245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5194 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_5194  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 
242 aa  501  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2210  LuxR family transcriptional regulator  49.58 
 
 
240 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2028  LuxR family transcriptional regulator  47.64 
 
 
242 aa  216  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5781  response regulator receiver protein  38.12 
 
 
243 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305702  hitchhiker  0.00700374 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0920  LuxR family transcriptional regulator  36.02 
 
 
268 aa  146  3e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.81926  normal  0.148698 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0097  transcriptional regulator, LuxR family  37.12 
 
 
244 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2852  transcriptional regulator  31.67 
 
 
236 aa  138  7.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3102  LuxR family transcriptional regulator  29.44 
 
 
239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.644499  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2928  transcriptional regulator, LuxR family  32.78 
 
 
241 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.258432  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2667  transcriptional regulator, LuxR family  31.95 
 
 
241 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.530563  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1407  LuxR family transcriptional regulator  35.82 
 
 
241 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.959158  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0122  LuxR family transcriptional regulator  33.51 
 
 
233 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1758  autoinducer-binding domain-containing protein  33.51 
 
 
233 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0694  transcriptional regulator, LuxR family  31.47 
 
 
242 aa  105  5e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1709  autoinducer-binding domain-containing protein  32.43 
 
 
233 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.781724  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1709  transcriptional regulator, LuxR family  30.36 
 
 
251 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1559  regulatory protein LuxR  28.33 
 
 
246 aa  96.3  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.509292 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4114  putative transcriptional activator  32.5 
 
 
213 aa  95.5  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  0.314154 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3348  transcriptional regulator, LuxR family  32.78 
 
 
238 aa  94.7  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0460  transcriptional regulator, LuxR family  34.55 
 
 
253 aa  92.4  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.343765 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5725  DNA-binding HTH domain-containing protein  30.73 
 
 
307 aa  87.4  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000726612  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5810  LuxR family transcriptional regulator  29.87 
 
 
228 aa  87  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.809704  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6040  LuxR family transcriptional regulator  29.87 
 
 
228 aa  87  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.917081 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3386  putative transcriptional regulator  27.97 
 
 
237 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.247592  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2417  LuxR family transcriptional regulator  26.18 
 
 
244 aa  84.3  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39980  putative transcriptional regulator  27.39 
 
 
237 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3395  LuxR family transcriptional regulator  29.8 
 
 
260 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5809  transcriptional regulator, LuxR family  30.47 
 
 
235 aa  80.5  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.962539  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1664  transcriptional regulator, LuxR family  26.81 
 
 
237 aa  77.4  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.888844 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1997  autoinducer-binding transcriptional regulator, LuxR family  26.81 
 
 
237 aa  77.4  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.448669  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4539  transcriptional regulator, LuxR family, autoinducer-regulated  28.11 
 
 
254 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.542388  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3863  transcriptional regulator PsyR  25 
 
 
247 aa  75.1  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.831721  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4514  autoinducer-binding domain-containing protein  28.04 
 
 
243 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.447162  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4977  transcriptional regulator, LuxR family  28.7 
 
 
243 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.142556 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4216  regulatory protein, LuxR  27.65 
 
 
254 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5029  transcriptional regulator, LuxR family  27.31 
 
 
243 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.771298  normal  0.575652 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0119  LuxR family transcriptional regulator  28.87 
 
 
259 aa  72.4  0.000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.608376  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0610  LuxR family transcriptional regulator  30.37 
 
 
234 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.317613 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0110  LuxR family transcriptional regulator  28.87 
 
 
268 aa  72  0.000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.514691  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0805  LuxR family transcriptional regulator  29.1 
 
 
230 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.565309  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1576  LuxR family transcriptional regulator  29.1 
 
 
230 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.893939  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0617  LuxR family transcriptional regulator  29.1 
 
 
230 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0241474  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0702  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  29.1 
 
 
230 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.669136  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2128  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  29.1 
 
 
230 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.423434  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5040  LuxR family transcriptional regulator  24.78 
 
 
229 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350334  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2024  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.1 
 
 
230 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.896026  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2215  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  29.1 
 
 
230 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.311283  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1890  transcriptional regulator LuxR family  29.9 
 
