240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1650 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1635  LuxR family transcriptional regulator  85.92 
 
 		 818 aa  1150    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1650  regulatory protein, LuxR  100 
 
 		 794 aa  1497    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.315022  normal  0.343942 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36850  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  37.41 
 
 		 836 aa  198  4.0000000000000005e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.116502 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0430  LuxR family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 845 aa  175  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.32699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0443  LuxR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 845 aa  174  5e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0453  LuxR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 845 aa  174  5e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00902802  normal  0.164527 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0620  response regulator receiver protein  36.57 
 
 		 843 aa  170  8e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184079 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0559  transcriptional regulator, LuxR family  38.37 
 
 		 788 aa  169  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3086  transcriptional regulator, LuxR family  33.75 
 
 		 695 aa  164  7e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0277  response regulator receiver protein  37.15 
 
 		 833 aa  162  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10344  transcriptional regulator  35.01 
 
 		 832 aa  155  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  43.75 
 
 		 910 aa  58.9  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  37.76 
 
 		 879 aa  55.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  48.33 
 
 		 913 aa  55.8  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3610  transcriptional regulator, LuxR family  44.64 
 
 		 953 aa  55.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  44.64 
 
 		 940 aa  55.1  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1272  transcriptional regulator, LuxR family  49.06 
 
 		 967 aa  53.5  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.47802  normal  0.275164 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3785  ATPase-like protein  45.78 
 
 		 937 aa  54.3  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3602  LuxR response regulator receiver  33.96 
 
 		 206 aa  52.4  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.66617  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2579  LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 257 aa  52.4  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.286869  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2928  two component LuxR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 213 aa  52.4  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3735  LuxR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 266 aa  52.4  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4290  LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 266 aa  52.4  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.397968 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1390  two component LuxR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 225 aa  52.4  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3812  transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 		 927 aa  52.8  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142204  normal  0.0901624 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 250 aa  52.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8714  response regulator receiver protein  43.55 
 
 		 936 aa  52.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0181  transcriptional regulator, LuxR family  42.11 
 
 		 600 aa  52  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.294561  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  32.65 
 
 		 913 aa  51.6  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4470  two component LuxR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 232 aa  51.2  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.370568  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0920  response regulator receiver protein  47.46 
 
 		 880 aa  51.2  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.563129  normal  0.106306 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2591  transcriptional regulator, LuxR family  34.07 
 
 		 552 aa  51.2  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000770971 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4710  transcriptional regulator, LuxR family  41.38 
 
 		 973 aa  51.2  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0640272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0882  LuxR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 253 aa  51.2  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6883  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.14 
 
 		 213 aa  50.8  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.239531  normal  0.170628 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  38.46 
 
 		 919 aa  50.8  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1686  LuxR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 266 aa  50.8  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  46.43 
 
 		 983 aa  50.8  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1714  two component LuxR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 213 aa  50.4  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.975164  hitchhiker  0.000785935 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1757  transcriptional regulator, LuxR family  41.07 
 
 		 993 aa  50.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.790916  normal  0.333807 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0648  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 215 aa  49.7  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1998  transcriptional regulator, LuxR family  40.32 
 
 		 956 aa  49.7  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120259  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3105  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.37 
 
 		 223 aa  49.3  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2822  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.08 
 
 		 228 aa  50.1  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0415698  normal  0.590713 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4046  LuxR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 266 aa  49.7  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 881 aa  50.1  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  39.22 
 
 		 995 aa  49.7  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2245  transcriptional regulator, LuxR family  58.33 
 
 		 956 aa  49.7  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000425814  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4320  LuxR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 266 aa  49.7  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4926  regulatory protein, LuxR  41.89 
 
 		 574 aa  49.7  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 881 aa  50.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4561  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 217 aa  50.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1758  transcriptional regulator, LuxR family  32.5 
 
 		 181 aa  50.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5143  transcriptional regulator, LuxR family  43.64 
 
 		 903 aa  49.7  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497829  normal  0.980659 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 876 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4209  LuxR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 266 aa  50.1  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602642  normal  0.235438 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 1137 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2518  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.59 
 
 		 225 aa  50.1  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  43.14 
 
 		 917 aa  48.9  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3201  LuxR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 266 aa  49.3  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 238 aa  48.9  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 918 aa  49.3  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1925  two component LuxR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 204 aa  49.3  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00015523 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03511  putative transcriptional regulator, LuxR family protein  40.74 
 
 		 103 aa  48.9  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0867403  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23170  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  35 
 
 		 474 aa  48.5  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.23412 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5150  two component LuxR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 200 aa  48.5  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4913  regulatory protein, LuxR  42.86 
 
 		 567 aa  48.5  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2514  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.92 
 
 		 230 aa  48.5  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.135771  normal  0.887193 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2729  regulatory protein LuxR  47.27 
 
 		 892 aa  48.5  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.805372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2437  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.23 
 
 		 218 aa  48.1  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1743  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.57 
 
 		 214 aa  48.1  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370009  normal  0.039988 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0324  transcriptional regulator, LuxR family  40.74 
 
 		 938 aa  48.1  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3585  LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 251 aa  47.8  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.976883  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4782  LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 251 aa  47.8  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.134366  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0102  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.37 
 
 		 221 aa  48.1  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0637251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.38 
 
 		 225 aa  48.1  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29900  transcriptional regulator, luxR family  40.51 
 
 		 855 aa  47.8  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.500705 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5501  LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 242 aa  47.8  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.926313 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  44.64 
 
 		 765 aa  47.8  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2925  transcriptional regulator, LuxR family  34.85 
 
 		 517 aa  47.8  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  41.51 
 
 		 909 aa  47.8  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3242  two component LuxR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 213 aa  47.8  0.0009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000371761  hitchhiker  0.000468813 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5482  DNA-binding response regulator  45.61 
 
 		 200 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5200  DNA-binding response regulator  45.61 
 
 		 200 aa  47.4  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5034  DNA-binding response regulator  45.61 
 
 		 200 aa  47.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.617082  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4518  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 236 aa  47  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5597  DNA-binding response regulator  45.61 
 
 		 200 aa  47.4  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1605  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.61 
 
 		 216 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 237 aa  47  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3871  regulatory protein, LuxR  36.76 
 
 		 913 aa  47.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.760244  normal  0.907756 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01320  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  42.19 
 
 		 261 aa  47.8  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  46.43 
 
 		 189 aa  47.4  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2041  transcriptional regulator, LuxR family  39.68 
 
 		 927 aa  47.8  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111867  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0692  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.95 
 
 		 213 aa  47.4  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1580  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.61 
 
 		 216 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  43.94 
 
 		 894 aa  47.4  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5477  DNA-binding response regulator  37.93 
 
 		 200 aa  47  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00156963  hitchhiker  0.00000000000102018 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5531  DNA-binding response regulator  45.61 
 
 		 200 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0160  response regulator receiver protein  35 
 
 		 279 aa  47.4  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8709  ATPase-like protein  42.62 
 
 		 928 aa  47  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>