More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1484 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1484  DNA-binding response regulator, LuxR family  100 
 
 		 208 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1294  LuxR response regulator receiver  86.54 
 
 		 220 aa  355  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16350  putative two-component response regulator  48.56 
 
 		 213 aa  191  5e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1421  putative two-component response regulator  46.63 
 
 		 213 aa  184  8e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0289  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.83 
 
 		 212 aa  174  6e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4444  capsular synthesis regulator component B, putative  41.35 
 
 		 212 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4702  two component LuxR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 213 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.121015 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5845  LuxR response regulator receiver  43.96 
 
 		 214 aa  165  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3209  transcriptional regulator RcsB  42.65 
 
 		 216 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4641  two component LuxR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 213 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.169112  normal  0.068024 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1041  transcriptional regulator RcsB  41.43 
 
 		 218 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.140172  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1107  transcriptional regulator RcsB  42.44 
 
 		 216 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3017  transcriptional regulator RcsB  41.43 
 
 		 216 aa  161  5.0000000000000005e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3267  transcriptional regulator RcsB  40.95 
 
 		 216 aa  161  5.0000000000000005e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00059602  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1441  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.35 
 
 		 216 aa  161  6e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000259515  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3357  transcriptional regulator RcsB  41.35 
 
 		 216 aa  161  6e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000561339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2366  transcriptional regulator RcsB  41.35 
 
 		 216 aa  161  6e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000282288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1433  transcriptional regulator RcsB  41.35 
 
 		 216 aa  161  6e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0102563  hitchhiker  0.00285537 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2517  transcriptional regulator RcsB  41.35 
 
 		 216 aa  161  6e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000600529  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2357  transcriptional regulator RcsB  41.35 
 
 		 228 aa  161  7e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000398144  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2614  transcriptional regulator RcsB  41.35 
 
 		 216 aa  161  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.588596 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2406  transcriptional regulator RcsB  41.35 
 
 		 216 aa  161  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000625449  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2510  transcriptional regulator RcsB  41.35 
 
 		 216 aa  161  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.731723  normal  0.0675268 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2455  transcriptional regulator RcsB  41.35 
 
 		 216 aa  161  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427332  normal  0.0831575 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0721  transcriptional regulator RcsB  41.35 
 
 		 228 aa  161  7e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000245188  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2496  transcriptional regulator RcsB  41.35 
 
 		 216 aa  161  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.424983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1307  transcriptional regulator RcsB  41.43 
 
 		 217 aa  160  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0162714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2843  transcriptional regulator RcsB  41.43 
 
 		 217 aa  160  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2764  transcriptional regulator RcsB  41.43 
 
 		 217 aa  160  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.408225  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2797  transcriptional regulator RcsB  40.38 
 
 		 216 aa  159  4e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000283918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0155  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.31 
 
 		 212 aa  156  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4224  two component LuxR family transcriptional regulator  39.61 
 
 		 231 aa  148  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.322534  normal  0.434129 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0280  two component LuxR family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 229 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188137 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0170  capsular synthesis regulator component B  39.9 
 
 		 230 aa  145  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.443347  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1634  DNA-binding response regulator  39.9 
 
 		 230 aa  145  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.723228  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3677  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.58 
 
 		 229 aa  144  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0102182  hitchhiker  0.0000000000674126 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0354  two component LuxR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 217 aa  143  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0198  DNA-binding response regulator  39.13 
 
 		 230 aa  143  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292201  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2872  two component LuxR family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 235 aa  142  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891055  hitchhiker  0.000000000201971 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3041  two component LuxR family transcriptional regulator  39.35 
 
 		 215 aa  141  6e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000032992  normal  0.146168 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3287  two component LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 223 aa  141  7e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.404787 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1630  DNA-binding response regulator  35.82 
 
 		 220 aa  141  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0322132  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0142  DNA-binding response regulator  37.81 
 