 
246 aa  70.1  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.546749  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1622  LuxR transcriptional regulator  28.16 
 
 
247 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.831315  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4224  regulatory protein LuxR  24.12 
 
 
260 aa  70.1  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.525332  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1649  transcriptional regulator RhlR  28.57 
 
 
224 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.458186  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5762  LuxR family transcriptional regulator  25.65 
 
 
242 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.225342  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4439  LuxR family transcriptional regulator  29.23 
 
 
234 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4277  transcriptional regulator, LuxR family  28.27 
 
 
234 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.343912 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19120  transcriptional regulator RhlR  28.57 
 
 
241 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.420854  normal  0.170234 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0418  LuxR family transcriptional regulator  30.6 
 
 
242 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0943  transcriptional regulator, LuxR family  28.87 
 
 
242 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0282  transcriptional regulator, LuxR family  27.16 
 
 
246 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.419752  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6376  transcriptional regulator, LuxR family  27.53 
 
 
258 aa  66.2  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.888984 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02209  transcriptional regulator AhyR/AsaR family  26.73 
 
 
254 aa  65.9  0.0000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0933251  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5462  LuxR family transcriptional regulator  29.95 
 
 
245 aa  65.9  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.191354 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1345  N-acyl homoserine lactone transcriptional regulator  26.02 
 
 
239 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2485  BpsR  26.02 
 
 
239 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0962  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  26.02 
 
 
239 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0329  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  26.02 
 
 
239 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0607  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  26.02 
 
 
239 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.83559  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1295  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  26.02 
 
 
239 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.312538  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1223  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  26.02 
 
 
239 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1443  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.07 
 
 
238 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0854  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.07 
 
 
238 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.777865  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3898  transcriptional regulator LasR  23.48 
 
 
239 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.219668  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2171  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.07 
 
 
238 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0944598  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0542  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.07 
 
 
238 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0444  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.07 
 
 
238 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.853961  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0260  LuxR family transcriptional regulator  28.06 
 
 
243 aa  65.1  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0627  LuxR family transcriptional regulator  27.57 
 
 
241 aa  65.1  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.253164  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4558  LuxR family transcriptional regulator  26.84 
 
 
234 aa  64.7  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.534127  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45960  transcriptional regulator LasR  23.48 
 
 
239 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0190  LuxR family transcriptional regulator  27.17 
 
 
235 aa  64.3  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.195449  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1863  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.15 
 
 
394 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00465528  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0963  transcriptional regulator, LuxR family  24.75 
 
 
237 aa  64.3  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.27907  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0198  autoinducer-binding domain-containing protein  27.81 
 
 
235 aa  64.3  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00000129067  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1231  ATP-dependent transcription regulator LuxR  24.78 
 
 
234 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.681253  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1510  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.77 
 
 
239 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.08907  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0127  transcriptional regulator, LuxR family  24.77 
 
 
236 aa  63.2  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4279  LuxR family transcriptional regulator  29.23 
 
 
321 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189781  normal  0.0123236 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5699  LuxR family transcriptional regulator  27.96 
 
 
239 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0607724 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2087  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.59 
 
 
425 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.417065  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0183  LuxR family transcriptional regulator  26.63 
 
 
235 aa  62.8  0.000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0816251  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5576  LuxR family transcriptional regulator  25.6 
 
 
239 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000012464  normal  0.015154 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3643  LuxR family transcriptional regulator  25.6 
 
 
239 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00106494  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4724  LuxR family transcriptional regulator  25.6 
 
 
239 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000522863  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6196  transcriptional regulator, LuxR family  26.97 
 
 
275 aa  62  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3810  LuxR family transcriptional regulator  25.13 
 
 
242 aa  62.4  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0142  N-acyl-homoserine lactone dependent regulatory protein  28.57 
 
 
234 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0163426  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3500  LuxR family transcriptional regulator  28.64 
 
 
247 aa  61.2  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.547243 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1570  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.57 
 
 
236 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.778317  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1652  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.57 
 
 
234 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.643432  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1052  LuxR family transcriptional regulator  25.12 
 
 
239 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000445716  normal  0.182523 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0965  transcriptional activator protein LuxR  25.11 
 
 
248 aa  60.8  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.266935  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>