More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4443 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4443  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 91 aa  191  3e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000136242  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3390  LuxR family two component transcriptional regulator  43.55 
 
 		 228 aa  58.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.269937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0590  two component LuxR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 215 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0603  two component LuxR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 215 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0581  two component LuxR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 215 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6032  response regulator receiver protein  45.61 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4823  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.42 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.103693  normal  0.11387 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0844  transcriptional regulator, LuxR family  48.94 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1646  two component LuxR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0409  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.91 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1026  response regulator protein  42.11 
 
 		 217 aa  54.3  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3947  transcriptional regulator, LuxR family  42.31 
 
 		 250 aa  53.9  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.657672  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4528  response regulator receiver  43.28 
 
 		 213 aa  52.4  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2911  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.86 
 
 		 209 aa  51.6  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2635  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.81 
 
 		 217 aa  51.6  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000528497  hitchhiker  0.00476816 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0154  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.11 
 
 		 244 aa  51.6  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2452  response regulator receiver protein  45.45 
 
 		 151 aa  51.2  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.843497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1286  two component LuxR family transcriptional regulator  44 
 
 		 213 aa  51.2  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.172682 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41040  Two-component response regulator, LuxR family  38.33 
 
 		 208 aa  51.2  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.136918  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1104  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.11 
 
 		 215 aa  50.4  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4502  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.92 
 
 		 205 aa  50.4  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2071  LuxR family DNA-binding response regulator  38.46 
 
 		 215 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1463  LuxR family DNA-binding response regulator  38.46 
 
 		 215 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0142  DNA-binding response regulator  40.62 
 
 		 220 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5428  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.35 
 
 		 201 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358603 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2941  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.1 
 
 		 219 aa  49.7  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.911135  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4926  regulatory protein, LuxR  40.32 
 
 		 574 aa  49.7  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1100  LuxR family DNA-binding response regulator  38.46 
 
 		 215 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1379  LuxR family DNA-binding response regulator  38.46 
 
 		 215 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3248  LuxR family DNA-binding response regulator  38.46 
 
 		 215 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.780539  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3133  LuxR family DNA-binding response regulator  38.46 
 
 		 215 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2364  LuxR family DNA-binding response regulator  38.46 
 
 		 215 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2033  LuxR family DNA-binding response regulator  40.35 
 
 		 208 aa  48.9  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0279  response regulator receiver protein  37.7 
 
 		 216 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0287  LuxR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 92 aa  48.9  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2335  LuxR family DNA-binding response regulator  38.46 
 
 		 215 aa  49.7  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0788  two component LuxR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 218 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.3296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2227  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.68 
 
 		 217 aa  49.3  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.632961  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8304  transcriptional regulator, LuxR family  44.07 
 
 		 1084 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3979  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.56 
 
 		 220 aa  48.9  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.487116  normal  0.704163 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4913  regulatory protein, LuxR  40.32 
 
 		 567 aa  49.3  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7761  two component LuxR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 213 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0790  two component LuxR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 214 aa  49.7  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.870503  normal  0.997505 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3992  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.6 
 
 		 214 aa  49.7  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82671  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0187  LuxR response regulator receiver  40.68 
 
 		 220 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0948  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.37 
 
 		 214 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4476  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.07 
 
 		 215 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2396  transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 363 aa  48.5  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000296074  decreased coverage  0.0001884 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2713  two component LuxR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 216 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 221 aa  48.5  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.273145  hitchhiker  0.00000136124 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5079  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.46 
 
 		 217 aa  48.5  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.525358 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3120  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.84 
 
 		 218 aa  48.9  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.954631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3277  transcriptional regulator, LuxR family  46.81 
 
 		 970 aa  48.5  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.737282  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6469  two component LuxR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 213 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.53826 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0385  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.84 
 
 		 224 aa  48.1  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  35.14 
 
 		 799 aa  48.1  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2406  LuxR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2499  two component LuxR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 209 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.449467  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3596  transcriptional regulator, LuxR family  37.93 
 
 		 178 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.445896  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02261  LuxR family regulatory protein  38.6 
 
 		 90 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0250136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3528  transcriptional regulator, LuxR family  37.93 
 
 		 178 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.993919  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1688  LuxR family DNA-binding response regulator  36.62 
 
 		 209 aa  48.1  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000202542  normal  0.0533619 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2402  LuxR family DNA-binding response regulator  36.62 
 
 		 209 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000137953  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2848  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 212 aa  47.8  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0354  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 222 aa  47.8  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0829  two component LuxR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 219 aa  47.8  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121621 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3357  two component LuxR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 238 aa  47.8  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.1255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6781  two component LuxR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 212 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.156502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7525  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.33 
 
 		 210 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.588744  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3186  two component LuxR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 214 aa  47.4  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.10411 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.48 
 
 		 225 aa  47.4  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  41.3 
 
 		 226 aa  47.4  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 781 aa  47.4  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1121  two component LuxR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 222 aa  47.4  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.864132  normal  0.872256 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2943  two component LuxR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 215 aa  47.4  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2526  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 		 219 aa  47  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.413807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1520  LuxR transcriptional regulator  36.84 
 
 		 91 aa  47  0.00009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1630  DNA-binding response regulator  39.06 
 
 		 220 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0322132  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1989  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.68 
 
 		 229 aa  47  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3729  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.34 
 
 		 214 aa  47  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0956  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.28 
 
 		 221 aa  47  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0161  LuxR family DNA-binding response regulator  39.06 
 
 		 220 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0968  two component LuxR family transcriptional regulator  48.89 
 
 		 220 aa  47  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1311  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.62 
 
 		 226 aa  47  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.165019  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1572  two component LuxR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 218 aa  46.6  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.972408 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1062  transcriptional regulator, LuxR family  39.66 
 
 		 234 aa  46.2  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3447  LuxR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 175 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5187  two component LuxR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 214 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4946  two component LuxR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 214 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0203352 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5672  two component LuxR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 214 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685344 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  42.11 
 
 		 1006 aa  46.6  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1734  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.93 
 
 		 188 aa  46.2  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5498  two component LuxR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 214 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509748 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1700  two component LuxR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 213 aa  46.6  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01701  LuxR family regulatory protein  36.84 
 
 		 90 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01515  transcriptional regulator LuxR/uhpA family  41.82 
 
 		 215 aa  47  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.422594  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2369  transcriptional regulator, LuxR family  48.89 
 
 		 352 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000342435  decreased coverage  0.000116263 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0212  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.55 
 
 		 218 aa  46.2  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2881  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.59 
 
 		 212 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3406  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.34 
 
 		 214 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.588591  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>