More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1635 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1650  regulatory protein, LuxR  86.54 
 
 		 794 aa  1160    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.315022  normal  0.343942 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1635  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 818 aa  1531    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36850  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  40.71 
 
 		 836 aa  201  3.9999999999999996e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.116502 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0430  LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 845 aa  184  6e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.32699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0443  LuxR family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 845 aa  182  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0453  LuxR family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 845 aa  182  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00902802  normal  0.164527 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3086  transcriptional regulator, LuxR family  35.07 
 
 		 695 aa  176  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0620  response regulator receiver protein  36.71 
 
 		 843 aa  172  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184079 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0559  transcriptional regulator, LuxR family  39.02 
 
 		 788 aa  171  5e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0277  response regulator receiver protein  37.67 
 
 		 833 aa  165  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10344  transcriptional regulator  35.83 
 
 		 832 aa  155  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  49.15 
 
 		 910 aa  59.7  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3610  transcriptional regulator, LuxR family  46.43 
 
 		 953 aa  58.9  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  38.6 
 
 		 879 aa  58.2  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  46.43 
 
 		 940 aa  57.8  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  48.33 
 
 		 913 aa  56.6  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3785  ATPase-like protein  45.78 
 
 		 937 aa  55.5  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3602  LuxR response regulator receiver  34.91 
 
 		 206 aa  55.1  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.66617  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1390  two component LuxR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 225 aa  55.1  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4209  LuxR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 266 aa  53.9  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602642  normal  0.235438 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4290  LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 266 aa  53.5  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.397968 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3735  LuxR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 266 aa  52.8  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1272  transcriptional regulator, LuxR family  47.17 
 
 		 967 aa  53.1  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.47802  normal  0.275164 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 881 aa  52.8  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1565  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.03 
 
 		 200 aa  52.8  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 881 aa  52.8  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0920  response regulator receiver protein  47.46 
 
 		 880 aa  52.4  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.563129  normal  0.106306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 876 aa  52.8  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4561  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 217 aa  52.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5143  transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 903 aa  52  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497829  normal  0.980659 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 250 aa  52  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  31.91 
 
 		 913 aa  52  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  46.43 
 
 		 983 aa  52  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0882  LuxR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 253 aa  52  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  38.46 
 
 		 919 aa  52  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1757  transcriptional regulator, LuxR family  41.07 
 
 		 993 aa  51.6  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.790916  normal  0.333807 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4926  regulatory protein, LuxR  42.86 
 
 		 574 aa  51.6  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  44.64 
 
 		 918 aa  51.6  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8714  response regulator receiver protein  41.94 
 
 		 936 aa  51.2  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2579  LuxR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 257 aa  51.2  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.286869  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0324  transcriptional regulator, LuxR family  43.21 
 
 		 938 aa  51.6  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03511  putative transcriptional regulator, LuxR family protein  40.74 
 
 		 103 aa  51.2  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0867403  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1998  transcriptional regulator, LuxR family  40.32 
 
 		 956 aa  51.2  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120259  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2514  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.93 
 
 		 230 aa  51.2  0.00008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.135771  normal  0.887193 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1686  LuxR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 266 aa  50.8  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0181  transcriptional regulator, LuxR family  41.27 
 
 		 600 aa  50.8  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.294561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  43.14 
 
 		 917 aa  50.4  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1743  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.67 
 
 		 214 aa  50.8  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370009  normal  0.039988 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3105  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.37 
 
 		 223 aa  50.4  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  43.4 
 
 		 909 aa  50.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4710  transcriptional regulator, LuxR family  37.86 
 
 		 973 aa  50.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0640272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2518  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.27 
 
 		 225 aa  50.4  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3546  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.06 
 
 		 229 aa  49.7  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000843196  hitchhiker  0.00749158 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1925  two component LuxR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 204 aa  50.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00015523 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4163  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.02 
 
 		 208 aa  49.7  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296115  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2245  transcriptional regulator, LuxR family  58.33 
 
 		 956 aa  50.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000425814  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1253  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 203 aa  49.7  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4518  two component LuxR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 236 aa  50.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  43.14 
 
 		 928 aa  49.7  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2089  transcriptional regulator, LuxR family  44.64 
 
 		 959 aa  50.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.840433 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2928  two component LuxR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 213 aa  50.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4046  LuxR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 266 aa  49.7  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4320  LuxR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 266 aa  49.7  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0265  transcriptional regulator, LuxR family  43.14 
 
 		 946 aa  50.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2822  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 228 aa  50.1  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0415698  normal  0.590713 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4913  regulatory protein, LuxR  42.86 
 
 		 567 aa  50.1  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6883  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.71 
 
 		 213 aa  49.7  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.239531  normal  0.170628 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  48.21 
 
 		 189 aa  50.1  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 894 aa  50.1  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1532  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.11 
 
 		 220 aa  49.7  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0114765  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3201  LuxR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 266 aa  49.7  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  44.64 
 
 		 765 aa  49.3  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5501  LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 242 aa  49.3  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.926313 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1210  ATP-dependent transcription regulator LuxR  40.38 
 
 		 889 aa  49.3  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.603589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 1137 aa  49.3  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0084  two component LuxR family transcriptional regulator  55.81 
 
 		 239 aa  49.3  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0441  two component LuxR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 209 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3585  LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 251 aa  49.3  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.976883  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0648  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.23 
 
 		 215 aa  49.3  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0710  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.06 
 
 		 226 aa  48.9  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.614335  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4782  LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 251 aa  49.3  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.134366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2590  LuxR family transcriptional regulator  32 
 
 		 263 aa  49.3  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.572263  normal  0.168073 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0444  two component LuxR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 209 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.577588 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4503  two component LuxR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 221 aa  49.3  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178457  normal  0.0169691 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0410  LuxR family two component transcriptional regulator  40.85 
 
 		 209 aa  48.9  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5126  two component LuxR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 209 aa  48.9  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.135043  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02050  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  34.25 
 
 		 541 aa  48.9  0.0004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  44 
 
 		 1022 aa  48.9  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3812  transcriptional regulator, LuxR family  36.23 
 
 		 927 aa  48.9  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142204  normal  0.0901624 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4792  two component LuxR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 209 aa  48.9  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.951072 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1848  response regulator  44.23 
 
 		 218 aa  48.9  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0524957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0745  putative two-component response regulator  40.85 
 
 		 210 aa  48.9  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0692  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.95 
 
 		 213 aa  48.9  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5070  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.21 
 
 		 210 aa  48.9  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.744929 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  40.68 
 
 		 927 aa  48.5  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1714  two component LuxR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 213 aa  48.5  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.975164  hitchhiker  0.000785935 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07840  putative two-component response regulator  39.44 
 
 		 210 aa  48.5  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0171986 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3871  regulatory protein, LuxR  36.76 
 
 		 913 aa  48.5  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.760244  normal  0.907756 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4437  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 218 aa  48.5  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.784745  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27950  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  37.5 
 
 		 923 aa  48.5  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.031015 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>