46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1438 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1438  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 367 aa  727    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0017227  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2577  transcriptional regulator, LuxR family  33.06 
 
 		 372 aa  122  9e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0769027  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1037  transcriptional regulator, LuxR family  30.81 
 
 		 363 aa  107  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.760351 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3938  response regulator receiver protein  31.49 
 
 		 295 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal  0.0101023 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2191  LuxR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 374 aa  95.9  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.218442  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3188  LuxR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 368 aa  95.5  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0110301  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2913  transcriptional regulator, LuxR family  29.71 
 
 		 356 aa  94.4  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000129888  hitchhiker  0.0000689146 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0956  transcriptional regulator, LuxR family  33.88 
 
 		 344 aa  94  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.886587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2665  transcriptional regulator, LuxR family  29.12 
 
 		 359 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.564836  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0922  transcriptional regulator, LuxR family  27.3 
 
 		 378 aa  92.4  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1687  transcriptional regulator, LuxR family  30.79 
 
 		 376 aa  86.7  7e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3565  regulatory protein LuxR  28.62 
 
 		 376 aa  85.1  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1758  transcriptional regulator, LuxR family  29.08 
 
 		 374 aa  84.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1021  transcriptional regulator, LuxR family  28.37 
 
 		 347 aa  81.3  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2488  LuxR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 359 aa  80.1  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.008035 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1468  transcriptional regulator, LuxR family protein  20.36 
 
 		 356 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.468229  hitchhiker  0.0000161531 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0440  LuxR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 323 aa  77  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3500  LuxR family transcriptional regulator  20.36 
 
 		 357 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3529  transcriptional regulator, LuxR family  31 
 
 		 324 aa  67  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0854004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2318  LuxR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 151 aa  60.8  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3333  putative GAF sensor protein  31.9 
 
 		 337 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000024047  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7170  LuxR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 240 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516188  normal  0.21358 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6247  transcriptional regulator, LuxR family  43.86 
 
 		 352 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.670073 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0520  transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 		 520 aa  47  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.1412 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19740  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  38.71 
 
 		 216 aa  45.8  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.682926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 876 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 881 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1062  transcriptional regulator, LuxR family  36.23 
 
 		 234 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 881 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0321  transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 524 aa  45.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5343  LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 361 aa  44.3  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0342945 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2525  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 		 215 aa  44.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3378  LuxR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 249 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.394495  normal  0.0844825 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4600  ATPase-like protein  38.71 
 
 		 963 aa  43.9  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0703519 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2465  LuxR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 273 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.54611  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0139  GAF modulated transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 506 aa  43.9  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0942  LuxR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 235 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.232709  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0630  LuxR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 273 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0768185  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0350  LuxR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 259 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1366  LuxR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 235 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4862  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 215 aa  43.5  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.146847 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1199  LuxR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 235 aa  43.5  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.791762  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1273  LuxR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 273 aa  43.5  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0925384  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3601  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.29 
 
 		 222 aa  43.5  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.324048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  40.74 
 
 		 189 aa  43.5  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  41.54 
 
 		 893 aa  42.7  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>