More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A1295 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1345  N-acyl homoserine lactone transcriptional regulator  100 
 
 
239 aa  500  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2485  BpsR  100 
 
 
239 aa  500  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0962  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  100 
 
 
239 aa  500  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1223  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  100 
 
 
239 aa  500  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0329  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  100 
 
 
239 aa  500  1e-141  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0607  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  100 
 
 
239 aa  500  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.83559  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1295  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  100 
 
 
239 aa  500  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.312538  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1510  ATP-dependent transcription regulator LuxR  98.74 
 
 
239 aa  495  1e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.08907  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4581  LuxR family transcriptional regulator  81.17 
 
 
239 aa  418  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000141763  hitchhiker  0.0000089809 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1052  LuxR family transcriptional regulator  79.92 
 
 
239 aa  411  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000445716  normal  0.182523 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3971  LuxR family transcriptional regulator  79.92 
 
 
239 aa  410  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000126265  normal  0.0321799 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5576  LuxR family transcriptional regulator  79.92 
 
 
239 aa  411  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000012464  normal  0.015154 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3643  LuxR family transcriptional regulator  79.92 
 
 
239 aa  411  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00106494  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4116  LuxR family transcriptional regulator  79.92 
 
 
239 aa  411  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0201758  hitchhiker  0.00877352 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4724  LuxR family transcriptional regulator  79.92 
 
 
239 aa  411  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000522863  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3287  transcriptional activator SOLR transcription regulator protein  68.97 
 
 
236 aa  343  1e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.840181  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0190  LuxR family transcriptional regulator  42.98 
 
 
235 aa  195  4.0000000000000005e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.195449  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1664  transcriptional regulator, LuxR family  41.88 
 
 
237 aa  195  5.000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.888844 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1997  autoinducer-binding transcriptional regulator, LuxR family  41.88 
 
 
237 aa  195  5.000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.448669  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0183  LuxR family transcriptional regulator  42.55 
 
 
235 aa  194  1e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0816251  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01929  transcriptional activator of quorum sensing autoinducer synthesis transcription regulator protein  43.16 
 
 
248 aa  190  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.746701 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0198  autoinducer-binding domain-containing protein  42.13 
 
 
235 aa  181  7e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00000129067  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0963  transcriptional regulator, LuxR family  39.08 
 
 
237 aa  181  1e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.27907  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1231  ATP-dependent transcription regulator LuxR  41.15 
 
 
234 aa  180  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.681253  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0142  N-acyl-homoserine lactone dependent regulatory protein  41.15 
 
 
234 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0163426  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1570  ATP-dependent transcription regulator LuxR  41.15 
 
 
236 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.778317  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1652  ATP-dependent transcription regulator LuxR  41.15 
 
 
234 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.643432  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0641  ATP-dependent transcription regulator LuxR  38.1 
 
 
241 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0312274  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2798  ATP-dependent transcription regulator LuxR  38.1 
 
 
237 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.675669  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2729  ATP-dependent transcription regulator LuxR  38.1 
 
 
241 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0930619  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2371  ATP-dependent transcription regulator LuxR  38.1 
 
 
241 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.440892  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2915  ATP-dependent transcription regulator LuxR  38.1 
 
 
237 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.454836  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1686  ATP-dependent transcription regulator LuxR  38.1 
 
 
237 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0643903  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2672  ATP-dependent transcription regulator LuxR  38.1 
 
 
241 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5810  LuxR family transcriptional regulator  39.82 
 
 
228 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.809704  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6040  LuxR family transcriptional regulator  39.82 
 
 
228 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.917081 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1817  ATP-dependent transcription regulator LuxR  38.1 
 
 
241 aa  175  7e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.985291  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5910  LuxR family transcriptional regulator  38.2 
 
 
237 aa  175  7e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0531603  decreased coverage  0.00148471 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5809  transcriptional regulator, LuxR family  38.63 
 
 
235 aa  169  5e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.962539  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1649  transcriptional regulator RhlR  39.09 
 
 
224 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.458186  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19120  transcriptional regulator RhlR  37.61 
 
 
241 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.420854  normal  0.170234 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39980  putative transcriptional regulator  33.48 
 
 
237 aa  155  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5699  LuxR family transcriptional regulator  32.91 
 
 
239 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0607724 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4980  LuxR family transcriptional regulator  39.51 
 
 
237 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3180  LuxR family transcriptional regulator  39.51 
 
 
237 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.100011 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4299  LuxR family transcriptional regulator  39.51 
 
 
237 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.190696 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3386  putative transcriptional regulator  33.48 
 
 
237 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.247592  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2503  DNA-binding transcriptional activator SdiA  32.9 
 
 
240 aa  152  5.9999999999999996e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000339648  normal  0.514976 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1723  DNA-binding transcriptional activator SdiA  34.8 
 
 
240 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00781439  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2015  DNA-binding transcriptional activator SdiA  34.8 
 
