More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6098 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6098  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 218 aa  436  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3253  two component LuxR family transcriptional regulator  66.83 
 
 		 213 aa  264  5.999999999999999e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4979  two component LuxR family transcriptional regulator  64.73 
 
 		 231 aa  260  1e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.889239  normal  0.507767 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1487  two component LuxR family transcriptional regulator  64.73 
 
 		 231 aa  257  7e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0122618  normal  0.753042 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3505  LuxR family two component transcriptional regulator  65.83 
 
 		 213 aa  256  3e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.345096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2258  two component LuxR family transcriptional regulator  62.32 
 
 		 224 aa  252  3e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.124896  normal  0.0124728 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2950  LuxR response regulator receiver  65.07 
 
 		 221 aa  251  5.000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4749  two component transcriptional regulator, LuxR family  62.98 
 
 		 223 aa  251  5.000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2449  two component LuxR family transcriptional regulator  62.62 
 
 		 211 aa  251  8.000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4062  two component LuxR family transcriptional regulator  64.73 
 
 		 216 aa  250  1e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6933  two component LuxR family transcriptional regulator  64.73 
 
 		 244 aa  249  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.322421 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0992  regulatory protein, LuxR  61.17 
 
 		 218 aa  247  9e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.850793  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1971  two component LuxR family transcriptional regulator  63.94 
 
 		 216 aa  247  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.356635  normal  0.773651 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4738  two component transcriptional regulator, LuxR family  62.14 
 
 		 233 aa  246  2e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22850  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  60.19 
 
 		 239 aa  245  3e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.711047 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0500  two component transcriptional regulator, LuxR family  63.82 
 
 		 226 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3524  response regulator receiver protein  63.82 
 
 		 214 aa  243  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0390864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1528  two component LuxR family transcriptional regulator  60.87 
 
 		 212 aa  241  5e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.212037  hitchhiker  0.000165031 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0190  two component transcriptional regulator, LuxR family  60.87 
 
 		 219 aa  241  7e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.146862  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0945  response regulator receiver  60.19 
 
 		 216 aa  239  2e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0407172  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1577  response regulator receiver  60.39 
 
 		 212 aa  239  2e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0518  two component LuxR family transcriptional regulator  62.96 
 
 		 225 aa  236  2e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.665179 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0097  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.02 
 
 		 209 aa  233  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142871  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01100  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  56.87 
 
 		 214 aa  228  7e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0094  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.21 
 
 		 233 aa  227  9e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0277195 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2136  two component LuxR family transcriptional regulator  56.31 
 
 		 254 aa  226  3e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0553154  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3097  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.57 
 
 		 222 aa  224  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.472018  normal  0.507317 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1910  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.92 
 
 		 218 aa  223  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3035  LuxR response regulator receiver  60 
 
 		 223 aa  218  5e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4126  two component LuxR family transcriptional regulator  52.61 
 
 		 220 aa  218  5e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2003  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.4 
 
 		 219 aa  218  6e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.183245  hitchhiker  0.00373502 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4201  two component LuxR family transcriptional regulator  52.61 
 
 		 215 aa  218  6e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4357  two component LuxR family transcriptional regulator  52.61 
 
 		 215 aa  218  6e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.171113 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2073  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.63 
 
 		 226 aa  217  1e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000764485 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13154  two component system transcriptional regulatory protein DevR  51.43 
 
 		 217 aa  215  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3847  two component LuxR family transcriptional regulator  53.62 
 
 		 216 aa  214  5e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.118356  decreased coverage  0.00872558 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1427  two component LuxR family transcriptional regulator  51.66 
 
 		 212 aa  213  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1446  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.37 
 
 		 223 aa  206  1e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4145  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.29 
 
 		 216 aa  205  5e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1076  two component LuxR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 228 aa  201  6e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1092  two component LuxR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 228 aa  201  6e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.123414  normal  0.110897 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1103  two component LuxR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 228 aa  201  6e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.191898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2140  response regulator receiver  54.81 
 
 		 218 aa  199  3e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.95288  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2548  two component LuxR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 216 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.971783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4820  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.66 
 
 		 218 aa  185  5e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1611  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.14 
 
 		 208 aa  181  6e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.548364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  43.38 
 
 		 242 aa  177  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 219 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.75 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  41.63 
 
 		 221 aa  164  9e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000210563  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.9 
 
 		 217 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11330  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  42.79 
 
 		 224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0103975 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4080  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.91 
 
 		 241 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.858367 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2290  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.19 
 
 		 208 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00802134  hitchhiker  0.000628596 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5788  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.35 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.785726 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 216 aa  159  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 228 aa  158  7e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1769  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.33 
 
 		 219 aa  158  7e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.221401  normal  0.0578747 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.06 
 
 		 217 aa  157  8e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0647  two component LuxR family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 225 aa  156  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.01 
 
 		 253 aa  156  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.4 
 
 		 236 aa  156  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  41.31 
 
 		 303 aa  155  4e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1659  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.75 
 
 		 207 aa  154  1e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.319135  normal  0.0403017 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 222 aa  154  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3459  two component LuxR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 212 aa  154  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.775478  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  41.55 
 
 		 207 aa  153  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 216 aa  153  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  41.47 
 
 		 234 aa  153  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  41.12 
 
 		 234 aa  152  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3238  regulatory protein LuxR  38.84 
 
 		 228 aa  152  4e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3849  DNA-binding response regulator  40.38 
 
 		 210 aa  152  5e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000308683  hitchhiker  0.000000000350245 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3262  two component LuxR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 222 aa  151  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.764026 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1563  DNA-binding response regulator  40.38 
 
 		 210 aa  151  8e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000942452  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1348  DNA-binding response regulator  40.38 
 
 		 210 aa  151  8e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000440829  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1322  response regulator  40.38 
 
 		 210 aa  151  8e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.30192e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1601  DNA-binding response regulator  40.38 
 
 		 210 aa  151  8e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000136266  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1457  DNA-binding response regulator  40.38 
 
 		 210 aa  151  8e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000538049  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1363  two component LuxR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 210 aa  151  8e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0039551  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1160  two component LuxR family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 210 aa  151  8e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1531  DNA-binding response regulator  40.38 
 
 		 210 aa  150  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.64189e-24 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 219 aa  150  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.31 
 
 		 216 aa  150  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4433  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.69 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0956  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.46 
 
 		 221 aa  150  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 237 aa  149  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 208 aa  150  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1495  DNA-binding response regulator  40.38 
 
 		 210 aa  150  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000174821  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1743  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.05 
 
 		 214 aa  150  2e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370009  normal  0.039988 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1321  response regulator  40.38 
 
 		 210 aa  149  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000332221  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0951  LuxR family two component transcriptional regulator  43.27 
 
 		 221 aa  149  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392411  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1701  response regulator receiver protein  41.62 
 
 		 224 aa  149  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0169479 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.1 
 
 		 213 aa  149  4e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4064  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.6 
 
 		 217 aa  149  4e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7415  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.37 
 
 		 228 aa  148  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1401  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.48 
 
 		 217 aa  148  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2171  two component LuxR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 218 aa  148  5e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0762379  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4485  two component LuxR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 213 aa  149  5e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.310872  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2656  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.9 
 
 		 226 aa  148  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1984  two component LuxR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 220 aa  148  6e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178457  normal  0.123783 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>