More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1032 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1032  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 201 aa  379  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1881  LuxR family transcriptional regulator  85.81 
 
 		 199 aa  209  2e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2446  transcriptional regulator, LuxR family  41.96 
 
 		 188 aa  87.4  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0475  transcriptional regulator, LuxR family  48.33 
 
 		 123 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.282737  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1716  LuxR family transcriptional regulator  51.49 
 
 		 118 aa  85.1  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3765  LuxR family transcriptional regulator  61.9 
 
 		 140 aa  79.7  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.825501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0906  transcriptional regulator, LuxR family  65.08 
 
 		 208 aa  75.9  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000244022  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0902  two component transcriptional regulator, LuxR family  65.08 
 
 		 208 aa  75.9  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.154451  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0857  two component LuxR family transcriptional regulator  65.08 
 
 		 211 aa  74.7  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00237341  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7667  two component LuxR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.89 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3486  hypothetical protein  61.29 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2171  two component transcriptional regulator, LuxR family  62.3 
 
 		 227 aa  73.2  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0280  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.86 
 
 		 245 aa  72  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.417338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0915  two component LuxR family transcriptional regulator  65.57 
 
 		 202 aa  71.2  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.000299753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3229  two component LuxR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4854  putative two component LuxR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 211 aa  71.2  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133138  normal  0.31096 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4091  LuxR family transcriptional regulator  58.73 
 
 		 191 aa  71.2  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0720604  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3072  two component LuxR family transcriptional regulator  47.95 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.875677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1965  two component LuxR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 217 aa  70.5  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0749  transcriptional regulator, LuxR family  54.84 
 
 		 500 aa  69.3  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5633  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.21 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.603295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3760  response regulator receiver protein  55.56 
 
 		 245 aa  69.3  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358522  normal  0.345814 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4199  regulatory protein, LuxR  52.31 
 
 		 855 aa  68.9  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.142655 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0408  two component LuxR family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 214 aa  68.9  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82136  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3231  two component LuxR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.229823  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0250  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.16 
 
 		 260 aa  68.6  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.664516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2689  two component LuxR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 224 aa  68.6  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.270095  normal  0.632538 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1309  two component LuxR family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000148999  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3043  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.09 
 
 		 225 aa  67.8  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652561  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2093  two component LuxR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000328625  normal  0.180863 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4778  two component LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000269792  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0799  response regulator receiver protein  49.18 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403434 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1496  LuxR family transcriptional regulator  43.7 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1106  two component LuxR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 223 aa  67  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.584765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1228  LuxR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.76 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2613  two component LuxR family transcriptional regulator  57.38 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4428  two component LuxR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4258  two component LuxR family transcriptional regulator  53.73 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3716  two component LuxR family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.576881  normal  0.099275 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0926  regulatory protein, LuxR  62.75 
 
 		 878 aa  65.5  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.289088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5475  regulatory protein, LuxR  50 
 
 		 911 aa  65.1  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450601  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1626  two component LuxR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.947018 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4704  DNA-binding response regulator CorR  39.82 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0625  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.12 
 
 		 216 aa  64.7  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.732521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0763  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  60.34 
 
 		 919 aa  64.7  0.0000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.422144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0454  two component LuxR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 208 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.698939  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3278  two component LuxR family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4744  response regulator receiver protein  36.91 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.690137 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38740  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  40.71 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0315  LuxR family DNA-binding response regulator  35.17 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1936  regulatory protein LuxR  50 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.548655  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1633  two component LuxR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2414  two component transcriptional regulator, LuxR family  59.02 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0502  regulatory protein, LuxR  53.23 
 
 		 861 aa  63.9  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0169233  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2014  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.1 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.172206  hitchhiker  0.00394331 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2744  two component LuxR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0555  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  51.52 
 
 		 1006 aa  63.5  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1151  two-component response regulator  47.14 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2455  response regulator VSRC transcription regulator protein  35.11 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2359  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.73 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0990205  decreased coverage  0.00133027 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2742  LuxR response regulator receiver  32.53 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3065  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2848  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.67 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4147  two component LuxR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4082  regulatory protein, LuxR  51.43 
 
 		 888 aa  62.4  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.566011 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2232  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1771  LuxR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.466335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2846  two component LuxR family transcriptional regulator  57.38 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1316  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01871  two-component response regulator  32.05 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.528311  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1848  transcriptional regulator NarL  33.61 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1379  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.01 
 
 		 292 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0210202  hitchhiker  0.00446461 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3176  two component LuxR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 292 aa  62  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0570221  normal  0.472976 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2046  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.35 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3089  two component LuxR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1563  two component LuxR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 257 aa  62.4  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.781509  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 221 aa  62  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000210563  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  53.23 
 
 		 238 aa  62  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2840  LuxR family two component transcriptional regulator  51.56 
 
 		 238 aa  62  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2486  two component LuxR family transcriptional regulator  55.93 
 
 		 208 aa  62  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0661  two component LuxR family transcriptional regulator  55.74 
 
 		 239 aa  61.6  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000223942  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6830  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 270 aa  61.6  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1513  LuxR family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 246 aa  61.6  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2340  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 217 aa  61.6  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.273151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0139  GAF modulated transcriptional regulator, LuxR family  50.82 
 
 		 506 aa  61.6  0.000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2880  two component LuxR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 219 aa  61.6  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.449931 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.43 
 
 		 228 aa  61.6  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  53.23 
 
 		 250 aa  61.6  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3763  two component LuxR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 221 aa  61.6  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0403461 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5380  regulatory protein, LuxR  39.56 
 
 		 315 aa  61.2  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.869493  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  34.64 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  35.17 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0804  two component LuxR family transcriptional regulator  52.46 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0694  two component LuxR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.770061  normal  0.351457 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.76 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5202  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.45 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677169  normal  0.920773 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>