More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1925 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1925  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 204 aa  395  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00015523 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4503  two component LuxR family transcriptional regulator  76.4 
 
 		 221 aa  261  6e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178457  normal  0.0169691 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6933  two component LuxR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 244 aa  107  9.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.322421 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4062  two component LuxR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 216 aa  107  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1487  two component LuxR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 231 aa  106  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0122618  normal  0.753042 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04820  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  37.17 
 
 		 229 aa  105  5e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.465009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2258  two component LuxR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 224 aa  105  5e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.124896  normal  0.0124728 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0500  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.99 
 
 		 226 aa  103  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3505  LuxR family two component transcriptional regulator  40.36 
 
 		 213 aa  103  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.345096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3524  response regulator receiver protein  41.57 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0390864  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0857  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.85 
 
 		 219 aa  102  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0762303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2449  two component LuxR family transcriptional regulator  41.62 
 
 		 211 aa  102  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2472  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.25 
 
 		 221 aa  102  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0113125  hitchhiker  0.00367669 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4145  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.09 
 
 		 216 aa  102  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0190  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 219 aa  102  4e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.146862  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21600  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  37.56 
 
 		 222 aa  102  5e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.49613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1971  two component LuxR family transcriptional regulator  43.35 
 
 		 216 aa  102  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.356635  normal  0.773651 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4979  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 231 aa  101  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.889239  normal  0.507767 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2737  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.86 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418014  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3253  two component LuxR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 213 aa  99.8  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4738  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.87 
 
 		 233 aa  98.2  6e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2073  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.93 
 
 		 226 aa  97.8  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000764485 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6525  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 		 216 aa  97.1  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26840  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  37.23 
 
 		 239 aa  96.7  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274056  normal  0.228776 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0992  regulatory protein, LuxR  37.43 
 
 		 218 aa  97.1  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.850793  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2003  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.67 
 
 		 219 aa  96.3  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.183245  hitchhiker  0.00373502 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0967  DNA-binding response regulator  35 
 
 		 209 aa  96.3  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.598364  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1796  response regulator receiver  40.21 
 
 		 230 aa  96.3  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22850  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  37.56 
 
 		 239 aa  95.5  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.711047 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2950  LuxR response regulator receiver  36.52 
 
 		 221 aa  95.5  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6085  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.7 
 
 		 217 aa  95.5  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13154  two component system transcriptional regulatory protein DevR  35.96 
 
 		 217 aa  95.1  7e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.91 
 
 		 213 aa  94.7  8e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2717  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.74 
 
 		 223 aa  94.4  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2245  DNA-binding response regulator, LuxR family  34.46 
 
 		 213 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1611  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.78 
 
 		 208 aa  94  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.548364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0767  LuxR response regulator receiver  36.13 
 
 		 221 aa  93.2  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.88397  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2582  LuxR response regulator receiver  34.72 
 
 		 233 aa  94  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3847  two component LuxR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 216 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.118356  decreased coverage  0.00872558 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0973  two component LuxR family transcriptional regulator  40.49 
 
 		 216 aa  92.8  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.255067  normal  0.404517 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0945  response regulator receiver  37.14 
 
 		 216 aa  92.8  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0407172  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0278  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.84 
 
 		 225 aa  93.2  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000789071 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.04 
 
 		 225 aa  92.4  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0676  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.75 
 
 		 215 aa  92.4  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4214  two component LuxR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 228 aa  92.4  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0601429  normal  0.0532868 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1122  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 234 aa  92  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.752968  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1427  two component LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 212 aa  92  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3078  DNA-binding response regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 213 aa  92  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000185138 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3891  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.46 
 
 		 221 aa  91.7  7e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5619  response regulator receiver protein  34.45 
 
 		 226 aa  91.7  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0556461  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1255  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.16 
 
 		 219 aa  91.7  7e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.490147  normal  0.40644 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3262  two component LuxR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 222 aa  91.7  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.764026 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0651  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.71 
 
 		 241 aa  91.3  8e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0480  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.26 
 
 		 214 aa  91.3  8e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0094  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.17 
 
 		 233 aa  91.3  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0277195 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5644  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.71 
 
 		 225 aa  91.3  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3251  response regulator receiver protein  38.42 
 
 		 221 aa  90.9  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0793449  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3028  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.91 
 
 		 225 aa  90.5  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  decreased coverage  0.0000266978 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1743  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.16 
 
 		 214 aa  90.9  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370009  normal  0.039988 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  35.6 
 
 		 226 aa  90.9  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1617  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.34 
 
 		 214 aa  90.9  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321528  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 221 aa  90.9  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.273145  hitchhiker  0.00000136124 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4126  two component LuxR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 220 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1782  two component LuxR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 230 aa  90.9  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025253 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0915  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.48 
 
 		 223 aa  90.9  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1020  response regulator receiver  34.97 
 
 		 218 aa  90.9  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.648692  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2943  two component LuxR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 215 aa  90.9  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4201  two component LuxR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 215 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4937  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.6 
 
 		 224 aa  90.9  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.570807  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4357  two component LuxR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 215 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.171113 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3824  response regulator receiver  36.96 
 
 		 228 aa  90.9  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2079  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.18 
 
 		 212 aa  89.7  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0834  LuxR response regulator receiver  34.04 
 
 		 221 aa  90.1  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0179337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  37.31 
 
 		 227 aa  90.5  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0404  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.7 
 
 		 218 aa  90.1  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0987348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1123  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.58 
 
 		 242 aa  90.5  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4226  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.05 
 
 		 210 aa  90.5  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2087  two component LuxR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 217 aa  90.1  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 220 aa  90.5  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6098  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.88 
 
 		 218 aa  90.5  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00310  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  37.43 
 
 		 213 aa  90.5  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0097  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.57 
 
 		 209 aa  90.1  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142871  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4871  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.59 
 
 		 222 aa  89.7  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.134443  normal  0.31614 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1737  regulatory protein LuxR  33.86 
 
 		 231 aa  90.5  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117285  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0692  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.55 
 
 		 213 aa  89.4  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2087  two component LuxR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 213 aa  89.4  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 219 aa  89.4  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0518  two component LuxR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 225 aa  89.4  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.665179 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2225  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.8 
 
 		 209 aa  89.4  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.52 
 
 		 217 aa  89.4  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4263  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.36 
 
 		 230 aa  89.7  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.455968 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2024  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.43 
 
 		 220 aa  89  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.876474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1910  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.87 
 
 		 218 aa  89  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0928  response regulator receiver protein  35.96 
 
 		 207 aa  89  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4577  response regulator receiver protein  35.42 
 
 		 223 aa  89.4  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172592 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3475  response regulator receiver  37.02 
 
 		 228 aa  89.4  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.849127  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2136  two component LuxR family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 254 aa  89  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0553154  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8800  response regulator receiver protein  34.05 
 
 		 215 aa  88.6  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.752334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4290  two component LuxR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 218 aa  88.2  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5788  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.71 
 
 		 214 aa  88.2  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.785726 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>