More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0797 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0797  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 240 aa  498  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205827  normal  0.24043 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0505  transcriptional regulator, LuxR family  41.13 
 
 		 244 aa  194  9e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0548  transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 244 aa  192  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.216848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0918  transcriptional regulator LuxR family  34.96 
 
 		 230 aa  168  8e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0440  regulatory protein LuxR  34.29 
 
 		 246 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0539143 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0441  regulatory protein LuxR  34.38 
 
 		 286 aa  143  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.923746  normal  0.0183899 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6408  LuxR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 248 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6378  LuxR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 248 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1003  transcriptional regulator, LuxR family  24.38 
 
 		 245 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383688  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0282  transcriptional regulator, LuxR family  27.63 
 
 		 246 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.419752  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2601  regulatory protein LuxR  27.75 
 
 		 247 aa  87.8  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0958  transcriptional activator protein LuxR  27.57 
 
 		 247 aa  82  0.000000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3273  transcriptional regulator LuxR family  25.12 
 
 		 241 aa  78.2  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0965  transcriptional activator protein LuxR  28.8 
 
 		 248 aa  76.6  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.266935  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3321  LuxR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 240 aa  77  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.214587 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0323  transcriptional regulator, LuxR family  26.61 
 
 		 243 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2417  LuxR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 244 aa  75.5  0.0000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0460  transcriptional regulator, LuxR family  25.62 
 
 		 253 aa  75.5  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.343765 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3193  LuxR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.800778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0359  LuxR family transcriptional regulator  23.96 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.870907  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2818  transcriptional regulator, LuxR family  25.85 
 
 		 241 aa  72.4  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0185947 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0127  transcriptional regulator, LuxR family  27.7 
 
 		 236 aa  71.6  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3087  transcriptional regulator, LuxR family  25.85 
 
 		 241 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1442  transcriptional regulator, LuxR family  29.65 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.600459  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4168  transcriptional regulator, LuxR family  25.3 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1836  transcriptional regulator, LuxR family  28.64 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.28867  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4114  putative transcriptional activator  25.93 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  0.314154 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0100  transcriptional regulator, LuxR family  27.27 
 
 		 250 aa  68.9  0.00000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3840  transcriptional regulator, LuxR family  25.24 
 
 		 251 aa  69.3  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0627  LuxR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 241 aa  68.9  0.00000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.253164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0418  LuxR family transcriptional regulator  24.15 
 
 		 242 aa  68.9  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4435  LuxR family transcriptional regulator  23.28 
 
 		 231 aa  68.9  0.00000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3898  transcriptional regulator LasR  26.36 
 
 		 239 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.219668  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1997  autoinducer-binding transcriptional regulator, LuxR family  28.85 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.448669  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1664  transcriptional regulator, LuxR family  28.85 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.888844 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4374  transcriptional regulator LuxR family  24.87 
 
 		 246 aa  66.2  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2957  transcriptional regulator protein  22.87 
 
 		 243 aa  66.2  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.923766  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5725  DNA-binding HTH domain-containing protein  25.26 
 
 		 307 aa  65.9  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000726612  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7112  LuxR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 242 aa  66.2  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0985225  normal  0.773577 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3863  transcriptional regulator PsyR  25.25 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.831721  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45960  transcriptional regulator LasR  25.79 
 
 		 239 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0702  LuxR family transcriptional regulator  23.27 
 
 		 245 aa  65.1  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0402  regulatory protein, LuxR  23.67 
 
 		 242 aa  65.1  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1622  LuxR transcriptional regulator  24.26 
 
 		 247 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.831315  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1766  transcriptional regulator, LuxR family  24.47 
 
 		 244 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182775  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3810  LuxR family transcriptional regulator  22.99 
 
 		 242 aa  64.3  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0791  LuxR family transcriptional regulator  23.77 
 
 		 236 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0904596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0963  transcriptional regulator, LuxR family  27.37 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.27907  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0175  LuxR family transcriptional regulator  22.46 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.508003  normal  0.575618 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6196  transcriptional regulator, LuxR family  30.16 
 
 		 275 aa  63.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5040  LuxR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6376  transcriptional regulator, LuxR family  30.61 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.888984 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02209  transcriptional regulator AhyR/AsaR family  25.13 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0933251  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4396  LuxR family transcriptional regulator  21.89 
 
 		 228 aa  62  0.000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2330  transcriptional regulator, LuxR family  25.49 
 
 		 240 aa  62  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0791  LuxR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0720  LuxR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4977  transcriptional regulator, LuxR family  24.46 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.142556 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0182  LuxR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00268604  hitchhiker  0.00000585836 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0287  transcriptional regulator, LuxR family  31.34 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1655  LuxR family transcriptional regulator  24 
 
 		 245 aa  60.5  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0127  transcriptional regulator, LuxR family  26.09 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3796  LuxR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301827 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1715  LuxR family transcriptional regulator  24 
 
 		 245 aa  60.5  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00270807  hitchhiker  0.000116776 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1547  LuxR family transcriptional regulator  24 
 
 		 245 aa  60.5  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2174  regulatory protein, LuxR  25 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.795683 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4428  two component LuxR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5029  transcriptional regulator, LuxR family  24.59 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.771298  normal  0.575652 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4514  autoinducer-binding domain-containing protein  23.91 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.447162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3140  regulatory protein LuxR  26.06 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9665  two-component transcriptional regulator LuxR family  20.39 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.024682  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1575  transcriptional regulator, LuxR family  30.82 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.629023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0805  LuxR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.565309  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2015  DNA-binding transcriptional activator SdiA  27.07 
 
 		 240 aa  58.5  0.00000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000284169  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1723  DNA-binding transcriptional activator SdiA  27.07 
 
 		 240 aa  58.5  0.00000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00781439  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1730  transcriptional regulator, LuxR family  25.32 
 
 		 240 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000557622  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4147  transcriptional regulator, LuxR family  24.62 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1576  LuxR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 230 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.893939  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2128  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  26.18 
 
 		 230 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.423434  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0318  transcriptional regulator, LuxR family  31.71 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0617  LuxR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 230 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0241474  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4439  LuxR family transcriptional regulator  22.32 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2690  DNA-binding transcriptional activator SdiA  25.32 
 
 		 240 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0029365  normal  0.0383701 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0610  LuxR family transcriptional regulator  23.45 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.317613 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0702  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  26.18 
 
 		 230 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.669136  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2024  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.18 
 
 		 230 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.896026  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2215  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  26.18 
 
 		 230 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.311283  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2150  DNA-binding transcriptional activator SdiA  26.52 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000560081  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4277  transcriptional regulator, LuxR family  22.57 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.343912 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1266  DNA-binding transcriptional activator SdiA  26.52 
 
 		 240 aa  57  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00315864  hitchhiker  0.00193945 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1044  DNA-binding transcriptional activator SdiA  26.52 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000369866  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5810  LuxR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.809704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6040  LuxR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.917081 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4064  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.93 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3098  transcriptional regulator, LuxR family  24.35 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.521704  normal  0.269359 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2503  DNA-binding transcriptional activator SdiA  26.36 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000339648  normal  0.514976 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1407  LuxR family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.959158  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0356  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.78 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165726  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0020  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0444  ATP-dependent transcription regulator LuxR  23.66 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.853961  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>