa  93.2  3e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000161342  hitchhiker  0.00000159266 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0682  LuxR family DNA-binding response regulator  30.77 
 
 		 215 aa  92.4  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.874366  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1336  two component LuxR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 208 aa  92.4  5e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3764  response regulator receiver  33.33 
 
 		 217 aa  92.4  5e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.321181  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3042  two component LuxR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 222 aa  92  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.280021 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2571  transmission activator LetA  30.39 
 
 		 219 aa  92  6e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1936  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 205 aa  92  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4256  two component LuxR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 215 aa  92  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39510  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  34.91 
 
 		 216 aa  92  7e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.657091 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2699  transmission activator LetA  30.39 
 
 		 219 aa  92  7e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5584  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.21 
 
 		 215 aa  91.7  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2455  response regulator  28.85 
 
 		 214 aa  91.7  8e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.140183  normal  0.431169 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3486  hypothetical protein  33.49 
 
 		 206 aa  91.7  9e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0277  response regulator receiver protein  33.66 
 
 		 214 aa  91.7  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1595  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 209 aa  91.7  9e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00167261 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17330  Two-component response regulator, LuxR family  31.9 
 
 		 211 aa  91.3  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5446  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.08 
 
 		 218 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.26634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1809  two component LuxR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 210 aa  90.9  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6196  two component LuxR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 215 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.280791  normal  0.522243 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1850  two component LuxR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 216 aa  90.9  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37860  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  34.4 
 
 		 221 aa  90.9  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1953  response regulator  28.71 
 
 		 214 aa  91.3  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00404481  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2216  two component LuxR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 211 aa  90.1  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00683516  normal  0.0356101 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1137  two component LuxR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 214 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0097  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.67 
 
 		 209 aa  90.1  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142871  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1229  response regulator receiver protein  32.7 
 
 		 212 aa  90.9  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643884  hitchhiker  0.00799583 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0700  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.11 
 
 		 218 aa  90.9  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00980919  normal  0.316207 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0922  two component LuxR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 210 aa  90.5  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.114328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0116  two component LuxR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 209 aa  89.7  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1436  response regulator  28.57 
 
 		 214 aa  90.1  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.794512  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5717  two component LuxR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 220 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.873964  hitchhiker  0.00405289 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4976  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.12 
 
 		 218 aa  90.1  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.289575  normal  0.034027 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2582  LuxR response regulator receiver  35.55 
 
 		 233 aa  89.4  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2158  two component LuxR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 210 aa  89.4  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0301144 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5387  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.75 
 
 		 215 aa  89.4  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5202  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.64 
 
 		 225 aa  89.4  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677169  normal  0.920773 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1558  response regulator receiver  29.52 
 
 		 221 aa  89.4  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2132  two component LuxR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 214 aa  89.7  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0449794  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2579  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.74 
 
 		 213 aa  89.4  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0500394 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0876  two component LuxR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 233 aa  89.4  4e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.481499  normal  0.345787 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.71 
 
 		 210 aa  89.4  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.612124 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6525  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.27 
 
 		 216 aa  89.4  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>