66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3722 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3722  regulatory protein LuxR  100 
 
 		 129 aa  259  8e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3799  regulatory protein LuxR  74.32 
 
 		 118 aa  115  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.963062  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2296  regulatory protein LuxR  62.16 
 
 		 183 aa  95.1  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0796  two component LuxR family transcriptional regulator  64.79 
 
 		 237 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.203345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3361  two component LuxR family transcriptional regulator  61.11 
 
 		 227 aa  86.7  9e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.295921  normal  0.602395 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3350  two component LuxR family transcriptional regulator  61.11 
 
 		 227 aa  86.7  9e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3412  two component LuxR family transcriptional regulator  61.11 
 
 		 227 aa  86.7  9e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.386741  normal  0.724713 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1515  two component LuxR family transcriptional regulator  54.12 
 
 		 226 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.217252  normal  0.561085 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4904  two component LuxR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 226 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.270853  normal  0.719209 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1881  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.94 
 
 		 260 aa  81.3  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5967  response regulator receiver protein  50 
 
 		 113 aa  80.1  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.790156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3939  two component LuxR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.203044  normal  0.164365 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3724  response regulator receiver  40.91 
 
 		 231 aa  52.8  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2136  two component LuxR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 240 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0154869 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1680  two component LuxR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 229 aa  47  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128873  normal  0.734397 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0480  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.26 
 
 		 214 aa  47  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0671  putative response regulator  33.61 
 
 		 248 aa  46.6  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.248332  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3488  response regulator receiver  36.17 
 
 		 229 aa  46.2  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.920048  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0607  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.43 
 
 		 216 aa  46.2  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2037  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 225 aa  45.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2216  two component LuxR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 211 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00683516  normal  0.0356101 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1316  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.74 
 
 		 210 aa  45.1  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6963  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.43 
 
 		 225 aa  44.7  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.029709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5436  transcriptional regulator, LuxR family  43.1 
 
 		 959 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800009 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4115  response regulator receiver protein  42.03 
 
 		 216 aa  43.9  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.071707  normal  0.0608108 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3811  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 206 aa  43.5  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252848 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0648  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.11 
 
 		 215 aa  43.5  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1090  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.46 
 
 		 224 aa  43.5  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00274111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8412  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.08 
 
 		 239 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2469  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.23 
 
 		 214 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001015  transcriptional regulator LuxR family  32.53 
 
 		 184 aa  42.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1160  two component LuxR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 210 aa  41.6  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1714  two component LuxR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 213 aa  42  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.975164  hitchhiker  0.000785935 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1495  DNA-binding response regulator  32.63 
 
 		 210 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000174821  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2289  regulatory protein LuxR  42.59 
 
 		 151 aa  42  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301716 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 219 aa  41.2  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2711  transcriptional regulator NarP  30.69 
 
 		 210 aa  41.6  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.281479  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2503  DNA-binding transcriptional activator SdiA  31.96 
 
 		 240 aa  41.6  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000339648  normal  0.514976 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2406  transcriptional regulator NarP  36.36 
 
 		 210 aa  41.6  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1936  response regulator receiver protein  41.38 
 
 		 205 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07094  histidine kinase  31.33 
 
 		 239 aa  41.6  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34130  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  41.51 
 
 		 853 aa  41.2  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1300  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.32 
 
 		 215 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.145336  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0844  transcriptional regulator, LuxR family  34.12 
 
 		 234 aa  41.2  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2822  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.3 
 
 		 228 aa  40.8  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0415698  normal  0.590713 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1429  two component LuxR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 211 aa  40.8  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.85494 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3639  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.11 
 
 		 215 aa  40.8  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.274763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1646  two component LuxR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 219 aa  40.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01320  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  48.98 
 
 		 261 aa  40.4  0.008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1531  DNA-binding response regulator  32.63 
 
 		 210 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.64189e-24 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3849  DNA-binding response regulator  32.63 
 
 		 210 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000308683  hitchhiker  0.000000000350245 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2601  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.24 
 
 		 234 aa  40.4  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.1212  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1348  DNA-binding response regulator  32.63 
 
 		 210 aa  40.4  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000440829  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4064  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.85 
 
 		 217 aa  40.4  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1601  DNA-binding response regulator  32.63 
 
 		 210 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000136266  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1363  two component LuxR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 210 aa  40.4  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0039551  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4229  two component LuxR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 270 aa  40.4  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.104641 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1457  DNA-binding response regulator  32.63 
 
 		 210 aa  40.4  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000538049  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1321  response regulator  32.63 
 
 		 210 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000332221  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1322  response regulator  32.63 
 
 		 210 aa  40.4  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.30192e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1563  DNA-binding response regulator  32.63 
 
 		 210 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000942452  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0110  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.17 
 
 		 222 aa  40  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1873  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.23 
 
 		 233 aa  40  0.01  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.145213  normal  0.385799 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7377  response regulator receiver protein  42.59 
 
 		 216 aa  40  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.92051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1854  LuxR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 310 aa  40  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4872  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.38 
 
 		 232 aa  40  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.247388  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>