More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02209 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_02209  transcriptional regulator AhyR/AsaR family  100 
 
 
254 aa  526  1e-148  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0933251  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4539  transcriptional regulator, LuxR family, autoinducer-regulated  49 
 
 
254 aa  246  3e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.542388  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4216  regulatory protein, LuxR  49.4 
 
 
254 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6376  transcriptional regulator, LuxR family  42.29 
 
 
258 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.888984 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6196  transcriptional regulator, LuxR family  41.11 
 
 
275 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2179  LuxR family transcriptional regulator  43.51 
 
 
239 aa  187  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3500  LuxR family transcriptional regulator  29.21 
 
 
247 aa  81.6  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.547243 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2852  transcriptional regulator  27.89 
 
 
236 aa  79.3  0.00000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1576  LuxR family transcriptional regulator  30.73 
 
 
230 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.893939  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0617  LuxR family transcriptional regulator  30.73 
 
 
230 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0241474  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0805  LuxR family transcriptional regulator  30.21 
 
 
230 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.565309  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4359  regulatory protein, LuxR  26.59 
 
 
301 aa  77.4  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0702  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  30.73 
 
 
230 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.669136  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2024  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.73 
 
 
230 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.896026  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2215  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  30.73 
 
 
230 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.311283  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2128  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  30.73 
 
 
230 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.423434  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2417  LuxR family transcriptional regulator  27.07 
 
 
244 aa  76.3  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0460  transcriptional regulator, LuxR family  31.86 
 
 
253 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.343765 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5810  LuxR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
228 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.809704  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2087  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.08 
 
 
425 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.417065  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4977  transcriptional regulator, LuxR family  30.71 
 
 
243 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.142556 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6040  LuxR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
228 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.917081 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4514  autoinducer-binding domain-containing protein  30.59 
 
 
243 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.447162  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3395  LuxR family transcriptional regulator  30.6 
 
 
260 aa  73.2  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3810  LuxR family transcriptional regulator  27.11 
 
 
242 aa  73.2  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01929  transcriptional activator of quorum sensing autoinducer synthesis transcription regulator protein  28.16 
 
 
248 aa  72.8  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.746701 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0359  LuxR family transcriptional regulator  26.7 
 
 
248 aa  72  0.000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.870907  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1443  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.08 
 
 
238 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0854  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.08 
 
 
238 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.777865  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2171  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.08 
 
 
238 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0944598  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5029  transcriptional regulator, LuxR family  29.02 
 
 
243 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.771298  normal  0.575652 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0542  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.08 
 
 
238 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0444  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.08 
 
 
238 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.853961  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0958  transcriptional activator protein LuxR  23.42 
 
 
247 aa  70.9  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1863  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.67 
 
 
394 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00465528  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0323  transcriptional regulator, LuxR family  32.84 
 
 
243 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3386  putative transcriptional regulator  24.68 
 
 
237 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.247592  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3898  transcriptional regulator LasR  26.13 
 
 
239 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.219668  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39980  putative transcriptional regulator  25.32 
 
 
237 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45960  transcriptional regulator LasR  27.31 
 
 
239 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5194  LuxR family transcriptional regulator  26.73 
 
 
242 aa  68.6  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0965  transcriptional activator protein LuxR  21.99 
 
 
248 aa  67.4  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.266935  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5323  transcriptional regulator two component heavy metal regulatory response ZniR  40 
 
 
206 aa  67.8  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.844748 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5725  DNA-binding HTH domain-containing protein  26.41 
 
 
307 aa  67.8  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000726612  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0920  LuxR family transcriptional regulator  29.9 
 
 
268 aa  67.4  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.81926  normal  0.148698 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3098  transcriptional regulator, LuxR family  27.91 
 
 
254 aa  67.8  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.521704  normal  0.269359 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0282  transcriptional regulator, LuxR family  27.39 
 
 
246 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.419752  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3840  transcriptional regulator, LuxR family  27.55 
 
 
251 aa  66.6  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2525  LuxR family transcriptional regulator  32.43 
 
 
276 aa  66.2  0.0000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.853805  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0198  autoinducer-binding domain-containing protein  27.18 
 
 
235 aa  65.9  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00000129067  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0097  transcriptional regulator, LuxR family  31.69 
 
 
244 aa  65.9  0.0000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0100  transcriptional regulator, LuxR family  23.41 
 
