More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0514 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0514  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 206 aa  414  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.520301 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4087  LuxR family transcriptional regulator  44.1 
 
 		 183 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0386906 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1878  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.52 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3796  two component LuxR family transcriptional regulator  57.81 
 
 		 209 aa  74.7  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1499  LuxR family two component transcriptional regulator  56.25 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0530  two component LuxR family transcriptional regulator  59.38 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3850  two component LuxR family transcriptional regulator  53.62 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0241  LuxR family transcriptional regulator  57.81 
 
 		 216 aa  70.9  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1063  LuxR family DNA-binding response regulator  56.9 
 
 		 232 aa  65.9  0.0000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.815436  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0648  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.74 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_934  DNA-binding response regulator, LuxR family  55.17 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.717523  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1385  two component LuxR family transcriptional regulator  54.1 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1317  response regulator  44.59 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.500574  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0945  two component LuxR family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 232 aa  63.5  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0513  transcriptional regulator  47.62 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.934447 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6169  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.41 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2911  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.54 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2093  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000328625  normal  0.180863 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1744  response regulator receiver protein  50 
 
 		 213 aa  62  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.933486  normal  0.721753 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3108  LuxR response regulator receiver  50.88 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4290  two component LuxR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 218 aa  61.2  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1881  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.77 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0160211  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1997  two component LuxR family transcriptional regulator  50.77 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1966  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.77 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1700  two component LuxR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2041  response regulator receiver protein  57.14 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212509  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0385  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0686  two component LuxR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0181  two component LuxR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3282  LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4715  Two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3186  two component LuxR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0678517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1825  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.82 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0736095 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3729  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.72 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1431  LuxR family DNA-binding response regulator  48.21 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.338793 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2312  two-component response regulator transcription regulator protein  44.44 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.500036 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2299  two component LuxR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2445  two component LuxR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0154  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.48 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2400  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.21 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3275  response regulator FixJ  56.14 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1103  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.43 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1732  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.97 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3576  two component LuxR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2735  response regulator receiver  35.42 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0572845  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6399  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.36 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.139442 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3192  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.46 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.513085  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3790  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 226 aa  58.5  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1233  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.79 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.792953 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0438  transcriptional regulatory protein UhpA  38.04 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3406  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.588591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0851  DNA-binding response regulator  39.74 
 
 		 223 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0464733  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0894  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2788  response regulator FixJ  41.67 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0210669  normal  0.0766422 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2151  DNA-binding response regulator  39.74 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.639034  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1518.1  DNA-binding response regulator  39.74 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000399536  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2085  DNA-binding response regulator  39.24 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.844485  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0560  DNA-binding response regulator  39.74 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0224831  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2062  LuxR family DNA-binding response regulator  39.74 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0947149  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1701  two component LuxR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0166117  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0766  DNA-binding response regulator  39.74 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2579  response regulator FixJ  51.61 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6049  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.56 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.764436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2960  LuxR family transcriptional regulator  56.86 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00617969  normal  0.0717872 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2977  response regulator receiver protein  53.57 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.286368 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1293  LuxR family DNA-binding response regulator  48.21 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4219  two component LuxR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186755  normal  0.698621 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0898  two component LuxR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000112877  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0977  two component LuxR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00800748  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0211  two component LuxR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 228 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.664514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1135  two component LuxR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.564331  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3082  two component LuxR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0470395  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0829  two component LuxR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121621 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1691  two component LuxR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0637899 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1810  two component LuxR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6495  two component LuxR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1021  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.794365 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4727  response regulator FixJ  50 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1552  response regulator receiver protein  45.61 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1363  response regulator FixJ  50 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1486  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.108748  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22220  Transcriptional regulator, LuxR family  50.85 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1311  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.37 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.165019  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0732  response regulator receiver protein  53.57 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.298469  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1854  LuxR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2682  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.18 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5742  two component LuxR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.505537  normal  0.963827 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3764  response regulator receiver  40.51 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.321181  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2033  LuxR family DNA-binding response regulator  47.54 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0306  two component LuxR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000161342  hitchhiker  0.00000159266 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3042  two component LuxR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.280021 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1342  response regulator FixJ  50 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.400465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4527  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.57 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.658241 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2324  two component LuxR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3387  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.27 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000386408  hitchhiker  0.000570848 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1472  two component LuxR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.781461 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1539  two component LuxR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.274992 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1440  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.77 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2593  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.85 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.382122  hitchhiker  0.00235574 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5189  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.33 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.814448  normal  0.223105 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>