More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_1238 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_1238  competence protein A, putative  100 
 
 		 219 aa  444  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00092764  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1035  two-component response regulator  98.63 
 
 		 219 aa  441  1e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00258137  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0764  response regulator  52.25 
 
 		 219 aa  223  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0758025  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4419  competence protein A  51.85 
 
 		 218 aa  218  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.610555  normal  0.653302 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0697  two component LuxR family transcriptional regulator  48.64 
 
 		 228 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5261  competence protein A  44.09 
 
 		 213 aa  171  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2943  two component LuxR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 215 aa  108  9.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0632  two component LuxR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 224 aa  107  1e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385785  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.78 
 
 		 224 aa  104  8e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0663  LuxR family DNA-binding response regulator  34.78 
 
 		 224 aa  104  1e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0697  LuxR family DNA-binding response regulator  34.78 
 
 		 224 aa  104  1e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 228 aa  104  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_601  DNA-binding response regulator, LuxR family  34.78 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7812  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.77 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_374  DNA-binding response regulator, LuxR family  33.81 
 
 		 232 aa  100  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000120759  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0409  two component LuxR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 232 aa  100  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.135269  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33010  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  31.43 
 
 		 223 aa  99.8  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.163463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  30.7 
 
 		 227 aa  99.4  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 223 aa  99.8  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1198  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.93 
 
 		 225 aa  99.4  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_002936  DET0432  LuxR family DNA-binding response regulator  33.17 
 
 		 232 aa  98.6  6e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00543066  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38420  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  29.73 
 
 		 226 aa  98.2  8e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5644  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.65 
 
 		 225 aa  97.1  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.43 
 
 		 217 aa  96.7  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 216 aa  96.3  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0919  two component LuxR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 214 aa  96.7  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.25 
 
 		 213 aa  96.3  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1109  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.95 
 
 		 218 aa  96.7  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1600  two component LuxR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 207 aa  96.3  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3237  response regulator  30.49 
 
 		 219 aa  96.3  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 222 aa  94.4  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4577  response regulator receiver protein  30.52 
 
 		 223 aa  94.4  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172592 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.24 
 
 		 215 aa  94.4  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.502704  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1909  response regulator receiver protein  28.18 
 
 		 220 aa  94  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.631594  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  31.65 
 
 		 215 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  31.65 
 
 		 215 aa  93.6  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  31.65 
 
 		 215 aa  93.6  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  31.65 
 
 		 215 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  31.65 
 
 		 215 aa  93.6  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19700  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.48 
 
 		 209 aa  93.6  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21900  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  28.83 
 
 		 230 aa  93.6  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00486265  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.68 
 
 		 224 aa  93.6  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3219  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.37 
 
 		 208 aa  94  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2141  response regulator  29.28 
 
 		 214 aa  92.8  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.126922  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02748  response regulator  29.68 
 
 		 214 aa  93.2  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  31.19 
 
 		 215 aa  92.4  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1929  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.07 
 
 		 209 aa  92.8  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142226  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0782  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.73 
 
 		 220 aa  92.8  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 215 aa  92  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2635  response regulator receiver  28.97 
 
 		 207 aa  92.4  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1102  LuxR family DNA-binding response regulator  32.69 
 
 		 214 aa  92  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8793  response regulator receiver protein  30.91 
 
 		 221 aa  92  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0110  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.73 
 
 		 222 aa  92  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0102  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.6 
 
 		 221 aa  91.7  7e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0637251  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3271  response regulator  30.09 
 
 		 214 aa  91.7  8e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0222898  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0683  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.07 
 
 		 234 aa  90.9  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  30.73 
 
 		 215 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3763  two component LuxR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 221 aa  90.9  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0403461 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 222 aa  91.3  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  30.28 
 
 		 215 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2613  two component LuxR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 207 aa  90.5  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1652  two component LuxR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 217 aa  90.1  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.495895  normal  0.106337 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00210  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  29.36 
 
 		 221 aa  90.9  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.133182 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3952  two component LuxR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 222 aa  89.7  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.173353 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.69 
 
 		 217 aa  89.7  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 219 aa  89.7  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26840  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  30.14 
 
 		 239 aa  89.7  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274056  normal  0.228776 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3998  response regulator receiver protein  28.11 
 
 		 233 aa  90.1  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.363745  normal  0.263649 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  30.28 
 
 		 215 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.44 
 
 		 231 aa  89.4  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2822  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.78 
 
 		 231 aa  89.4  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21600  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  31.1 
 
 		 222 aa  89.4  4e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.49613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4115  response regulator receiver protein  30.14 
 
 		 216 aa  89.4  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.071707  normal  0.0608108 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2717  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.99 
 
 		 223 aa  89.4  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1998  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.38 
 
 		 225 aa  89.4  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.12496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2677  response regulator  27.67 
 
 		 214 aa  89  5e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0738952  normal  0.957867 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2562  response regulator  27.67 
 
 		 214 aa  89  5e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0171044  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4672  response regulator receiver protein  29.03 
 
 		 212 aa  89  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223352  normal  0.339353 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1616  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.25 
 
 		 229 aa  89  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1782  response regulator  27.67 
 
 		 214 aa  89  5e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0381154  hitchhiker  0.0000000750596 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2600  response regulator  27.67 
 
 		 214 aa  89  5e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000388579  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6980  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.49 
 
 		 213 aa  88.6  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0315  two component LuxR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 214 aa  89  6e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0084678 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1547  response regulator  27.67 
 
 		 214 aa  88.6  7e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000288339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1608  response regulator  27.67 
 
 		 214 aa  88.6  7e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000660452  normal  0.150334 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2926  two component LuxR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 223 aa  88.6  7e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.380263  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0346  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.15 
 
 		 210 aa  88.2  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0205277  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.28 
 
 		 226 aa  88.2  8e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2469  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.44 
 
 		 214 aa  87.8  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2744  two component LuxR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 201 aa  87.8  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2108  two component LuxR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 218 aa  87.8  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  27.85 
 
 		 207 aa  87.8  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4258  two component LuxR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 216 aa  88.2  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1782  two component LuxR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 230 aa  87  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025253 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.73 
 
 		 225 aa  86.7  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1614  response regulator  27.18 
 
 		 214 aa  87  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000746753  normal  0.505035 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1071  two component LuxR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 209 aa  87  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  28.5 
 
 		 226 aa  87.4  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0232  response regulator receiver protein  30.23 
 
 		 213 aa  87  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>