More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6376 on replicon NC_011371
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011371  Rleg2_6376  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 
258 aa  533  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.888984 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6196  transcriptional regulator, LuxR family  91.41 
 
 
275 aa  490  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4216  regulatory protein, LuxR  51.68 
 
 
254 aa  261  6.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4539  transcriptional regulator, LuxR family, autoinducer-regulated  50.42 
 
 
254 aa  259  3e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.542388  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02209  transcriptional regulator AhyR/AsaR family  42.29 
 
 
254 aa  219  3e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0933251  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2179  LuxR family transcriptional regulator  42.92 
 
 
239 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3098  transcriptional regulator, LuxR family  33.97 
 
 
254 aa  81.6  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.521704  normal  0.269359 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2417  LuxR family transcriptional regulator  27.31 
 
 
244 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0097  transcriptional regulator, LuxR family  32.8 
 
 
244 aa  80.5  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0460  transcriptional regulator, LuxR family  32.08 
 
 
253 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.343765 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2171  ATP-dependent transcription regulator LuxR  32.19 
 
 
238 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0944598  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1443  ATP-dependent transcription regulator LuxR  32.19 
 
 
238 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0542  ATP-dependent transcription regulator LuxR  32.19 
 
 
238 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0854  ATP-dependent transcription regulator LuxR  32.19 
 
 
238 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.777865  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0444  ATP-dependent transcription regulator LuxR  32.19 
 
 
238 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.853961  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4114  putative transcriptional activator  31.9 
 
 
213 aa  78.2  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  0.314154 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4359  regulatory protein, LuxR  25.31 
 
 
301 aa  77  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1863  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.93 
 
 
394 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00465528  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2087  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.93 
 
 
425 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.417065  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3796  LuxR family transcriptional regulator  28.25 
 
 
237 aa  76.3  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00301827 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2084  LuxR family transcriptional regulator  27.07 
 
 
269 aa  75.5  0.0000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.730902  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3395  LuxR family transcriptional regulator  32.81 
 
 
260 aa  75.1  0.0000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3500  LuxR family transcriptional regulator  27.84 
 
 
247 aa  75.5  0.0000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.547243 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1997  regulatory protein, LuxR  32.29 
 
 
278 aa  75.1  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5725  DNA-binding HTH domain-containing protein  27.12 
 
 
307 aa  73.6  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000726612  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0282  transcriptional regulator, LuxR family  27.52 
 
 
246 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.419752  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0190  LuxR family transcriptional regulator  27.54 
 
 
235 aa  72.8  0.000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.195449  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6378  LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
248 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6408  LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
248 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0183  LuxR family transcriptional regulator  27.12 
 
 
235 aa  71.2  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0816251  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0920  LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
268 aa  70.1  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.81926  normal  0.148698 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0198  autoinducer-binding domain-containing protein  28.44 
 
 
235 aa  69.3  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00000129067  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01929  transcriptional activator of quorum sensing autoinducer synthesis transcription regulator protein  28 
 
 
248 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.746701 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0122  LuxR family transcriptional regulator  29.74 
 
 
233 aa  68.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1758  autoinducer-binding domain-containing protein  29.74 
 
 
233 aa  68.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0965  transcriptional activator protein LuxR  24.38 
 
 
248 aa  67.4  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.266935  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4116  LuxR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
239 aa  67  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0201758  hitchhiker  0.00877352 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5576  LuxR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
239 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000012464  normal  0.015154 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3643  LuxR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
239 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00106494  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1559  regulatory protein LuxR  31.89 
 
 
246 aa  66.2  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.509292 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4724  LuxR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
239 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000522863  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4514  autoinducer-binding domain-containing protein  31.96 
 
 
243 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.447162  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4977  transcriptional regulator, LuxR family  31.58 
 
 
243 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.142556 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5194  LuxR family transcriptional regulator  27.53 
 
 
242 aa  66.2  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3810  LuxR family transcriptional regulator  27.04 
 
 
242 aa  66.2  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2210  LuxR family transcriptional regulator  25.56 
 
 
240 aa  65.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0610  LuxR family transcriptional regulator  28.42 
 
 
234 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.317613 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1052  LuxR family transcriptional regulator  27.45 
 
 
239 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000445716  normal  0.182523 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5029  transcriptional regulator, LuxR family  32.29 
 
