More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2744 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2744  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 201 aa  402  1e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0960  two component LuxR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 214 aa  159  3e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1894  putative response regulator receiver protein  39.51 
 
 		 204 aa  145  6e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.761861  normal  0.0769356 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0828  two component LuxR family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 204 aa  131  7.999999999999999e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00513824  normal  0.360671 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0555  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.45 
 
 		 227 aa  128  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4184  hypothetical protein  37.82 
 
 		 207 aa  126  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.400045  normal  0.380291 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4131  two component LuxR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 220 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1723  two component LuxR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 240 aa  119  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0087  two component transcriptional regulator, LuxR  35.29 
 
 		 210 aa  119  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.197031  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1676  two component LuxR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 210 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.123322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3356  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.11 
 
 		 216 aa  115  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.334369  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3598  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.26 
 
 		 218 aa  111  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329097  normal  0.731815 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4675  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.26 
 
 		 218 aa  111  6e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.760252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2218  two component LuxR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 221 aa  111  8.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0625  two component LuxR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 221 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.793996  hitchhiker  0.00440064 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0980  nitrate/nitrite response regulator transcription regulator protein  35.62 
 
 		 222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02404  transcriptional regulator LuxR/uhpA family  35.78 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1870  two component LuxR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 218 aa  109  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1543  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.66 
 
 		 221 aa  109  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1450  two component LuxR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 224 aa  108  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0465  two component transcriptional regulator  36.14 
 
 		 239 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2570  two component LuxR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 224 aa  108  6e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.282998  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5066  LuxR response regulator receiver  34.58 
 
 		 217 aa  108  7.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.822528  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0694  two component LuxR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 252 aa  108  7.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.770061  normal  0.351457 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0261  two component LuxR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.574059  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1571  XRE family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 227 aa  107  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0290  response regulator receiver protein  34.8 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1545  two component LuxR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 219 aa  107  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.505974  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1932  DNA-binding response regulator  35.35 
 
 		 219 aa  107  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00601791  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3229  two component LuxR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5117  two component LuxR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 253 aa  106  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.180541 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4744  response regulator receiver protein  36.32 
 
 		 209 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.690137 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19700  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.1 
 
 		 209 aa  105  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4179  hypothetical protein  37.13 
 
 		 232 aa  105  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.365276 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1291  two component LuxR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 215 aa  105  5e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2926  two component LuxR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 223 aa  104  7e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.380263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1237  two component LuxR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 216 aa  104  8e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000317123 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0991  two component LuxR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 210 aa  104  9e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1813  two component LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 249 aa  104  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.172477 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2275  LuxR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.314776  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2554  two component LuxR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.958854  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0584  two component response regulator  33.17 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.566414  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17670  LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1284  two component LuxR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.479266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1537  putative two-component response regulator  36.36 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1954  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.58 
 
 		 220 aa  102  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.228638  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0852  two component LuxR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 224 aa  102  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.852842  normal  0.596615 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1588  two component LuxR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 220 aa  102  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0618082  normal  0.0591517 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1965  two component LuxR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 217 aa  102  4e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2039  two component LuxR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 212 aa  102  5e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3372  two component LuxR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 212 aa  101  6e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383896 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3278  two component LuxR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 214 aa  101  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1663  two component LuxR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 220 aa  101  9e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0154836  unclonable  0.0000152825 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1828  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  31.47 
 
 		 216 aa  101  9e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3420  LuxR family DNA-binding response regulator  32.83 
 
 		 216 aa  100  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 212 aa  100  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2613  two component LuxR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0164  two component LuxR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 215 aa  100  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.523755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1669  two component LuxR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 221 aa  100  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2721  two component LuxR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 219 aa  100  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001499 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1574  two component LuxR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.347453 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  34.7 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0836  LuxR family two component transcriptional regulator  33.83 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0588074 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.48 
 
 		 235 aa  99.4  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4737  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.88 
 
 		 241 aa  99.4  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0133592 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0264  two component LuxR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 221 aa  99.4  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0866  two component LuxR family transcriptional regulator  33 
 
 		 220 aa  99.4  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1732  two component LuxR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 220 aa  99.4  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0049943  normal  0.183248 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.48 
 
 		 224 aa  99.4  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2943  two component LuxR family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 215 aa  99.8  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2076  response regulator receiver protein  31.68 
 
 		 238 aa  99.4  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4027  DNA-binding response regulator, LuxR family  35.53 
 
 		 215 aa  99  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1867  two component LuxR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 219 aa  99  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00198288  hitchhiker  0.000309651 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4565  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  99  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1384  LuxR response regulator receiver  35.53 
 
 		 215 aa  98.6  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00310  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  37.31 
 
 		 213 aa  99  5e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4822  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 223 aa  99  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3251  response regulator receiver protein  34.26 
 
 		 221 aa  98.6  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0793449  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1635  LuxR family two component transcriptional regulator  36.36 
 
 		 216 aa  98.6  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2648  LuxR family DNA-binding response regulator  33.17 
 
 		 220 aa  98.2  6e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4082  two component LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 216 aa  98.6  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0273  two component LuxR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 231 aa  98.6  6e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2087  two component LuxR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 217 aa  98.6  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1020  response regulator receiver  35.35 
 
 		 218 aa  98.2  6e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.648692  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1858  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.01 
 
 		 220 aa  98.2  7e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00870294  decreased coverage  0.00000000166193 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0834  LuxR response regulator receiver  32.11 
 
 		 221 aa  98.2  7e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0179337 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2171  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.82 
 
 		 227 aa  98.2  7e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4937  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.26 
 
 		 224 aa  98.2  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.570807  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 232 aa  98.2  7e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.173401  normal  0.808062 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2493  two component LuxR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 220 aa  98.2  8e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2486  two component LuxR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 220 aa  98.2  8e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.637953  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 228 aa  97.8  8e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0190  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.18 
 
 		 215 aa  98.2  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2629  two component LuxR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 232 aa  97.8  9e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.312922  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2305  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  31.19 
 
 		 220 aa  97.8  9e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2606  two component LuxR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 220 aa  97.4  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00642184  hitchhiker  0.00275886 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002211  transcriptional regulator LuxR family  34.69 
 
 		 209 aa  97.4  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 222 aa  97.4  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3975  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.48 
 
 		 221 aa  97.4  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0482097  normal  0.237128 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>