 
240 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000284169  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1730  transcriptional regulator, LuxR family  34.8 
 
 
240 aa  146  3e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000557622  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2112  DNA-binding transcriptional activator SdiA  35.56 
 
 
240 aa  145  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.722664  hitchhiker  0.0000000000000595752 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1170  DNA-binding transcriptional activator SdiA  35.56 
 
 
240 aa  145  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0141324  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2165  DNA-binding transcriptional activator SdiA  35.56 
 
 
240 aa  145  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0921825  hitchhiker  0.00000020452 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1293  DNA-binding transcriptional activator SdiA  35.56 
 
 
240 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.746399  hitchhiker  0.0000202879 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2106  DNA-binding transcriptional activator SdiA  35.56 
 
 
240 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.010871 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1266  DNA-binding transcriptional activator SdiA  34.8 
 
 
240 aa  145  5e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00315864  hitchhiker  0.00193945 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2690  DNA-binding transcriptional activator SdiA  34.36 
 
 
240 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0029365  normal  0.0383701 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2150  DNA-binding transcriptional activator SdiA  34.36 
 
 
240 aa  143  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000560081  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1044  DNA-binding transcriptional activator SdiA  34.36 
 
 
240 aa  143  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000369866  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2417  LuxR family transcriptional regulator  33.63 
 
 
244 aa  129  6e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1681  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.6 
 
 
238 aa  121  9e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4641  LuxR family transcriptional regulator  29.36 
 
 
235 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.226579  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0791  LuxR family transcriptional regulator  31.51 
 
 
236 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0904596  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1443  ATP-dependent transcription regulator LuxR  34.8 
 
 
238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0854  ATP-dependent transcription regulator LuxR  34.8 
 
 
238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.777865  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0444  ATP-dependent transcription regulator LuxR  34.8 
 
 
238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.853961  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2171  ATP-dependent transcription regulator LuxR  34.8 
 
 
238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0944598  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0542  ATP-dependent transcription regulator LuxR  34.8 
 
 
238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1863  ATP-dependent transcription regulator LuxR  34.8 
 
 
394 aa  115  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00465528  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2087  ATP-dependent transcription regulator LuxR  32.46 
 
 
425 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.417065  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4509  autoinducer-binding domain-containing protein  28.51 
 
 
235 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4647  LuxR family transcriptional regulator  28.09 
 
 
279 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3098  transcriptional regulator, LuxR family  33.89 
 
 
254 aa  108  9.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.521704  normal  0.269359 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0965  transcriptional activator protein LuxR  31.36 
 
 
248 aa  107  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.266935  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0460  transcriptional regulator, LuxR family  37.11 
 
 
253 aa  106  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.343765 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1833  LuxR family transcriptional regulator  30.09 
 
 
238 aa  101  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.873673  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4439  LuxR family transcriptional regulator  32.64 
 
 
234 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3796  LuxR family transcriptional regulator  28.51 
 
 
237 aa  100  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00301827 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1709  autoinducer-binding domain-containing protein  31.47 
 
 
233 aa  97.1  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.781724  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3500  LuxR family transcriptional regulator  30.57 
 
 
247 aa  97.4  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.547243 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3395  LuxR family transcriptional regulator  30.87 
 
 
260 aa  95.5  7e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3810  LuxR family transcriptional regulator  33.16 
 
 
242 aa  94.7  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0122  LuxR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
233 aa  93.6  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1758  autoinducer-binding domain-containing protein  30.77 
 
 
233 aa  93.6  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0610  LuxR family transcriptional regulator  28.45 
 
 
234 aa  92  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.317613 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5725  DNA-binding HTH domain-containing protein  27.71 
 
 
307 aa  91.3  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000726612  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4277  transcriptional regulator, LuxR family  28.03 
 
 
234 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.343912 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2997  LuxR family transcriptional regulator  34.18 
 
 
250 aa  90.9  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.665573 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3140  regulatory protein LuxR  29.46 
 
 
246 aa  90.1  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4889  LuxR family transcriptional regulator  29.96 
 
 
235 aa  89  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.672367  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3112  regulatory protein, LuxR  31.11 
 
 
250 aa  88.6  8e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0958  transcriptional activator protein LuxR  31.14 
 
 
247 aa  87.4  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3898  transcriptional regulator LasR  27.87 
 
 
239 aa  87  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.219668  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0418  LuxR family transcriptional regulator  30.86 
 
 
242 aa  86.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45960  transcriptional regulator LasR  29.29 
 
 
239 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1513  LuxR family transcriptional regulator  33.69 
 
 
246 aa  85.1  9e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493267  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0402  regulatory protein, LuxR  31.4 
 
 
242 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3321  LuxR family transcriptional regulator  30.91 
 
 
240 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.214587 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3863  transcriptional regulator PsyR  27.55 
 
 
247 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.831721  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>