More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3529 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3529  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 324 aa  646    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0854004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2577  transcriptional regulator, LuxR family  28.96 
 
 		 372 aa  99.8  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0769027  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3565  regulatory protein LuxR  32.54 
 
 		 376 aa  93.2  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2191  LuxR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 374 aa  90.1  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.218442  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2913  transcriptional regulator, LuxR family  30.95 
 
 		 356 aa  89.4  7e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000129888  hitchhiker  0.0000689146 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1687  transcriptional regulator, LuxR family  31.64 
 
 		 376 aa  89.4  9e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3188  LuxR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 368 aa  87.8  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0110301  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1758  transcriptional regulator, LuxR family  31.64 
 
 		 374 aa  87.4  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2488  LuxR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 359 aa  86.7  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.008035 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0956  transcriptional regulator, LuxR family  31.2 
 
 		 344 aa  83.2  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.886587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1037  transcriptional regulator, LuxR family  31.4 
 
 		 363 aa  80.9  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.760351 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2665  transcriptional regulator, LuxR family  30.33 
 
 		 359 aa  79.7  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.564836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3938  response regulator receiver protein  29.37 
 
 		 295 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal  0.0101023 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1021  transcriptional regulator, LuxR family  36.42 
 
 		 347 aa  75.9  0.0000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1468  transcriptional regulator, LuxR family protein  22.69 
 
 		 356 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.468229  hitchhiker  0.0000161531 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0440  LuxR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 323 aa  70.5  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0922  transcriptional regulator, LuxR family  29.34 
 
 		 378 aa  69.7  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2318  LuxR family transcriptional regulator  37 
 
 		 151 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3500  LuxR family transcriptional regulator  22.09 
 
 		 357 aa  63.2  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3378  LuxR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 249 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.394495  normal  0.0844825 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1438  LuxR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 367 aa  58.9  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0017227  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 1085 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2114  transcriptional regulator, LuxR family  47.37 
 
 		 191 aa  53.5  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000451621  normal  0.459179 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7170  LuxR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 240 aa  53.5  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516188  normal  0.21358 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3947  transcriptional regulator, LuxR family  41.43 
 
 		 250 aa  53.9  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.657672  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3591  two component LuxR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 240 aa  53.9  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.552533  hitchhiker  0.00313735 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4471  transcriptional regulator, LuxR family  45 
 
 		 680 aa  53.1  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.129361 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2742  LuxR response regulator receiver  49.12 
 
 		 219 aa  52.8  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2455  response regulator VSRC transcription regulator protein  47.37 
 
 		 221 aa  51.6  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2334  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.37 
 
 		 221 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.477601  normal  0.267999 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2880  two component LuxR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 219 aa  51.6  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.449931 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2635  response regulator receiver  51.92 
 
 		 207 aa  51.6  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.28 
 
 		 213 aa  51.2  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2723  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.37 
 
 		 221 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1151  two-component response regulator  40.85 
 
 		 248 aa  51.6  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0077  GAF sensor hybrid histidine kinase  50.94 
 
 		 588 aa  50.4  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2193  transcriptional regulator, LuxR family  45.9 
 
 		 258 aa  50.4  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1249  response regulator  45.45 
 
 		 245 aa  50.4  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0947405  normal  0.0892263 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2357  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.6 
 
 		 234 aa  50.1  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3423  sensor protein  47.46 
 
 		 496 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3311  response regulator receiver protein  46.67 
 
 		 321 aa  50.4  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.479786 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1819  LuxR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 339 aa  49.7  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.381464 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1879  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  37.35 
 
 		 839 aa  49.7  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0207  transcriptional regulator, LuxR family  42.11 
 
 		 435 aa  49.7  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.314415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 232 aa  49.7  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.173401  normal  0.808062 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2336  LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 322 aa  49.3  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.671494 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0947  LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 799 aa  49.7  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2534  ATP-dependent transcription regulator LuxR  47.27 
 
 		 925 aa  49.7  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.169149 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3502  two component LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 228 aa  49.3  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  41.51 
 
 		 917 aa  48.9  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2089  transcriptional regulator, LuxR family  47.06 
 
 		 959 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.840433 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 1137 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5165  two component LuxR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 231 aa  48.9  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.162111 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1738  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.82 
 
 		 219 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0459515  normal  0.949758 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2046  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.82 
 
 		 219 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2689  two component LuxR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 224 aa  48.9  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.270095  normal  0.632538 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3767  regulatory protein, LuxR  43.1 
 
 		 89 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.163758 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0354  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 222 aa  48.1  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0976  transcriptional regulator, LuxR family  48 
 
 		 501 aa  47.8  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.018057 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  37.14 
 
 		 919 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3038  LuxR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 950 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5633  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.27 
 
 		 203 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.603295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3355  two component LuxR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 232 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0447  two component LuxR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 244 aa  48.1  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.013193  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  49.02 
 
 		 887 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5022  LuxR family LuxR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 947 aa  48.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.362862  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1222  LuxR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 926 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3490  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 950 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.123756  normal  0.368778 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23080  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  48.28 
 
 		 545 aa  47.8  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.865531  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1613  transcriptional regulator, LuxR family  43.1 
 
 		 126 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0395666  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0612  LuxR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 252 aa  47.8  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 882 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4530  two component LuxR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 241 aa  47.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00470183 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3120  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.02 
 
 		 218 aa  47.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.954631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3596  transcriptional regulator, LuxR family  40.62 
 
 		 178 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.445896  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2829  transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 865 aa  47.4  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2171  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.24 
 
 		 227 aa  47.8  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2523  regulatory protein, LuxR  37.8 
 
 		 879 aa  47.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0180  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 216 aa  47.8  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.245465  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2497  two component LuxR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 229 aa  47.4  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000315398  normal  0.0281112 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3528  transcriptional regulator, LuxR family  40.62 
 
 		 178 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.993919  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0446  transcriptional regulator, LuxR family  48.21 
 
 		 963 aa  47.8  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00639292 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3555  response regulator receiver protein  43.86 
 
 		 176 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0473  transcriptional regulator, LuxR family  45.28 
 
 		 488 aa  47  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.815594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5014  two component LuxR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 209 aa  47  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.103708  normal  0.29037 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1345  putative transcriptional regulator  48.08 
 
 		 325 aa  47  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795893  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  44.23 
 
 		 818 aa  47  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1299  two component LuxR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 273 aa  47.4  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0170327 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15290  putative transcriptional regulator  48.08 
 
 		 325 aa  47  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0074929  hitchhiker  0.0000000000000265262 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2194  transcriptional regulator, LuxR family  51.72 
 
 		 937 aa  47  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2326  ATP-dependent transcription regulator LuxR  45.1 
 
 		 981 aa  47  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00645479 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0869  response regulator  46 
 
 		 321 aa  46.6  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1178  transcriptional regulator, LuxR family  42.11 
 
 		 1104 aa  47  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00127631  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4040  two component LuxR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 216 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.56786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3447  LuxR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 175 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 881 aa  47  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 881 aa  47  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2842  transcriptional regulator, LuxR family  33.67 
 
 		 492 aa  46.6  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3178  transcriptional regulator, LuxR family  44.83 
 
 		 1074 aa  47  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00421599  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 876 aa  47  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>