More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1771 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1771  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 228 aa  457  9.999999999999999e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.466335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3760  response regulator receiver protein  37.56 
 
 		 245 aa  112  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358522  normal  0.345814 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3509  transcriptional regulator, LuxR family  35.48 
 
 		 213 aa  93.2  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0217545 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 216 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.46 
 
 		 211 aa  75.1  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1387  DNA-binding response regulator  27.7 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00141106  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0094  two component LuxR family transcriptional regulator  46.6 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1563  DNA-binding response regulator  33.54 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000942452  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2130  DNA-binding response regulator, LuxR family  36.11 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1348  DNA-binding response regulator  33.54 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000440829  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1322  response regulator  33.54 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.30192e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1321  response regulator  33.54 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000332221  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1940  LuxR response regulator receiver  35.14 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.95717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1457  DNA-binding response regulator  33.54 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000538049  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1363  two component LuxR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0039551  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3849  DNA-binding response regulator  33.54 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000308683  hitchhiker  0.000000000350245 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1601  DNA-binding response regulator  33.54 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000136266  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1531  DNA-binding response regulator  38.61 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.64189e-24 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.25 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4258  two component LuxR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1160  two component LuxR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3372  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383896 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1495  DNA-binding response regulator  32.91 
 
 		 210 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000174821  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1767  transcriptional regulator, LuxR family  60.71 
 
 		 248 aa  67  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.426334 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0967  DNA-binding response regulator  50.75 
 
 		 209 aa  67  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.598364  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.96 
 
 		 213 aa  67  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2446  transcriptional regulator, LuxR family  34.47 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1938  two component LuxR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1972  response regulator receiver  30.71 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3231  two component LuxR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.229823  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.88 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2079  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.48 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1240  two component LuxR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 207 aa  65.1  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3676  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.21 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0625047  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3486  hypothetical protein  54.84 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  55.74 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38420  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  49.33 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1316  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.21 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3043  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.69 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652561  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  55.74 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3765  LuxR family transcriptional regulator  53.23 
 
 		 140 aa  63.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.825501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2627  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.16 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  55.74 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  55.74 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2414  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.12 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0661  two component LuxR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000223942  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2367  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.31 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0625  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.21 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.732521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2417  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.31 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16860  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  35.14 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.85724  normal  0.036031 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2014  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.93 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.172206  hitchhiker  0.00394331 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0236  LuxR family two component transcriptional regulator  53.33 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1053  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.05 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.295708  normal  0.0294181 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4554  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.68 
 
 		 245 aa  62.4  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.376132  normal  0.833141 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1422  DNA-binding response regulator VraR  30.94 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.871667  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1032  LuxR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3936  two component LuxR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00507176  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3253  two component LuxR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 213 aa  62  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.23 
 
 		 225 aa  62  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0322  DNA-binding response regulator  37.07 
 
 		 213 aa  62  0.000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  54.1 
 
 		 215 aa  62  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  54.1 
 
 		 215 aa  62  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  54.1 
 
 		 215 aa  62  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  54.1 
 
 		 215 aa  62  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  54.1 
 
 		 215 aa  62  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0211  two component LuxR family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 227 aa  61.6  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.196171  normal  0.645513 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4254  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.94 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.867992  normal  0.287586 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5202  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.23 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677169  normal  0.920773 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1960  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.46 
 
 		 216 aa  61.6  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0164  two component transcriptional regulator, LuxR family  41 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0441129 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3768  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.8 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.28303  normal  0.763501 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0645  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.97 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.691779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1356  regulatory protein, LuxR  35.34 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3643  two component LuxR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.516516  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0454  two component LuxR family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.698939  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1132  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.37 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2842  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.31 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.622781  decreased coverage  0.00305681 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1984  two component LuxR family transcriptional regulator  36 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178457  normal  0.123783 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0228  LuxR family two component transcriptional regulator  50.79 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2109  LuxR family DNA-binding response regulator  52.54 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2048  response regulator  52.54 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.102554  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2046  response regulator  52.54 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4518  two component LuxR family transcriptional regulator  52.46 
 
 		 236 aa  60.5  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2265  LuxR family DNA-binding response regulator  52.54 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.201191  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1815  two component LuxR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.922696  normal  0.34679 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1936  response regulator receiver protein  36.96 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4913  regulatory protein, LuxR  53.03 
 
 		 567 aa  60.5  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3324  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.33 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0107044  normal  0.345616 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2024  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.75 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.876474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  52.46 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6351  two component LuxR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7105  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.78 
 
 		 241 aa  60.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106023  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3262  two component LuxR family transcriptional regulator  36 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.764026 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2290  DNA-binding response regulator, LuxR family  52.54 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000736213 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3072  two component LuxR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.875677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1532  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.21 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0114765  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4926  regulatory protein, LuxR  53.03 
 
 		 574 aa  60.1  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28198  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>