 		 220 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0161  LuxR family DNA-binding response regulator  35.82 
 
 		 220 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4965  two component LuxR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 214 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.122556 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4071  two component LuxR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 221 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2880  two component LuxR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 224 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.345086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0258  LuxR response regulator receiver  38.65 
 
 		 230 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.752946  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3078  response regulator transcription regulator protein  39.42 
 
 		 222 aa  136  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0498276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4225  two component LuxR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 241 aa  136  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107538  normal  0.322545 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0187  LuxR response regulator receiver  36.82 
 
 		 220 aa  135  5e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3752  two component LuxR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 215 aa  135  5e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3595  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.83 
 
 		 215 aa  132  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5217  two component LuxR family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 224 aa  132  5e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0629  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.32 
 
 		 230 aa  131  9e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.452847  normal  0.285643 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0879  DNA-binding response regulator  40.58 
 
 		 210 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.888299  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0473  DNA-binding response regulator  40.58 
 
 		 210 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1797  DNA-binding response regulator  40.58 
 
 		 210 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6665  two component LuxR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0397086  normal  0.0268041 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1618  DNA-binding response regulator  40.58 
 
 		 210 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0685  capsular synthesis regulator component B  40.58 
 
 		 210 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.394747  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1640  capsular synthesis regulator component B  40.58 
 
 		 210 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0841891  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1403  DNA-binding response regulator  40.58 
 
 		 210 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.846273  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2674  DNA-binding response regulator  40.58 
 
 		 210 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1157  two component LuxR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.505737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3938  two component LuxR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 218 aa  128  6e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.189042  normal  0.262256 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3939  two component transcriptional regulator  38.57 
 
 		 300 aa  128  6e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.555587 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3273  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.38 
 
 		 215 aa  127  9.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5152  two component LuxR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.535465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3357  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.62 
 
 		 222 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3388  two-component response regulator transcription regulator protein  38.35 
 
 		 215 aa  125  5e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0201761  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3010  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.14 
 
 		 222 aa  124  7e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0283  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.95 
 
 		 208 aa  124  9e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.393471  normal  0.0532877 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11120  putative response regulator  37.38 
 
 		 214 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0735  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.28 
 
 		 213 aa  120  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3619  LuxR response regulator receiver  37.25 
 
 		 219 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3936  two component LuxR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 231 aa  120  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426907  normal  0.200888 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1693  LuxR response regulator receiver  36.32 
 
 		 214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.478316  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1021  putative response regulator  37.38 
 
 		 214 aa  118  6e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3081  two component LuxR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 217 aa  117  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.450994  normal  0.856151 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4699  two component LuxR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 246 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.372391  hitchhiker  0.00465492 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3018  LuxR family DNA-binding response regulator  37.14 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.214987  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0356  two component LuxR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 223 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4069  two component LuxR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59770  putative two component response regulator  37.14 
 
 		 231 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000114482  hitchhiker  1.6476100000000001e-18 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0630  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.18 
 
 		 234 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.210211 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4728  two component LuxR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.825096  normal  0.434564 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4692  two component LuxR family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00363591  hitchhiker  0.0000170982 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4205  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 225 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.712025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4229  two component LuxR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 215 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00851836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4235  two component LuxR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 215 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3667  two component LuxR family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 215 aa  108  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.849529  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0631  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.97 
 
 		 214 aa  108  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.151672 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1034  DNA-binding response regulator  36.53 
 
 		 221 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.315998  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2078  LuxR family DNA-binding response regulator  36.53 
 
 		 221 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2225  DNA-binding response regulator  36.53 
 
 		 221 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2022  DNA-binding response regulator  36.53 
 
 		 221 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6659  two component LuxR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 207 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000389797  hitchhiker  0.000384101 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4627  two component LuxR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 216 aa  106  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.527017  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1621  capsular synthesis response regulator transcription regulator protein  37.56 
 
 		 219 aa  105  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.848219 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>