More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1575 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1575  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 234 aa  456  1e-127  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.629023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2507  LuxR family transcriptional regulator  56.64 
 
 		 239 aa  262  4e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.883175  normal  0.509717 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2247  LuxR family transcriptional regulator  56.09 
 
 		 239 aa  256  3e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.788747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0350  LuxR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 253 aa  235  4e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49700  transcriptional regulator  43.83 
 
 		 243 aa  151  8e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0702  LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 245 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6408  LuxR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 248 aa  89  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6378  LuxR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 248 aa  89  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1003  transcriptional regulator, LuxR family  32.34 
 
 		 245 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383688  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0282  transcriptional regulator, LuxR family  36.02 
 
 		 246 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.419752  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3321  LuxR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 240 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.214587 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3898  transcriptional regulator LasR  29.33 
 
 		 239 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.219668  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4514  autoinducer-binding domain-containing protein  34.94 
 
 		 243 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.447162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45960  transcriptional regulator LasR  28.57 
 
 		 239 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4977  transcriptional regulator, LuxR family  34.94 
 
 		 243 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.142556 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5029  transcriptional regulator, LuxR family  33.73 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.771298  normal  0.575652 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0965  transcriptional activator protein LuxR  22.04 
 
 		 248 aa  73.9  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.266935  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2957  transcriptional regulator protein  27.95 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.923766  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1766  transcriptional regulator, LuxR family  32.93 
 
 		 244 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182775  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5040  LuxR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 229 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350334  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3863  transcriptional regulator PsyR  30.68 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.831721  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1709  autoinducer-binding domain-containing protein  38.51 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.781724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0460  transcriptional regulator, LuxR family  28.57 
 
 		 253 aa  67  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.343765 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0122  LuxR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1758  autoinducer-binding domain-containing protein  37.84 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5762  LuxR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 242 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.225342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5462  LuxR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 245 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.191354 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1673  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.86 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.619826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2943  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.86 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1622  LuxR transcriptional regulator  30.68 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.831315  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4168  transcriptional regulator, LuxR family  31.98 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0958  transcriptional activator protein LuxR  24.19 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5809  transcriptional regulator, LuxR family  34.73 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.962539  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3840  transcriptional regulator, LuxR family  30.29 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0627  LuxR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 241 aa  63.2  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.253164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2417  LuxR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0548  transcriptional regulator, LuxR family  32.12 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.216848  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2528  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.86 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0341229 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4984  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.86 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0145131 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0918  transcriptional regulator LuxR family  28.34 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0505  transcriptional regulator, LuxR family  31.79 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3098  transcriptional regulator, LuxR family  30.46 
 
 		 254 aa  61.6  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.521704  normal  0.269359 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1212  LuxR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 251 aa  62  0.000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2330  transcriptional regulator, LuxR family  31.14 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0440  regulatory protein LuxR  31.84 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0539143 
 
 
-
 
NC_004310  BR0190  LuxR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.195449  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2174  regulatory protein, LuxR  31.14 
 
 		 240 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.795683 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2872  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.25 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7112  LuxR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0985225  normal  0.773577 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3380  two component LuxR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 259 aa  60.1  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277634 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5323  transcriptional regulator two component heavy metal regulatory response ZniR  53.23 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.844748 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1407  LuxR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.959158  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5810  LuxR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.809704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6040  LuxR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.917081 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0183  LuxR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0816251  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0323  transcriptional regulator, LuxR family  31.84 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0797  transcriptional regulator, LuxR family  30.82 
 
 		 240 aa  58.5  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205827  normal  0.24043 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2093  two component LuxR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000328625  normal  0.180863 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0351  LuxR family transcriptional regulator  59.26 
 
 		 258 aa  58.5  0.00000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.637296  normal  0.0151595 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2215  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  27.07 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.311283  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0702  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  27.07 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.669136  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2128  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  27.07 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.423434  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1576  LuxR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.893939  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0617  LuxR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0241474  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2024  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.07 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.896026  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3395  LuxR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 260 aa  58.2  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1153  LuxR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.446836 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.47 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0441  regulatory protein LuxR  30.82 
 
 		 286 aa  57.8  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.923746  normal  0.0183899 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1971  two component LuxR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.356635  normal  0.773651 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1549  LuxR transcriptional regulator  58.82 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.355184  normal  0.152747 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1927  LuxR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4396  LuxR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4435  LuxR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9665  two-component transcriptional regulator LuxR family  28.9 
 
 		 240 aa  57  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.024682  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3199  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.66 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3108  LuxR response regulator receiver  26.83 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6399  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.07 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.139442 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3515  two component LuxR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 214 aa  57  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.150532  hitchhiker  0.00248481 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0020  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.23 
 
 		 229 aa  57  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0228  LuxR family two component transcriptional regulator  48.53 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1406  DNA-binding response regulator  30 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.253896  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0686  two component LuxR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4114  putative transcriptional activator  27.78 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  0.314154 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4279  LuxR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 321 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189781  normal  0.0123236 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3386  putative transcriptional regulator  28.33 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.247592  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0268  two component LuxR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0126561  normal  0.200699 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39980  putative transcriptional regulator  27.78 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2171  ATP-dependent transcription regulator LuxR  34.09 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0944598  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1443  ATP-dependent transcription regulator LuxR  34.09 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0542  ATP-dependent transcription regulator LuxR  34.09 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0444  ATP-dependent transcription regulator LuxR  34.09 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.853961  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0610  LuxR family transcriptional regulator  23.84 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.317613 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0854  ATP-dependent transcription regulator LuxR  34.09 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.777865  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2928  transcriptional regulator, LuxR family  30 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.258432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2301  LuxR family transcriptional regulator  52.46 
 
 		 267 aa  55.5  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4277  transcriptional regulator, LuxR family  24.26 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.343912 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2344  two component LuxR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1819  putative transcriptional regulator  27.9 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0145412  normal  0.357363 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>