More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4087 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4087  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 183 aa  363  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0386906 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0514  LuxR family transcriptional regulator  44.1 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.520301 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3796  two component LuxR family transcriptional regulator  58.44 
 
 		 209 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1878  two component transcriptional regulator, LuxR family  69.64 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1499  LuxR family two component transcriptional regulator  67.86 
 
 		 209 aa  79  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3850  two component LuxR family transcriptional regulator  67.86 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0241  LuxR family transcriptional regulator  60.66 
 
 		 216 aa  76.3  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0530  two component LuxR family transcriptional regulator  60.32 
 
 		 211 aa  75.5  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_934  DNA-binding response regulator, LuxR family  42.16 
 
 		 232 aa  66.2  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.717523  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1385  two component LuxR family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0945  two component LuxR family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 232 aa  64.7  0.0000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1063  LuxR family DNA-binding response regulator  43.18 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.815436  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1293  LuxR family DNA-binding response regulator  54.24 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1825  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0736095 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2093  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000328625  normal  0.180863 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1103  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1317  response regulator  48.33 
 
 		 220 aa  62  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.500574  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2041  response regulator receiver protein  40.86 
 
 		 214 aa  62  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212509  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3108  LuxR response regulator receiver  47.62 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3919  two component LuxR family transcriptional regulator  39 
 
 		 210 aa  60.8  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3833  putative DNA-binding response regulator EsrB  39 
 
 		 210 aa  60.8  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0851  DNA-binding response regulator  44.59 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0464733  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3945  putative DNA-binding response regulator EsrB  39 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0480381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0686  two component LuxR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1701  two component LuxR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0166117  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  39.77 
 
 		 938 aa  59.7  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22220  Transcriptional regulator, LuxR family  52.63 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1495  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.82 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.194449  normal  0.395611 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1518.1  DNA-binding response regulator  44.59 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000399536  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2062  LuxR family DNA-binding response regulator  44.59 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0947149  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0560  DNA-binding response regulator  44.59 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0224831  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2151  DNA-binding response regulator  44.59 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.639034  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2400  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.46 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1233  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.57 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.792953 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0766  DNA-binding response regulator  44.59 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2977  response regulator receiver protein  39.8 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.286368 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2085  DNA-binding response regulator  45.21 
 
 		 264 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.844485  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0181  two component LuxR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1700  two component LuxR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2380  response regulator receiver protein  45.59 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0732  response regulator receiver protein  42.11 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.298469  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1888  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.85 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.265772 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1135  two component LuxR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.564331  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3082  two component LuxR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0470395  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1552  response regulator receiver protein  50.88 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0560  transcriptional regulator, LuxR family protein  43.66 
 
 		 222 aa  58.2  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0385  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.31 
 
 		 224 aa  57.8  0.00000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1311  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.85 
 
 		 226 aa  57.8  0.00000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.165019  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1597  response regulator transcription regulator protein  44.87 
 
 		 210 aa  57  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1761  transcriptional regulator, LuxR family  52.38 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247672  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6835  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80633  normal  0.285546 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0276  two component transcription LuxR family regulatory protein  51.72 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00306595  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2911  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.21 
 
 		 209 aa  57  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0704  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.11 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.753304  normal  0.399327 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1960  LuxR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1943  two component LuxR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2445  two component LuxR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3192  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.88 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.513085  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0977  two component LuxR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00800748  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06170  response regulator  51.92 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.624626  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2771  two component LuxR family transcriptional regulator  54.72 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2674  two component LuxR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00996  response regulator  51.92 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0885199  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2960  LuxR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00617969  normal  0.0717872 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0513  transcriptional regulator  43.42 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.934447 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6032  response regulator receiver protein  54.72 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2246  two component LuxR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0703025  hitchhiker  0.00413313 
 
 
-
 
NC_002950  PG1431  LuxR family DNA-binding response regulator  47.17 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.338793 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3982  two component LuxR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0179399 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0083  two component LuxR family transcriptional regulator  53.45 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2635  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.79 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000528497  hitchhiker  0.00476816 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3263  transcriptional regulator, LuxR family  47.62 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19467  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2356  response regulator receiver protein  52.63 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.504321 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3282  LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4101  two component LuxR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.878116  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1621  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.59 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.171805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4290  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3273  LuxR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2682  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.89 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2222  response regulator FixJ  47.69 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0446915  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5293  two component LuxR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1949  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.72 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24135  normal  0.0521212 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06630  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  44.83 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.252447  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0544  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.27 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0105  two component LuxR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0303042  normal  0.309888 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4163  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296115  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2791  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.91 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0590322  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4976  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.36 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.289575  normal  0.034027 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1389  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.25 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.744509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0894  two component LuxR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1131  two component LuxR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0589444  normal  0.612677 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5540  response regulator receiver protein  49.06 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0494649 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4715  Two component LuxR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 264 aa  55.5  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1691  two component LuxR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0637899 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4282  two component LuxR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1946  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.41 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3601  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.21 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.324048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1881  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.94 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0160211  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2884  two component LuxR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 229 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.538425 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>