More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2452 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2452  response regulator receiver protein  100 
 
 		 151 aa  298  1e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.843497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0172  response regulator receiver protein  47.5 
 
 		 128 aa  91.3  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3193  LuxR family transcriptional regulator  47.67 
 
 		 895 aa  60.5  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1616  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 		 229 aa  57  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1543  LuxR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 156 aa  57  0.00000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.24149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3324  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.48 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0107044  normal  0.345616 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2609  transcriptional regulator, LuxR family  53.03 
 
 		 562 aa  56.2  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000030036  hitchhiker  0.00837555 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2373  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.75 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2469  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.31 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126163  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0648  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.07 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0377209  hitchhiker  0.00104431 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3277  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 970 aa  55.1  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.737282  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1536  LuxR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 357 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.413488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3998  response regulator receiver protein  31.21 
 
 		 233 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.363745  normal  0.263649 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5343  LuxR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 361 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0342945 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4194  LuxR family GAF modulated transcriptional regulator  48.39 
 
 		 285 aa  55.1  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0104113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1766  two component LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 203 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00488071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5023  transcriptional regulator, LuxR family  43.02 
 
 		 982 aa  53.9  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  52.46 
 
 		 781 aa  53.5  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3423  sensor protein  34.88 
 
 		 496 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.78 
 
 		 225 aa  53.5  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4530  two component LuxR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 241 aa  53.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00470183 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0844  transcriptional regulator, LuxR family  44.26 
 
 		 234 aa  53.1  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0655  two component LuxR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 194 aa  53.1  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1734  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.17 
 
 		 188 aa  52.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0618  transcriptional regulator, LuxR family  43.06 
 
 		 196 aa  52.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6351  two component LuxR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 244 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1228  LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 204 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5165  two component LuxR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 231 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.162111 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2190  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.78 
 
 		 218 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000643495  hitchhiker  0.000215707 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2369  transcriptional regulator, LuxR family  44.78 
 
 		 352 aa  52.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000342435  decreased coverage  0.000116263 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3763  two component LuxR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 221 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0403461 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38740  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  45.59 
 
 		 250 aa  52.4  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8412  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.43 
 
 		 239 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4518  two component LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 236 aa  52  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1390  two component LuxR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 225 aa  52  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4222  ATP-dependent transcription regulator LuxR  36.89 
 
 		 309 aa  52  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.157864 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0925  response regulator receiver protein  41.79 
 
 		 119 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.592282  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2194  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 937 aa  52  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3769  transcriptional regulator, LuxR family  48.44 
 
 		 205 aa  52  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0158689  normal  0.601222 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  42.03 
 
 		 226 aa  51.6  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06950  LuxR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 496 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.490761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4443  transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 91 aa  51.2  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000136242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1030  regulatory protein, LuxR  41.33 
 
 		 225 aa  51.6  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.210652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4823  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.1 
 
 		 214 aa  51.2  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.103693  normal  0.11387 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  39.81 
 
 		 916 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5304  response regulator receiver protein  40 
 
 		 220 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3278  two component LuxR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 214 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0636  LuxR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 496 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2713  two component LuxR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 216 aa  50.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6717  transcriptional regulator, LuxR family  38.1 
 
 		 509 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.440846  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0881  transcriptional regulator, LuxR family  38.1 
 
 		 266 aa  50.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0606  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.21 
 
 		 212 aa  50.8  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0523  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.33 
 
 		 230 aa  50.8  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06340  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  33.02 
 
 		 211 aa  50.4  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2485  transcriptional regulator, LuxR family  47.83 
 
 		 316 aa  50.8  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0091  response regulator receiver protein  41.77 
 
 		 204 aa  50.4  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2387  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.07 
 
 		 207 aa  50.8  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.132486  normal  0.384012 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5409  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.35 
 
 		 223 aa  50.4  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00220575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2829  transcriptional regulator, LuxR family  35.77 
 
 		 865 aa  50.4  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  34.83 
 
 		 227 aa  50.8  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4439  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.06 
 
 		 224 aa  50.4  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0799  response regulator receiver protein  47.46 
 
 		 204 aa  50.8  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403434 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1746  response regulator receiver protein  40.7 
 
 		 217 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59096  normal  0.157721 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3567  ATP-dependent transcription regulator LuxR  41.98 
 
 		 251 aa  50.4  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1626  two component LuxR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 194 aa  50.4  0.000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.947018 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0084  regulatory protein LuxR  34.43 
 
 		 267 aa  50.4  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1059  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.12 
 
 		 221 aa  50.4  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0807  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 		 228 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.218712 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 227 aa  50.4  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1614  two component LuxR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 221 aa  50.4  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3337  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.33 
 
 		 254 aa  50.4  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0952095  normal  0.130531 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5014  two component LuxR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 209 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.103708  normal  0.29037 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.94 
 
 		 211 aa  50.1  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2278  LuxR response regulator receiver  50 
 
 		 217 aa  50.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0287  LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3760  response regulator receiver protein  47.83 
 
 		 245 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358522  normal  0.345814 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0996  ATP-dependent transcription regulator LuxR  45.76 
 
 		 930 aa  50.1  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1523  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  44.29 
 
 		 873 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.96 
 
 		 213 aa  50.1  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5436  LuxR family LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 904 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 220 aa  50.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4872  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.18 
 
 		 232 aa  49.7  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.247388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2943  two component LuxR family transcriptional regulator  52.54 
 
 		 215 aa  49.7  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0163  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.79 
 
 		 213 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.107009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1299  two component LuxR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 273 aa  49.7  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0170327 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2145  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.29 
 
 		 220 aa  49.7  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0196231  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4091  LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 191 aa  50.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0720604  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0454  two component LuxR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 208 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.698939  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3555  response regulator receiver protein  44.78 
 
 		 176 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3291  response regulator receiver domain-containing protein  37.18 
 
 		 592 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2270  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.89 
 
 		 242 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000113212 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2443  LuxR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 497 aa  49.3  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.218456  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6247  transcriptional regulator, LuxR family  50.91 
 
 		 352 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.670073 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2952  transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 207 aa  48.9  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0281323  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1858  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.26 
 
 		 220 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00870294  decreased coverage  0.00000000166193 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4561  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.06 
 
 		 217 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0533  two component LuxR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 219 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.405575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5499  response regulator receiver protein  39.39 
 
 		 213 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00659712  normal  0.108677 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2245  transcriptional regulator, LuxR family  48.21 
 
 		 956 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000425814  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4551  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.55 
 
 		 208 aa  48.9  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000124934  normal  0.0275678 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>