128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1023 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1023  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 684 aa  1333    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0436  transcriptional regulator, LuxR family  39.18 
 
 		 501 aa  61.2  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0523  transcriptional regulator, LuxR family  31.52 
 
 		 511 aa  60.8  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.500884  normal  0.253762 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2795  transcriptional regulator, LuxR family  43.08 
 
 		 468 aa  58.9  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289432 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2816  transcriptional regulator, LuxR family  48.39 
 
 		 471 aa  57  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.138304  hitchhiker  0.00338242 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3038  transcriptional regulator, LuxR family  38.71 
 
 		 569 aa  55.8  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2824  transcriptional regulator, LuxR family  34.83 
 
 		 550 aa  55.1  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0530  transcriptional regulator, LuxR family  34.94 
 
 		 217 aa  54.7  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0514  transcriptional regulator, LuxR family  37.1 
 
 		 493 aa  54.7  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.559597 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0506  transcriptional regulator, LuxR family  32 
 
 		 519 aa  54.3  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.274884 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4769  transcriptional regulator, LuxR family  43.33 
 
 		 284 aa  53.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.141742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02650  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  32 
 
 		 505 aa  52.8  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0289  transcriptional regulator, LuxR family  42.37 
 
 		 498 aa  52.8  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.797409 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0615  transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 462 aa  52.8  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000110739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03610  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  46.3 
 
 		 470 aa  52  0.00003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.166414  normal  0.0491532 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0992  transcriptional regulator, LuxR family  44.64 
 
 		 493 aa  52.4  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3038  LuxR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 950 aa  52  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2290  transcriptional regulator, LuxR family  42.11 
 
 		 493 aa  52  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.10968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2812  transcriptional regulator, LuxR family  36.67 
 
 		 522 aa  51.2  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000674561  hitchhiker  0.0000653029 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0171  transcriptional regulator, LuxR family  36.26 
 
 		 484 aa  50.8  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  26.84 
 
 		 2914 aa  50.8  0.00008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01507  putative transcriptional regulator, LuxR family protein  35.37 
 
 		 159 aa  50.1  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.993499  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0341  transcriptional regulator, LuxR family  39.34 
 
 		 478 aa  50.1  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.953627  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03679  transcription regulator protein  35.14 
 
 		 299 aa  49.3  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000906887  normal  0.0907157 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2762  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  35.59 
 
 		 520 aa  49.7  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2166  response regulator receiver protein  40 
 
 		 247 aa  49.3  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2696  transcriptional regulator, LuxR family  35.9 
 
 		 535 aa  49.7  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3528  transcriptional regulator, LuxR family  37.66 
 
 		 178 aa  49.7  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.993919  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3596  transcriptional regulator, LuxR family  37.66 
 
 		 178 aa  49.7  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.445896  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4328  transcriptional regulator, LuxR family  35.71 
 
 		 260 aa  49.7  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00000000127099  normal  0.0225245 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2699  transcriptional regulator, LuxR family  39.02 
 
 		 478 aa  49.3  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0423  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  36.36 
 
 		 1003 aa  49.3  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16610  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  30.84 
 
 		 491 aa  49.3  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0119595  normal  0.714327 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0123  transcriptional regulator, LuxR family  40.68 
 
 		 492 aa  50.1  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.891774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2758  transcriptional regulator, LuxR family  27.64 
 
 		 523 aa  49.7  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0531  transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 529 aa  49.7  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.614613  normal  0.848046 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0630  transcriptional regulator, LuxR family  37.93 
 
 		 528 aa  49.7  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1592  transcriptional regulator, LuxR family  37.93 
 
 		 518 aa  49.3  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000355637 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2114  transcriptional regulator, LuxR family  41.27 
 
 		 191 aa  49.7  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000451621  normal  0.459179 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2353  transcriptional regulator, LuxR family  38.1 
 
 		 516 aa  48.9  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3999  transcriptional regulator, LuxR family  38.1 
 
 		 260 aa  49.3  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4275  transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 894 aa  48.9  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06100  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  37.29 
 
 		 518 aa  48.9  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.603093 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01760  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  44.23 
 
 		 546 aa  48.9  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000265618 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0597  transcriptional regulator, LuxR family  34.72 
 
 		 493 aa  48.9  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.882562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3447  LuxR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 175 aa  48.9  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2723  transcriptional regulator, LuxR family  42.31 
 