 
243 aa  65.5  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.771298  normal  0.575652 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4277  transcriptional regulator, LuxR family  29.57 
 
 
234 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.343912 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0323  transcriptional regulator, LuxR family  28.32 
 
 
243 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0958  transcriptional activator protein LuxR  26.96 
 
 
247 aa  64.3  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0805  LuxR family transcriptional regulator  29.38 
 
 
230 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.565309  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4581  LuxR family transcriptional regulator  26.88 
 
 
239 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000141763  hitchhiker  0.0000089809 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3549  regulatory protein, LuxR  27.85 
 
 
255 aa  63.5  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4439  LuxR family transcriptional regulator  25.53 
 
 
234 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1576  LuxR family transcriptional regulator  29.38 
 
 
230 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.893939  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0617  LuxR family transcriptional regulator  29.38 
 
 
230 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0241474  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2024  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.38 
 
 
230 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.896026  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0702  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  29.38 
 
 
230 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.669136  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2215  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  29.38 
 
 
230 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.311283  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2128  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  29.38 
 
 
230 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.423434  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0797  transcriptional regulator, LuxR family  30.61 
 
 
240 aa  62.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205827  normal  0.24043 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1345  N-acyl homoserine lactone transcriptional regulator  27.2 
 
 
239 aa  62  0.000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2485  BpsR  27.2 
 
 
239 aa  62  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0962  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  27.2 
 
 
239 aa  62  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0607  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  27.2 
 
 
239 aa  62  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.83559  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1295  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  27.2 
 
 
239 aa  62  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.312538  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1223  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  27.2 
 
 
239 aa  62  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0329  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  27.2 
 
 
239 aa  62  0.000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1709  autoinducer-binding domain-containing protein  29.23 
 
 
233 aa  61.6  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.781724  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4396  LuxR family transcriptional regulator  28.65 
 
 
228 aa  61.2  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1690  two component LuxR family transcriptional regulator  42.7 
 
 
215 aa  61.6  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.104312 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5040  LuxR family transcriptional regulator  27.73 
 
 
229 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350334  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3971  LuxR family transcriptional regulator  27.47 
 
 
239 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000126265  normal  0.0321799 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0440  regulatory protein LuxR  31.61 
 
 
246 aa  61.2  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0539143 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5810  LuxR family transcriptional regulator  26.94 
 
 
228 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.809704  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1510  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.17 
 
 
239 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.08907  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4435  LuxR family transcriptional regulator  28.12 
 
 
231 aa  60.8  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1003  transcriptional regulator, LuxR family  29.35 
 
 
245 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383688  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6040  LuxR family transcriptional regulator  26.94 
 
 
228 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.917081 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3779  regulatory protein, LuxR  30 
 
 
248 aa  60.5  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0359  LuxR family transcriptional regulator  28.11 
 
 
248 aa  60.1  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.870907  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2028  LuxR family transcriptional regulator  26.23 
 
 
242 aa  59.7  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2852  transcriptional regulator  26.9 
 
 
236 aa  59.7  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5762  LuxR family transcriptional regulator  28.12 
 
 
242 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.225342  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3863  transcriptional regulator PsyR  26.8 
 
 
247 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.831721  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1362  LuxR family transcriptional regulator  27.93 
 
 
257 aa  58.5  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0963  transcriptional regulator, LuxR family  25.54 
 
 
237 aa  58.5  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.27907  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2414  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.57 
 
 
215 aa  58.5  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4279  LuxR family transcriptional regulator  26.46 
 
 
321 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189781  normal  0.0123236 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0418  LuxR family transcriptional regulator  27.24 
 
 
242 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0505  transcriptional regulator, LuxR family  28.4 
 
 
244 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5781  response regulator receiver protein  26.04 
 
 
243 aa  56.6  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305702  hitchhiker  0.00700374 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3287  transcriptional activator SOLR transcription regulator protein  24.46 
 
 
236 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.840181  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0100  transcriptional regulator, LuxR family  26.15 
 
 
250 aa  56.2  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1622  LuxR transcriptional regulator  26.8 
 
 
247 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.831315  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0175  LuxR family transcriptional regulator  27.84 
 
 
254 aa  55.8  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.508003  normal  0.575618 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0548  transcriptional regulator, LuxR family  27.83 
 
 
244 aa  55.5  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.216848  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1681  ATP-dependent transcription regulator LuxR  37.65 
 
 
238 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>