53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0414 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0414  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 222 aa  470  1e-132  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3280  transcriptional regulator, LuxR family  46.61 
 
 		 229 aa  226  2e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.158452  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3202  transcriptional regulator, LuxR family  45.7 
 
 		 229 aa  224  7e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4193  LuxR family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 229 aa  220  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1045  transcriptional regulator, LuxR family  44.8 
 
 		 229 aa  218  7e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0816  transcriptional regulator, LuxR family  43.44 
 
 		 229 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0422  transcriptional regulator, LuxR family  25 
 
 		 227 aa  90.5  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0371  transcriptional regulator, LuxR family  25 
 
 		 227 aa  89.7  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0423  transcriptional regulator, LuxR family  27.59 
 
 		 221 aa  70.9  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0372  putative PAS/PAC sensor protein  28.08 
 
 		 221 aa  70.9  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1927  hypothetical protein  24.22 
 
 		 223 aa  52  0.000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0164  LuxR family transcriptional regulator  24.67 
 
 		 246 aa  50.4  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0153554  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46850  putative transcriptional regulator  23.12 
 
 		 230 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000531033 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0092  LuxR family transcriptional regulator  21.6 
 
 		 267 aa  49.7  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1512  LuxR family transcriptional regulator  21.6 
 
 		 252 aa  49.3  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.150572  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1275  transcription regulator LuxR family protein  21.13 
 
 		 268 aa  49.3  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.41093  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1595  LuxR family transcriptional regulator  21.6 
 
 		 254 aa  48.9  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0908  LuxR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 526 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0915  metal dependent phosphohydrolase  35.82 
 
 		 526 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.691229  decreased coverage  0.00674138 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0925  metal dependent phosphohydrolase  35.82 
 
 		 526 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1431  transcriptional regulator, LuxR family  36.71 
 
 		 498 aa  46.2  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0577596  normal  0.857351 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01821  LuxR family regulatory protein  36.21 
 
 		 92 aa  45.8  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1519  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.86 
 
 		 198 aa  45.8  0.0005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4037  putative transcriptional regulator  21.83 
 
 		 230 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.586307  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02261  LuxR family regulatory protein  36.21 
 
 		 90 aa  45.4  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0250136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26831  LuxR transcriptional regulator  36.21 
 
 		 92 aa  45.1  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01701  LuxR family regulatory protein  35.59 
 
 		 90 aa  45.1  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2264  LuxR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 91 aa  45.1  0.0009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.537119 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7055  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.48 
 
 		 219 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3850  two component LuxR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 224 aa  43.5  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1520  LuxR transcriptional regulator  34.48 
 
 		 91 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01711  LuxR family regulatory protein  40.43 
 
 		 92 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0156  LuxR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 92 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.749313  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4296  two component LuxR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 214 aa  44.3  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3030  two component LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 218 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3089  two component LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 218 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.109155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3046  two component LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 218 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.826568  normal  0.671191 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01731  LuxR family regulatory protein  40.43 
 
 		 92 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2791  LuxR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 180 aa  43.5  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0981  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.7 
 
 		 221 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2686  two component LuxR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 203 aa  42.7  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1619  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.17 
 
 		 234 aa  42.7  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1621  LuxR family transcriptional regulator  22.12 
 
 		 270 aa  42.7  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39510  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  31.67 
 
 		 216 aa  42.7  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.657091 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07094  histidine kinase  21.43 
 
 		 239 aa  42.7  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3337  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.33 
 
 		 254 aa  42.4  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0952095  normal  0.130531 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2406  LuxR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 92 aa  42.4  0.006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0287  LuxR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 92 aa  42.4  0.006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0924  response regulator receiver protein  42.11 
 
 		 359 aa  42.4  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0986  LuxR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 217 aa  42  0.007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1093  response regulator  30.26 
 
 		 217 aa  42  0.007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.120555  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3907  two component LuxR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 248 aa  41.6  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1743  two component transcriptional regulator, LuxR family  35 
 
 		 214 aa  41.6  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370009  normal  0.039988 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>