 		 509 aa  48.5  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.397924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2665  transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 		 359 aa  48.5  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.564836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26890  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  32.65 
 
 		 515 aa  48.5  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0496  transcriptional regulator, LuxR family  37.93 
 
 		 510 aa  48.5  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.484054 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3555  response regulator receiver protein  42.31 
 
 		 176 aa  48.1  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1678  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  43.33 
 
 		 910 aa  48.1  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2258  transcriptional regulator, LuxR family  38.98 
 
 		 476 aa  48.1  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1389  transcriptional regulator, LuxR family  29.76 
 
 		 320 aa  47.8  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3022  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  41.18 
 
 		 485 aa  47.8  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.709367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 292 aa  47.4  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.350857 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2358  regulatory protein, LuxR  39.06 
 
 		 483 aa  47.4  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2291  regulatory protein LuxR  35.85 
 
 		 934 aa  47.4  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2779  transcriptional regulator, LuxR family  35.06 
 
 		 505 aa  47.4  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.980405 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05580  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  32.84 
 
 		 512 aa  47.4  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.735856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25010  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  37.5 
 
 		 484 aa  47.4  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3812  transcriptional regulator, LuxR family  35.48 
 
 		 927 aa  47.4  0.0009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142204  normal  0.0901624 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4255  LuxR family transcriptional regulator  42 
 
 		 227 aa  46.6  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0102406 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3710  LuxR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 426 aa  47  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4086  transcriptional regulator, LuxR family  38.89 
 
 		 959 aa  47  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.105743  hitchhiker  0.000559176 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2286  regulatory protein LuxR  34.43 
 
 		 961 aa  46.6  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0207  transcriptional regulator, LuxR family  38.46 
 
 		 435 aa  47  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.314415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2046  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.48 
 
 		 219 aa  47  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1738  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.44 
 
 		 219 aa  47  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0459515  normal  0.949758 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20840  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  33.87 
 
 		 524 aa  46.6  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.982335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27360  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  27.93 
 
 		 517 aa  46.6  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0445329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0461  transcriptional regulator, LuxR family  26.32 
 
 		 542 aa  47  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0518  transcriptional regulator, LuxR family  35.29 
 
 		 488 aa  47.4  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.982453  normal  0.339001 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  44.23 
 
 		 917 aa  46.6  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1737  regulatory protein LuxR  40.32 
 
 		 231 aa  46.6  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117285  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3545  LuxR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 394 aa  45.8  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3973  putative GAF sensor protein  39.66 
 
 		 399 aa  45.8  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.057323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1151  two-component response regulator  33.63 
 
 		 248 aa  46.6  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2916  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  39.68 
 
 		 905 aa  46.6  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.725762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4648  two component LuxR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 219 aa  46.6  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4781  LuxR family transcriptional regulator  42 
 
 		 227 aa  46.6  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0502492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3355  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 208 aa  46.6  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.687232  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2367  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.58 
 
 		 226 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1879  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  35.59 
 
 		 839 aa  46.6  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2417  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.58 
 
 		 226 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  32.31 
 
 		 536 aa  46.2  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13550  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  34.12 
 
 		 506 aa  45.8  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0341  two component LuxR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 216 aa  45.8  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3839  regulatory protein, LuxR  38 
 
 		 268 aa  45.4  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2837  response regulator receiver protein  36.07 
 
 		 262 aa  45.4  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00000311945  normal  0.812847 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5188  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  42 
 
 		 884 aa  45.4  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3994  transcriptional regulator MalT  33.33 
 
 		 903 aa  45.4  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4222  ATP-dependent transcription regulator LuxR  43.75 
 
 		 309 aa  45.8  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.157864 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0766  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  43.1 
 
 		 840 aa  45.4  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.310851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08650  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  32.14 
 
 		 508 aa  45.8  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.197798  normal  0.463051 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0133  transcriptional regulator, LuxR family  38.18 
 
 		 480 aa  45.4  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.384824 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0473  transcriptional regulator, LuxR family  35.9 
 
 		 488 aa  45.8  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.815594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0617  transcriptional regulator, LuxR family  36.11 
 
 		 505 aa  45.8  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0935525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0971  transcriptional regulator, LuxR family  34.43 
 
 		 313 aa  45.4  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.16732  hitchhiker  0.00115778 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1903  transcriptional regulator, LuxR family  35.53 
 
 		 196 aa  45.8  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000231921 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>