More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10344 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0443  LuxR family transcriptional regulator  58.9 
 
 		 845 aa  826    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0453  LuxR family transcriptional regulator  58.9 
 
 		 845 aa  826    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00902802  normal  0.164527 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0620  response regulator receiver protein  58.19 
 
 		 843 aa  775    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184079 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0430  LuxR family transcriptional regulator  59.62 
 
 		 845 aa  840    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.32699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0277  response regulator receiver protein  55.9 
 
 		 833 aa  701    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10344  transcriptional regulator  100 
 
 		 832 aa  1628    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36850  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  34.22 
 
 		 836 aa  288  2e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.116502 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0559  transcriptional regulator, LuxR family  34.27 
 
 		 788 aa  261  4e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3086  transcriptional regulator, LuxR family  36.04 
 
 		 695 aa  254  4.0000000000000004e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1635  LuxR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 818 aa  156  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1650  regulatory protein, LuxR  35.29 
 
 		 794 aa  155  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.315022  normal  0.343942 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4437  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.71 
 
 		 218 aa  63.2  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.784745  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  49.28 
 
 		 755 aa  61.6  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0648  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.92 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17030  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  51.67 
 
 		 907 aa  58.9  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.758711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  34.59 
 
 		 916 aa  57.8  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1156  regulatory protein, LuxR  45.76 
 
 		 900 aa  57.8  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0131958 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1403  hypothetical protein  42.62 
 
 		 252 aa  57  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0062  LuxR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 275 aa  57.4  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2089  transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 959 aa  57.4  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.840433 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2710  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.19 
 
 		 226 aa  57  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0104012 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4214  two component LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 228 aa  56.2  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0601429  normal  0.0532868 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3824  response regulator receiver  44.44 
 
 		 228 aa  55.8  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1255  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.77 
 
 		 219 aa  55.5  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.490147  normal  0.40644 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3197  transcriptional regulator, LuxR family  31.07 
 
 		 876 aa  55.5  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0649  LuxR family two component transcriptional regulator  40.79 
 
 		 212 aa  55.1  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.93281  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3154  transcriptional regulator, LuxR family  38.27 
 
 		 1089 aa  54.7  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.639432 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2998  two component LuxR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 228 aa  54.7  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0367  transcriptional regulator, LuxR family  32.94 
 
 		 556 aa  54.3  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 814 aa  53.9  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2245  transcriptional regulator, LuxR family  47.83 
 
 		 956 aa  53.9  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000425814  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3277  transcriptional regulator, LuxR family  40.91 
 
 		 970 aa  53.5  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.737282  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  42.67 
 
 		 983 aa  53.1  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2943  two component LuxR family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 215 aa  53.5  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4062  two component LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 216 aa  53.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1243  transcriptional regulator, LuxR family  41.82 
 
 		 550 aa  52.8  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29900  transcriptional regulator, luxR family  42.5 
 
 		 855 aa  52.8  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.500705 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  54.9 
 
 		 799 aa  52.8  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3116  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.94 
 
 		 215 aa  52.8  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4906  response regulator receiver  48.21 
 
 		 205 aa  52.4  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.275081  normal  0.875639 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1229  response regulator receiver protein  39.47 
 
 		 212 aa  52.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643884  hitchhiker  0.00799583 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0897  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  35.35 
 
 		 933 aa  52.4  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.571021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6085  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.62 
 
 		 217 aa  52.4  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8714  response regulator receiver protein  47.27 
 
 		 936 aa  52.4  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3785  ATPase-like protein  50 
 
 		 937 aa  52.4  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2911  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.3 
 
 		 209 aa  51.6  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  45.76 
 
 		 765 aa  52  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1228  LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 204 aa  52  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4926  regulatory protein, LuxR  48.21 
 
 		 574 aa  52  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0160  response regulator receiver protein  41.27 
 
 		 279 aa  52  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0710  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.45 
 
 		 226 aa  52  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.614335  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6933  two component LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 244 aa  52  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.322421 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  37.14 
 
 		 904 aa  52  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1499  LuxR family two component transcriptional regulator  41.18 
 
 		 209 aa  51.6  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 881 aa  51.6  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4913  regulatory protein, LuxR  48.21 
 
 		 567 aa  51.6  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 881 aa  51.6  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  44.62 
 
 		 919 aa  51.6  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4226  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.47 
 
 		 210 aa  51.6  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 919 aa  51.6  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  44.62 
 
 		 919 aa  51.6  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1757  transcriptional regulator, LuxR family  44.83 
 
 		 993 aa  51.2  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.790916  normal  0.333807 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 876 aa  51.2  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3253  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 213 aa  51.2  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3239  two component LuxR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 274 aa  51.2  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5023  transcriptional regulator, LuxR family  39.68 
 
 		 982 aa  51.2  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1998  transcriptional regulator, LuxR family  49.09 
 
 		 956 aa  50.8  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120259  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2543  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.06 
 
 		 217 aa  50.8  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.473476  normal  0.787864 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  47.06 
 
 		 929 aa  50.8  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3437  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.61 
 
 		 248 aa  50.8  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.39912  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28320  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  37.37 
 
 		 220 aa  50.8  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  39.44 
 
 		 927 aa  50.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  35.14 
 
 		 894 aa  50.8  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4710  transcriptional regulator, LuxR family  49.15 
 
 		 973 aa  50.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0640272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5410  LuxR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 952 aa  50.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3799  LuxR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 952 aa  50.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00558742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2955  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.82 
 
 		 231 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.800941 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2761  regulatory protein, LuxR  41.03 
 
 		 943 aa  50.4  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.208507  hitchhiker  0.00706127 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0898  two component LuxR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 217 aa  50.8  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000112877  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4346  LuxR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 1030 aa  50.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  41.27 
 
 		 910 aa  50.4  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2446  transcriptional regulator, LuxR family  45.16 
 
 		 188 aa  50.8  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0765  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.15 
 
 		 222 aa  50.1  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1719  response regulator receiver  46.3 
 
 		 231 aa  49.7  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760885  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2582  LuxR response regulator receiver  38.16 
 
 		 233 aa  49.7  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0656  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.06 
 
 		 218 aa  50.1  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.214241 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0857  two component LuxR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 211 aa  50.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00237341  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6284  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.76 
 
 		 217 aa  49.7  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3033  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.06 
 
 		 232 aa  49.7  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.666463  hitchhiker  0.000783277 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1769  putative response regulator  45.1 
 
 		 231 aa  50.1  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5213  transcriptional regulator, LuxR family  41.27 
 
 		 867 aa  50.1  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.32 
 
 		 211 aa  50.1  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0922  transcriptional regulator, LuxR family  45.61 
 
 		 378 aa  50.1  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8304  transcriptional regulator, LuxR family  43.06 
 
 		 1084 aa  50.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2601  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.78 
 
 		 234 aa  50.1  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.1212  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1495  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.23 
 
 		 207 aa  49.7  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.194449  normal  0.395611 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5676  transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 953 aa  50.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.228112  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1253  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.62 
 
 		 203 aa  49.3  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  45.28 
 
 		 919 aa  49.3  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4065  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 864 aa  49.3  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.206312  normal  0.538479 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>