207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001015 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001015  transcriptional regulator LuxR family  100 
 
 		 184 aa  388  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07094  histidine kinase  90.22 
 
 		 239 aa  353  6.999999999999999e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0164  LuxR family transcriptional regulator  63.93 
 
 		 246 aa  241  3.9999999999999997e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0153554  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1595  LuxR family transcriptional regulator  42.78 
 
 		 254 aa  147  8e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0092  LuxR family transcriptional regulator  42.78 
 
 		 267 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1512  LuxR family transcriptional regulator  42.78 
 
 		 252 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.150572  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1275  transcription regulator LuxR family protein  42.78 
 
 		 268 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.41093  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1621  LuxR family transcriptional regulator  40.33 
 
 		 270 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1927  hypothetical protein  28.92 
 
 		 223 aa  64.3  0.0000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2098  hypothetical protein  41.67 
 
 		 154 aa  63.5  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0852  transcriptional regulator, LuxR family  26.01 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1455  LuxR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 197 aa  52.8  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.231735  normal  0.641899 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1854  LuxR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 310 aa  51.6  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1804  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.98 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.023063  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1104  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.61 
 
 		 215 aa  49.3  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2659  putative PAS/PAC sensor protein  31.53 
 
 		 184 aa  49.3  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.610305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17930  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  39.68 
 
 		 258 aa  49.3  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.265474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3128  LuxR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 181 aa  48.9  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3263  transcriptional regulator, LuxR family  37.33 
 
 		 188 aa  48.9  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19467  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3192  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 212 aa  48.9  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.513085  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3282  LuxR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 202 aa  48.5  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0648  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.44 
 
 		 215 aa  48.1  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2686  LuxR family regulatory protein  32.89 
 
 		 203 aa  47.8  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1761  transcriptional regulator, LuxR family  35.71 
 
 		 181 aa  47.8  0.00009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247672  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1960  LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 181 aa  47.8  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2463  LuxR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 423 aa  47.4  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4267  LuxR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 180 aa  47.4  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130529  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1569  putative transcription regulator protein  36.71 
 
 		 181 aa  46.6  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2445  two component LuxR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2636  LuxR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1984  transcriptional regulator, LuxR family  36.71 
 
 		 181 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1904  LuxR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 184 aa  46.6  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.490701 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1654  transcriptional regulator, LuxR family  36.71 
 
 		 181 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00914552  normal  0.0273292 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2603  two component LuxR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1406  DNA-binding response regulator  32.08 
 
 		 215 aa  46.2  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.253896  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3193  LuxR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 895 aa  45.4  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0620  response regulator receiver protein  43.1 
 
 		 843 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184079 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1584  regulatory protein, LuxR  36.23 
 
 		 916 aa  45.8  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1779  response regulator receiver protein  37.21 
 
 		 208 aa  45.8  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.264941  hitchhiker  0.00228897 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10344  transcriptional regulator  41.54 
 
 		 832 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4976  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.67 
 
 		 218 aa  45.1  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.289575  normal  0.034027 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1374  LuxR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 267 aa  45.1  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4275  two component LuxR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 226 aa  44.3  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.798613  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3835  two component LuxR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 217 aa  43.9  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.760782  normal  0.0940778 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0907  two component LuxR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.285724  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2041  response regulator receiver protein  34.88 
 
 		 214 aa  44.3  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212509  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1298  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.1 
 
 		 228 aa  43.9  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.70055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1665  two component LuxR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 307 aa  43.9  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0245  response regulator receiver protein  36.76 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5726  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.29 
 
 		 228 aa  43.9  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.451347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1032  LuxR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 201 aa  43.9  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4290  two component LuxR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 218 aa  44.3  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0443  LuxR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 845 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2290  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 215 aa  44.3  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2816  transcriptional regulator, LuxR family  42.37 
 
 		 471 aa  44.3  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.138304  hitchhiker  0.00338242 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0123  transcriptional regulator, LuxR family  39.62 
 
 		 492 aa  43.9  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.891774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6781  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.9 
 
 		 232 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.516576 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7117  two component LuxR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 214 aa  43.9  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3769  transcriptional regulator, LuxR family  30.88 
 
 		 205 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0158689  normal  0.601222 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3163  two component LuxR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 203 aa  43.9  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.932633  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0453  LuxR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 845 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00902802  normal  0.164527 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0277  response regulator receiver protein  43.4 
 
 		 833 aa  43.9  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0164  response regulator receiver protein  30.23 
 
 		 128 aa  43.9  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0430  LuxR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 845 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.32699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0083  two component LuxR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 210 aa  43.9  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0581  two component LuxR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 210 aa  43.9  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2567  response regulator receiver protein  36.76 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1563  DNA-binding response regulator  37.93 
 
 		 210 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000942452  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3849  DNA-binding response regulator  37.93 
 
 		 210 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000308683  hitchhiker  0.000000000350245 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1348  DNA-binding response regulator  37.93 
 
 		 210 aa  43.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000440829  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1322  response regulator  37.93 
 
 		 210 aa  43.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.30192e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1321  response regulator  37.93 
 
 		 210 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000332221  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1363  two component LuxR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 210 aa  43.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0039551  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0998  response regulator  32.18 
 
 		 214 aa  43.1  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3108  LuxR response regulator receiver  35.37 
 
 		 202 aa  43.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0467  two component LuxR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 200 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1457  DNA-binding response regulator  37.93 
 
 		 210 aa  43.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000538049  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0423  transcriptional regulator, LuxR family  24.7 
 
 		 221 aa  43.5  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0451  response regulator receiver protein  35.82 
 
 		 200 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1601  DNA-binding response regulator  37.93 
 
 		 210 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000136266  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1626  two component LuxR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.947018 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3273  LuxR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 185 aa  43.5  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0478  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.93 
 
 		 200 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3153  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.63 
 
 		 224 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1531  DNA-binding response regulator  37.93 
 
 		 210 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.64189e-24 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2452  response regulator receiver protein  33.85 
 
 		 151 aa  43.5  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.843497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1519  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 198 aa  43.1  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3862  response regulator receiver protein  30.53 
 
 		 200 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3560  transcriptional regulator, LuxR family  38.6 
 
 		 893 aa  42.7  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1442  LuxR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 181 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4609  LuxR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 181 aa  42.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0187636  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0559  transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 788 aa  42.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3348  transcriptional regulator, LuxR family  40.68 
 
 		 238 aa  43.1  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2674  two component LuxR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 208 aa  42.7  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1152  LuxR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 181 aa  42.7  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0876  two component LuxR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 233 aa  42.4  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.481499  normal  0.345787 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0982  LuxR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 228 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1390  two component LuxR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 225 aa  42.7  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3722  regulatory protein LuxR  32.53 
 
 		 129 aa  42.4  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4527  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.85 
 
 		 223 aa  42.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.658241 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>