More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2771 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2771  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 206 aa  398  9.999999999999999e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2788  response regulator FixJ  33.66 
 
 		 205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0210669  normal  0.0766422 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 210 aa  106  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2041  response regulator receiver protein  37.76 
 
 		 214 aa  105  5e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212509  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2344  two component LuxR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 208 aa  102  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2222  response regulator FixJ  36.18 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0446915  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5633  response regulator receiver protein  37.89 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.938686  normal  0.508699 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0268  two component LuxR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 203 aa  98.2  8e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0126561  normal  0.200699 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1825  two component transcriptional regulator, LuxR family  38 
 
 		 205 aa  97.8  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0736095 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1616  two component LuxR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 218 aa  97.4  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1621  two component LuxR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 201 aa  97.8  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3389  response regulator receiver protein  37.95 
 
 		 211 aa  97.1  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3850  two component LuxR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 209 aa  96.3  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1743  two component LuxR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 209 aa  95.9  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6273  response regulator FixJ  33.85 
 
 		 204 aa  95.5  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal  0.544702 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0630  response regulator FixJ  36.36 
 
 		 204 aa  94  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.136769  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4727  response regulator FixJ  32 
 
 		 203 aa  94.4  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1717  two component LuxR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 205 aa  93.2  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1744  response regulator receiver protein  36.5 
 
 		 213 aa  93.2  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.933486  normal  0.721753 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1906  response regulator FixJ  34.15 
 
 		 205 aa  93.2  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.700153  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0811  two-component response regulator  32.47 
 
 		 209 aa  91.7  6e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1499  LuxR family two component transcriptional regulator  34.16 
 
 		 209 aa  91.7  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3812  two component LuxR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 208 aa  91.7  8e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.922787  normal  0.026414 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6046  two component LuxR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 502 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1878  two component transcriptional regulator, LuxR family  32 
 
 		 208 aa  90.9  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5418  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.31 
 
 		 774 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5090  two component LuxR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 214 aa  90.1  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.159727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3082  two component LuxR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 201 aa  90.1  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0470395  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3796  two component LuxR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 209 aa  90.1  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3240  two component LuxR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 207 aa  90.5  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.989265 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5186  two component LuxR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 214 aa  90.1  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0233056 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3181  two component LuxR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 214 aa  90.1  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.246114  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2977  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 208 aa  89  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.286368 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5088  two component LuxR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 241 aa  88.6  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.685625 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3183  response regulator receiver protein  33.16 
 
 		 191 aa  89  5e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5293  two component LuxR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 203 aa  89  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0400  two component LuxR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 202 aa  88.6  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1135  two component LuxR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 201 aa  87.8  9e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.564331  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4101  two component LuxR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 229 aa  87.8  9e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.878116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4877  PAS sensor protein  39.38 
 
 		 643 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3910  two component LuxR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 210 aa  87.8  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.855973 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2505  two component LuxR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 210 aa  87.8  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.382458  normal  0.897172 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4618  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  87.8  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1578  two component LuxR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 207 aa  87.4  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.661779  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3610  two component LuxR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 210 aa  87.8  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0943  two component LuxR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 214 aa  87.4  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1597  response regulator transcription regulator protein  31.88 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2166  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.08 
 
 		 220 aa  86.7  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6902  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.03 
 
 		 210 aa  86.7  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.173656  normal  0.571333 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3275  response regulator FixJ  35.57 
 
 		 205 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1229  two component LuxR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 502 aa  87  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0530  two component LuxR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 211 aa  86.3  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1363  response regulator FixJ  30.46 
 
 		 205 aa  86.3  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1621  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.4 
 
 		 211 aa  85.9  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.171805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4219  two component LuxR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 212 aa  85.9  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186755  normal  0.698621 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4961  two component LuxR family transcriptional regulator  36.98 
 
 		 214 aa  85.5  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.373586  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3199  two component LuxR family transcriptional regulator  36.98 
 
 		 214 aa  85.5  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.529866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1204  two component LuxR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 213 aa  85.1  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1949  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.4 
 
 		 211 aa  85.1  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24135  normal  0.0521212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0241  LuxR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 216 aa  85.1  7e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3516  two component LuxR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 210 aa  84.7  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584359  normal  0.0331166 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3794  response regulator receiver protein  35.14 
 
 		 215 aa  84.3  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2232  LuxR family DNA-binding response regulator  32.52 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1723  LuxR family DNA-binding response regulator  32.52 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0901353  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0686  two component LuxR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 203 aa  84.3  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3087  LuxR family DNA-binding response regulator  32.52 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2748  LuxR family DNA-binding response regulator  32.52 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1632  two component LuxR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 232 aa  84  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3866  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 224 aa  84  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2614  LuxR family DNA-binding response regulator  32.52 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.37823  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1505  LuxR family DNA-binding response regulator  32.52 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2670  LuxR family DNA-binding response regulator  32.52 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5346  two component LuxR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 210 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0593225  normal  0.752943 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2117  response regulator FixJ  32.63 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2049  two component LuxR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5445  two component LuxR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1862  LuxR family DNA-binding response regulator  32.52 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5540  response regulator receiver protein  30.65 
 
 		 226 aa  83.6  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0494649 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4053  response regulator FixJ  31.07 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2791  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.63 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0590322  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2139  two component LuxR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1131  two component LuxR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0589444  normal  0.612677 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2157  two component LuxR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2176  two component LuxR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116055  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2968  two component LuxR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.138 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5938  two component LuxR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.172889  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1552  response regulator receiver protein  33.16 
 
 		 199 aa  82  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6853  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.19 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3813  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.21 
 
 		 202 aa  81.6  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0276  two component transcription LuxR family regulatory protein  30.32 
 
 		 224 aa  81.6  0.000000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00306595  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2095  response regulator receiver protein  29.29 
 
 		 216 aa  81.6  0.000000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3506  response regulator receiver  34.21 
 
 		 202 aa  81.6  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.32714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5362  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.34 
 
 		 643 aa  81.6  0.000000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1472  two component LuxR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 214 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.781461 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0181  two component LuxR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 210 aa  81.3  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3400  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.68 
 
 		 201 aa  81.3  0.000000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2400  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.12 
 
 		 210 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5693  two component LuxR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 224 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.247452 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1539  two component LuxR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 214 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.274992 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4126  response regulator receiver protein  31.31 
 
 		 202 aa  80.9  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>