 
250 aa  65.5  0.0000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4114  putative transcriptional activator  30 
 
 
213 aa  65.5  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  0.314154 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0962  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  24.89 
 
 
239 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1345  N-acyl homoserine lactone transcriptional regulator  24.89 
 
 
239 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2485  BpsR  24.89 
 
 
239 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3643  LuxR family transcriptional regulator  32.84 
 
 
239 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00106494  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4724  LuxR family transcriptional regulator  32.84 
 
 
239 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000522863  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0329  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  24.89 
 
 
239 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0607  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  24.89 
 
 
239 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.83559  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5576  LuxR family transcriptional regulator  32.84 
 
 
239 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000012464  normal  0.015154 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1295  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  24.89 
 
 
239 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.312538  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1223  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  24.89 
 
 
239 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1510  ATP-dependent transcription regulator LuxR  24.89 
 
 
239 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.08907  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2210  LuxR family transcriptional regulator  30.85 
 
 
240 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1052  LuxR family transcriptional regulator  32.84 
 
 
239 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000445716  normal  0.182523 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4116  LuxR family transcriptional regulator  32.09 
 
 
239 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0201758  hitchhiker  0.00877352 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1231  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.93 
 
 
234 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.681253  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0440  regulatory protein LuxR  30.06 
 
 
246 aa  62.8  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0539143 
 
 
-
 
NC_004310  BR0190  LuxR family transcriptional regulator  24.49 
 
 
235 aa  62.8  0.000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.195449  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0610  LuxR family transcriptional regulator  24.46 
 
 
234 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.317613 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0797  transcriptional regulator, LuxR family  25.13 
 
 
240 aa  62.4  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205827  normal  0.24043 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4168  transcriptional regulator, LuxR family  26.37 
 
 
251 aa  62.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0183  LuxR family transcriptional regulator  24.49 
 
 
235 aa  62.4  0.000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0816251  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4581  LuxR family transcriptional regulator  32.09 
 
 
239 aa  62  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000141763  hitchhiker  0.0000089809 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3796  LuxR family transcriptional regulator  28.28 
 
 
237 aa  62  0.000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00301827 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4641  LuxR family transcriptional regulator  25.45 
 
 
235 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.226579  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4277  transcriptional regulator, LuxR family  25.43 
 
 
234 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.343912 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0139  GAF modulated transcriptional regulator, LuxR family  50.82 
 
 
506 aa  61.2  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1997  autoinducer-binding transcriptional regulator, LuxR family  27.73 
 
 
237 aa  60.8  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.448669  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3321  LuxR family transcriptional regulator  26.98 
 
 
240 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.214587 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1664  transcriptional regulator, LuxR family  27.73 
 
 
237 aa  60.8  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.888844 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3971  LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
239 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000126265  normal  0.0321799 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0127  transcriptional regulator, LuxR family  25.39 
 
 
236 aa  60.8  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2503  DNA-binding transcriptional activator SdiA  24.76 
 
 
240 aa  60.1  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000339648  normal  0.514976 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4147  transcriptional regulator, LuxR family  22.96 
 
 
242 aa  60.1  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9665  two-component transcriptional regulator LuxR family  25 
 
 
240 aa  59.7  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.024682  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0505  transcriptional regulator, LuxR family  28 
 
 
244 aa  59.3  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3193  LuxR family transcriptional regulator  29.53 
 
 
243 aa  59.3  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.800778  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2028  LuxR family transcriptional regulator  25.73 
 
 
242 aa  59.3  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0807  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.3 
 
 
228 aa  58.9  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.218712 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0702  LuxR family transcriptional regulator  27.13 
 
 
245 aa  58.9  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1309  two component LuxR family transcriptional regulator  48.53 
 
 
206 aa  58.9  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000148999  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1003  transcriptional regulator, LuxR family  27.84 
 
 
245 aa  58.5  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383688  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2084  LuxR family transcriptional regulator  25.5 
 
 
269 aa  58.2  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.730902  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0627  LuxR family transcriptional regulator  25.66 
 
 
241 aa  58.2  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.253164  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1997  regulatory protein, LuxR  33.61 
 
 
278 aa  58.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4439  LuxR family transcriptional regulator  24.15 
 
 
234 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5462  LuxR family transcriptional regulator  29.8 
 
 
245 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.191354 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3779  regulatory protein, LuxR  27.83 
 
 
248 aa  57.8  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>