More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3701 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3701  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 253 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.567008  normal  0.770716 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3368  two component LuxR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 258 aa  151  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0298943  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0415  LuxR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.272996  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0358  LuxR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2574  two component LuxR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 253 aa  148  8e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0978  two component LuxR family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 247 aa  143  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.159022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4826  two component LuxR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 267 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847801  normal  0.0520322 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1961  response regulator receiver protein  40.49 
 
 		 247 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0316  LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 213 aa  141  8e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.155222  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6421  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.61 
 
 		 251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.872179  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6225  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.3 
 
 		 258 aa  135  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.173155 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4801  two component LuxR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.433912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4608  two component LuxR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 275 aa  106  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0957  LuxR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 342 aa  105  7e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.553991  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2943  two component LuxR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 351 aa  104  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.692808  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0267  two component LuxR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 241 aa  95.1  9e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4078  hypothetical protein  33.52 
 
 		 243 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0439982  normal  0.0668702 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1738  response regulator receiver protein  44.26 
 
 		 267 aa  81.6  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 250 aa  78.2  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 232 aa  77.8  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.173401  normal  0.808062 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0960  two component LuxR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0834  LuxR response regulator receiver  35.61 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0179337 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1627  two component LuxR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 244 aa  75.5  0.0000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0484719  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 238 aa  75.1  0.0000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02120  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with NarQ or NarX  36.64 
 
 		 215 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1466  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.64 
 
 		 215 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.25338  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 223 aa  74.3  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2492  transcriptional regulator NarP  36.64 
 
 		 215 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1457  transcriptional regulator NarP  36.64 
 
 		 215 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.956805 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2331  transcriptional regulator NarP  36.64 
 
 		 215 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0748  transcriptional regulator NarP  36.64 
 
 		 215 aa  73.9  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.251733  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02079  hypothetical protein  36.64 
 
 		 215 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2341  transcriptional regulator NarP  36.64 
 
 		 215 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.277554 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0852  two component LuxR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 224 aa  73.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.852842  normal  0.596615 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3330  transcriptional regulator NarP  36.64 
 
 		 215 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0991  two component LuxR family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2341  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.41 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.193906 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7667  two component LuxR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1894  putative response regulator receiver protein  34.82 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.761861  normal  0.0769356 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2570  two component LuxR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.282998  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0262  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.21 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0721339  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0091  two component LuxR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 218 aa  72  0.000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.81 
 
 		 211 aa  71.6  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26840  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  29.51 
 
 		 239 aa  71.6  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274056  normal  0.228776 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2076  response regulator receiver protein  32.33 
 
 		 238 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3975  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.68 
 
 		 221 aa  71.6  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0482097  normal  0.237128 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.43 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0164  two component LuxR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.523755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2486  transcriptional regulator NarP  35.11 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187807  normal  0.0115945 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2589  transcriptional regulator NarP  35.11 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.167087 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0828  two component LuxR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00513824  normal  0.360671 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2430  transcriptional regulator NarP  35.11 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.426027  normal  0.504703 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2381  transcriptional regulator NarP  35.11 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2472  transcriptional regulator NarP  35.11 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0408  two component LuxR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82136  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1270  nitrate/nitrite response regulator protein NarP  34.11 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.214676  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2794  nitrate/nitrite response regulator protein NarP  34.11 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0858473 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4064  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.88 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1384  two component LuxR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4184  hypothetical protein  40.87 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.400045  normal  0.380291 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5613  transcriptional regulator, LuxR family  27.84 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4024  two component LuxR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000136895 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2941  two component LuxR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 251 aa  68.6  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.80826  normal  0.0563961 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3486  hypothetical protein  36.43 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5643  two component LuxR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 203 aa  68.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1210  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.42 
 
 		 198 aa  68.2  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.292938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0214  two component LuxR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 220 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0866  two component LuxR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 220 aa  68.2  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3950  LuxR family DNA-binding response regulator  28.91 
 
 		 210 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331441  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0341  two component LuxR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 216 aa  68.2  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38930  putative transcriptional regulator  32.81 
 
 		 221 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1545  two component LuxR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.505974  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2648  LuxR family DNA-binding response regulator  30.88 
 
 		 220 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  33.08 
 
 		 242 aa  67.8  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1815  two component LuxR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 213 aa  67  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.922696  normal  0.34679 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000210563  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33010  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  30.7 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.163463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2305  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  30.88 
 
 		 220 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4192  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.22 
 
 		 251 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.270399  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0164  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.41 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0441129 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 303 aa  67.8  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  31.01 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.87 
 
 		 228 aa  67.8  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0555  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.65 
 
 		 227 aa  67  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1828  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  32.41 
 
 		 216 aa  67  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3170  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  32.37 
 
 		 227 aa  67  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38490  Response regulator, LuxR family  35.88 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2606  two component LuxR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00642184  hitchhiker  0.00275886 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2486  two component LuxR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.637953  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1182  two component LuxR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192356 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2087  two component LuxR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4179  hypothetical protein  34.88 
 
 		 232 aa  66.2  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.365276 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0522  response regulator receiver protein  31.16 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2493  two component LuxR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2171  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0762379  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2408  two component LuxR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 219 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0426941  normal  0.882432 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>