More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4005 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_4005  response regulator receiver protein  100 
 
 		 263 aa  540  1e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0669  GAF modulated transcriptional regulator, LuxR family  29.41 
 
 		 285 aa  72.8  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.395168  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4205  ATPase-like protein  42.05 
 
 		 963 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181289  hitchhiker  0.00519851 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3089  two component LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 219 aa  58.5  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2610  transcriptional regulator, LuxR family  38.3 
 
 		 981 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.701031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3378  LuxR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.394495  normal  0.0844825 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2151  two component LuxR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104213 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1355  two component LuxR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3921  putative transcriptional regulator  41.67 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3878  putative transcriptional regulator  41.67 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3813  putative transcriptional regulator  41.67 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3800  putative transcriptional regulator  41.67 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3981  putative transcriptional regulator  41.67 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.347336 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4255  LuxR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0102406 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0465  two component transcriptional regulator  37.04 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03368  predicted DNA-binding response regulator in two-component regulatory system  43.33 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000358261  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0193  transcriptional regulator, LuxR family  43.33 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000210245  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3925  transcriptional regulator, LuxR family  43.33 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.237516  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3723  LuxR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1738  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.71 
 
 		 219 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0459515  normal  0.949758 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2046  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.71 
 
 		 219 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4781  LuxR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 227 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0502492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3824  LuxR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201276 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2511  two component LuxR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 229 aa  55.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0197  two component LuxR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000437068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4008  LuxR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03321  hypothetical protein  43.33 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00023179  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1291  two component LuxR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 215 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0236  LuxR family two component transcriptional regulator  40.3 
 
 		 218 aa  54.3  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2486  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 208 aa  54.3  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4883  transcriptional regulator, LuxR family  43.33 
 
 		 200 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2373  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.58 
 
 		 192 aa  54.3  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4078  hypothetical protein  47.46 
 
 		 243 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0439982  normal  0.0668702 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4027  DNA-binding response regulator, LuxR family  38.24 
 
 		 215 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1384  LuxR response regulator receiver  38.24 
 
 		 215 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3254  two component LuxR family transcriptional regulator  45 
 
 		 201 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49762 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4275  two component LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 226 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.798613  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2341  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.98 
 
 		 209 aa  53.9  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.193906 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  38.24 
 
 		 940 aa  53.5  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0236  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.25 
 
 		 224 aa  53.5  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.68 
 
 		 225 aa  53.1  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1373  DNA-binding response regulator, LuxR family  44.83 
 
 		 238 aa  53.1  0.000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2107  two component LuxR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 245 aa  52.8  0.000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38490  Response regulator, LuxR family  39.71 
 
 		 215 aa  52.8  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 228 aa  52.8  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0110  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.19 
 
 		 222 aa  52.8  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4896  ATPase-like protein  42.86 
 
 		 957 aa  52.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0338073  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2811  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 217 aa  52.4  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.206772  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0228  LuxR family two component transcriptional regulator  39.06 
 
 		 206 aa  52.4  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1635  LuxR family two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 216 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5595  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.38 
 
 		 215 aa  52.4  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4082  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 216 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3229  two component LuxR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 224 aa  52  0.000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.11 
 
 		 213 aa  52  0.000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1237  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 216 aa  52  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000317123 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0190  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.49 
 
 		 219 aa  51.6  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.146862  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2563  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.86 
 
 		 229 aa  51.6  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.127898  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  39.73 
 
 		 1022 aa  51.6  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0324  transcriptional regulator, LuxR family  36 
 
 		 938 aa  51.6  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3785  ATPase-like protein  43.04 
 
 		 937 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114558  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4366  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.91 
 
 		 225 aa  51.6  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4024  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 216 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000136895 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1558  response regulator receiver  41.27 
 
 		 221 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4163  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.8 
 
 		 208 aa  52  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296115  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0582  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.64 
 
 		 204 aa  52  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4547  transcriptional regulator, LuxR family  44.26 
 
 		 321 aa  51.6  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4937  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.93 
 
 		 224 aa  52  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.570807  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4062  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 216 aa  52  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19740  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  37.14 
 
 		 216 aa  50.8  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.682926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4608  two component LuxR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 275 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  36.67 
 
 		 917 aa  51.2  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3273  LuxR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 185 aa  51.2  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4039  two component LuxR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 250 aa  50.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.512873  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03853  transcriptional regulator NarL  36.99 
 
 		 217 aa  50.8  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000020037  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1828  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  40.68 
 
 		 216 aa  51.2  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4227  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 213 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624898 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4349  two component LuxR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 206 aa  50.8  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20794  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2218  two component LuxR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 221 aa  51.2  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1151  two-component response regulator  38.81 
 
 		 248 aa  51.2  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4749  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.07 
 
 		 223 aa  50.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0156  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.07 
 
 		 230 aa  50.4  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.379873  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6211  response regulator receiver protein  33.96 
 
 		 239 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.377169 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2594  transcriptional regulator, LuxR family  31.72 
 
 		 920 aa  50.4  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6933  two component LuxR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 244 aa  50.4  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.322421 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1446  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.57 
 
 		 223 aa  50.4  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 775 aa  50.4  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4428  two component LuxR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 231 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2449  two component LuxR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 211 aa  50.4  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4530  two component LuxR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 241 aa  50.1  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00470183 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7211  response regulator receiver protein  37.88 
 
 		 215 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0769384 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0155  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 		 242 aa  50.4  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.527048  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4334  transcriptional regulator, LuxR family  36.51 
 
 		 160 aa  49.7  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4636  transcriptional regulator, LuxR family  38.57 
 
 		 320 aa  49.7  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.701031  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0640  two component LuxR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 269 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2630  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.35 
 
 		 243 aa  50.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1487  two component LuxR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 231 aa  49.7  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0122618  normal  0.753042 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1626  two component LuxR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 194 aa  49.7  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.947018 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2171  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 		 227 aa  50.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1910  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.34 
 
 		 218 aa  49.7  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>