More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1104 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1104  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 215 aa  430  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1293  LuxR family DNA-binding response regulator  32.26 
 
 		 216 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1103  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.49 
 
 		 216 aa  116  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1205  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.16 
 
 		 212 aa  112  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0467  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.72 
 
 		 216 aa  111  7.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000507383 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0451  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.94 
 
 		 216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1997  two component LuxR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1954  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.02 
 
 		 220 aa  109  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.228638  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3186  two component LuxR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 215 aa  109  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0678517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1743  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.38 
 
 		 214 aa  108  6e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370009  normal  0.039988 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1026  response regulator protein  33.49 
 
 		 217 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1881  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.09 
 
 		 218 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0160211  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 221 aa  106  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.273145  hitchhiker  0.00000136124 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1966  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.09 
 
 		 218 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6032  response regulator receiver protein  34.58 
 
 		 218 aa  106  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4976  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.58 
 
 		 218 aa  105  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.289575  normal  0.034027 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1230  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.73 
 
 		 215 aa  105  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0829  two component LuxR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 219 aa  105  7e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121621 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3163  two component LuxR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 203 aa  104  8e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.932633  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1943  two component LuxR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 214 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1810  two component LuxR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2246  two component LuxR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0703025  hitchhiker  0.00413313 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0154  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.18 
 
 		 244 aa  103  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.38 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.612124 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0029  two component LuxR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 214 aa  102  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.317943  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4664  two component LuxR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 219 aa  102  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5079  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.27 
 
 		 217 aa  102  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.525358 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1873  response regulator receiver protein  31.1 
 
 		 215 aa  102  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.56104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0977  two component LuxR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 223 aa  102  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00800748  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2299  two component LuxR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 221 aa  102  6e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1667  two component LuxR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 219 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.869411 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1846  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.86 
 
 		 212 aa  101  8e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.349565  normal  0.2019 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0983  two component LuxR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 213 aa  101  8e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0682  LuxR family DNA-binding response regulator  31.34 
 
 		 215 aa  101  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.874366  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3372  two component LuxR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 212 aa  100  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383896 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0590  two component LuxR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 215 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0603  two component LuxR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 215 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0581  two component LuxR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 215 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2782  two component LuxR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.834695  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1782  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 214 aa  99.4  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000360675 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2343  two component LuxR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 211 aa  99.4  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.999882  normal  0.0841394 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5202  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.05 
 
 		 225 aa  99  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677169  normal  0.920773 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2780  two component LuxR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 226 aa  99  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3615  two component LuxR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 219 aa  99  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.378192  normal  0.274637 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3390  LuxR family two component transcriptional regulator  33.96 
 
 		 228 aa  99  5e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.269937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.77 
 
 		 217 aa  98.6  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3919  two component LuxR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 210 aa  98.6  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3833  putative DNA-binding response regulator EsrB  32.37 
 
 		 210 aa  98.6  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3229  LuxR family DNA-binding response regulator  28.77 
 
 		 229 aa  98.6  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3945  putative DNA-binding response regulator EsrB  32.37 
 
 		 210 aa  98.2  7e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0480381  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2126  LuxR family DNA-binding response regulator  30.88 
 
 		 219 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118459  normal  0.107719 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0292  response regulator transcription regulator protein  31.43 
 
 		 210 aa  97.8  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0342  LuxR family DNA-binding response regulator  30.73 
 
 		 213 aa  97.8  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0601944  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3299  LuxR response regulator receiver  30.37 
 
 		 220 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0158345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3957  two component LuxR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 219 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1385  two component LuxR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 212 aa  97.4  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0358  LuxR family DNA-binding response regulator  30.73 
 
 		 213 aa  97.8  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.363  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2941  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.9 
 
 		 219 aa  97.8  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.911135  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1121  two component LuxR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 222 aa  97.8  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.864132  normal  0.872256 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5717  two component LuxR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 220 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.873964  hitchhiker  0.00405289 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5322  two component LuxR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 220 aa  97.1  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.929677 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3030  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  96.7  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1691  two component LuxR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 208 aa  96.7  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0637899 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0385  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.88 
 
 		 224 aa  97.1  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0894  two component LuxR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 217 aa  96.7  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0153  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.95 
 
 		 210 aa  96.7  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1134  two component LuxR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 213 aa  96.3  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2093  two component LuxR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 206 aa  96.3  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000328625  normal  0.180863 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4527  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.75 
 
 		 223 aa  96.7  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.658241 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4628  two component LuxR family transcriptional regulator  28.84 
 
 		 219 aa  96.3  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3475  response regulator receiver  31.88 
 
 		 228 aa  95.9  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.849127  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4290  two component LuxR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 218 aa  95.9  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3992  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.63 
 
 		 214 aa  95.5  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82671  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1643  two component LuxR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 219 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.118638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5813  two component LuxR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 215 aa  95.5  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.118405 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1317  response regulator  29.68 
 
 		 220 aa  95.5  5e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.500574  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0145  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.95 
 
 		 210 aa  95.5  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7047  two component LuxR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 215 aa  95.5  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.976007 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1194  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.3 
 
 		 217 aa  95.5  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 221 aa  95.1  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000210563  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3078  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.95 
 
 		 210 aa  95.1  8e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0580  transcriptional regulator FimZ  29.95 
 
 		 210 aa  94.7  8e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0636  transcriptional regulator FimZ  29.95 
 
 		 210 aa  95.1  8e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.931873  normal  0.250092 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0577  transcriptional regulator FimZ  29.95 
 
 		 210 aa  95.1  8e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00485  predicted DNA-binding transcriptional regulator  29.95 
 
 		 210 aa  94.7  9e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0610  transcriptional regulator FimZ  29.95 
 
 		 210 aa  94.7  9e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2463  response regulator receiver  29.17 
 
 		 217 aa  94.7  9e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2415  two component LuxR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 217 aa  94.7  9e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3087  transcriptional regulator FimZ  29.95 
 
 		 210 aa  94.7  9e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00490  hypothetical protein  29.95 
 
 		 210 aa  94.7  9e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1981  transcriptional regulatory protein DegU, putative  29.72 
 
 		 218 aa  94.4  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1971  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.19 
 
 		 216 aa  94.4  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4618  LuxR response regulator receiver  30.24 
 
 		 209 aa  94  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.601025 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3406  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.54 
 
 		 214 aa  94.4  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.588591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3042  two component LuxR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 222 aa  94  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.280021 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0560  DNA-binding response regulator, LuxR family  30.24 
 
 		 209 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5126  two component LuxR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 209 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.135043  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2227  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.73 
 
 		 217 aa  94  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.632961  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0595  transcriptional regulator FimZ  29.61 
 
 		 210 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.447967  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0598  transcriptional regulator FimZ  29.61 
 
 		 210 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.110504 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>