207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_3500 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_3500  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 357 aa  740    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1468  transcriptional regulator, LuxR family protein  89.36 
 
 		 356 aa  661    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.468229  hitchhiker  0.0000161531 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2577  transcriptional regulator, LuxR family  29.81 
 
 		 372 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0769027  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0922  transcriptional regulator, LuxR family  26.93 
 
 		 378 aa  137  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3565  regulatory protein LuxR  28.18 
 
 		 376 aa  137  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1037  transcriptional regulator, LuxR family  27.67 
 
 		 363 aa  132  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.760351 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2665  transcriptional regulator, LuxR family  28.12 
 
 		 359 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.564836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2191  LuxR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 374 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.218442  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2913  transcriptional regulator, LuxR family  27.88 
 
 		 356 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000129888  hitchhiker  0.0000689146 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3188  LuxR family transcriptional regulator  26.65 
 
 		 368 aa  117  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0110301  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1758  transcriptional regulator, LuxR family  24.93 
 
 		 374 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3938  response regulator receiver protein  28.82 
 
 		 295 aa  114  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal  0.0101023 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1687  transcriptional regulator, LuxR family  25.28 
 
 		 376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2488  LuxR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 359 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.008035 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0956  transcriptional regulator, LuxR family  25 
 
 		 344 aa  107  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.886587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1021  transcriptional regulator, LuxR family  26.12 
 
 		 347 aa  85.1  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7170  LuxR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 240 aa  73.6  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516188  normal  0.21358 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0440  LuxR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 323 aa  65.9  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3529  transcriptional regulator, LuxR family  22.09 
 
 		 324 aa  63.2  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0854004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2318  LuxR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 151 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1438  LuxR family transcriptional regulator  20.36 
 
 		 367 aa  59.7  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0017227  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3356  regulatory protein, LuxR  27.57 
 
 		 373 aa  54.7  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3096  regulatory protein, LuxR  44.26 
 
 		 222 aa  51.2  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.735562  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0720  LuxR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 221 aa  50.8  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0333677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3414  LuxR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 221 aa  50.8  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.295313  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0864  LuxR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 255 aa  50.4  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0863  transcriptional regulator, LuxR family  44.26 
 
 		 221 aa  49.7  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0591  hypothetical protein  27.27 
 
 		 252 aa  50.1  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0644  LuxR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 221 aa  49.7  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0140532  unclonable  0.00000001613 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0875  LuxR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 221 aa  49.3  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  32 
 
 		 213 aa  49.7  0.00009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3194  LuxR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 220 aa  49.3  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0232917  normal  0.227391 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3137  response regulator receiver protein  47.27 
 
 		 209 aa  49.7  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0840  response regulator receiver protein  47.27 
 
 		 221 aa  49.3  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5229  LuxR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 381 aa  49.3  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1284  two component LuxR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 209 aa  48.9  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.479266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3500  response regulator receiver protein  47.27 
 
 		 249 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3333  putative GAF sensor protein  23.11 
 
 		 337 aa  48.9  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000024047  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3945  LuxR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 221 aa  49.3  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00801334  normal  0.811932 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2674  two component LuxR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 215 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.721789  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2926  two component LuxR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 223 aa  48.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.380263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0766  response regulator receiver protein  24.54 
 
 		 364 aa  48.5  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.243196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0618  LuxR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 215 aa  48.5  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3391  transcriptional regulator, LuxR family  30.67 
 
 		 171 aa  47.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0382463  normal  0.946449 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0633  LuxR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 224 aa  48.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1229  response regulator receiver protein  38.36 
 
 		 212 aa  47.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643884  hitchhiker  0.00799583 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1410  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.35 
 
 		 222 aa  47.4  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.46664  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0670  two component LuxR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 265 aa  47.4  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.998369  normal  0.706802 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0649  LuxR family two component transcriptional regulator  38.57 
 
 		 212 aa  47.4  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.93281  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6044  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.92 
 
 		 226 aa  47  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2373  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.59 
 
 		 192 aa  47  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3767  regulatory protein, LuxR  44.23 
 
 		 89 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.163758 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0560  transcriptional regulator, LuxR family protein  41.27 
 
 		 222 aa  47  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4226  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.14 
 
 		 210 aa  46.6  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0447  two component LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 244 aa  46.2  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.013193  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0293  transcriptional regulator, LuxR family  36.76 
 
 		 100 aa  46.2  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0499337  normal  0.0433315 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5233  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.14 
 
 		 223 aa  46.6  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.114456  hitchhiker  0.000738291 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0636  LuxR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 496 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4160  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.71 
 
 		 215 aa  46.2  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0201669  normal  0.0925574 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33010  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  48.08 
 
 		 223 aa  46.2  0.0009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.163463  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1597  response regulator transcription regulator protein  44.68 
 
 		 210 aa  46.2  0.0009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3551  transcriptional regulator, LuxR family  39.44 
 
 		 893 aa  46.2  0.0009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1301  LuxR response regulator receiver  44.68 
 
 		 210 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1701  two component LuxR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 201 aa  46.2  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0166117  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0427  LuxR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 544 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1995  ATP-dependent transcription regulator LuxR  33.33 
 
 		 1019 aa  46.2  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.686742  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06950  LuxR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 496 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.490761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1221  LuxR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 910 aa  46.2  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3664  regulatory protein, LuxR  37.7 
 
 		 215 aa  45.8  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0437  LuxR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 544 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.139362  normal  0.0303285 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0655  two component LuxR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 194 aa  45.8  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1949  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.68 
 
 		 211 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24135  normal  0.0521212 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1621  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.68 
 
 		 211 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.171805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0277  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 		 228 aa  45.8  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0542563  normal  0.0298075 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1810  two component LuxR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 218 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1531  LuxR family DNA-binding response regulator  42.42 
 
 		 219 aa  44.7  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000956559  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1613  transcriptional regulator, LuxR family  41.38 
 
 		 126 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0395666  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3507  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.29 
 
 		 213 aa  45.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.892641  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2582  LuxR response regulator receiver  40 
 
 		 233 aa  45.1  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2427  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 245 aa  45.1  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.27075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5727  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.84 
 
 		 212 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.412106 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1997  two component LuxR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 218 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0062  LuxR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 275 aa  45.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1194  two component LuxR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 210 aa  45.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.92 
 
 		 235 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1966  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.14 
 
 		 218 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1881  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.14 
 
 		 218 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0160211  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0602  transcriptional regulator, LuxR family protein  43.18 
 
 		 210 aa  45.1  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.126322  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1916  LuxR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 381 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.309306  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1737  regulatory protein LuxR  41.27 
 
 		 231 aa  45.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117285  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2948  response regulator receiver protein  44.83 
 
 		 221 aa  45.1  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.126231 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2717  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.79 
 
 		 223 aa  45.1  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1154  transcriptional regulator, LuxR family  33.9 
 
 		 386 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0228  LuxR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 238 aa  45.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1237  LuxR family transcriptional regulator  30 
 
 		 199 aa  44.7  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  32.81 
 
 		 234 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0445  two component LuxR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 212 aa  44.7  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000143028  normal  0.869605 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0262  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 217 aa  44.3  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.153662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2490  transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 211 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3606  regulatory protein, LuxR  41.94 
 
 		 229 aa  44.3  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.527821  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>