More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3322 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_3322  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 375 aa  758    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.304808  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3740  LuxR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 403 aa  187  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0664  putative response regulator protein  28.1 
 
 		 508 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0929  transcriptional regulator, LuxR family  38.46 
 
 		 498 aa  104  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.661011 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2244  transcriptional regulator, LuxR family  39.04 
 
 		 446 aa  102  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.793377  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1231  transcriptional regulator, LuxR family  32.64 
 
 		 441 aa  87.8  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0692085  normal  0.545036 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0038  transcriptional regulator, LuxR family  26.55 
 
 		 307 aa  70.9  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2173  LuxR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 269 aa  68.6  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0947  two component LuxR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 310 aa  62  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00385235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1366  probable regulatory protein, LuxR domain protein  26.38 
 
 		 324 aa  57.4  0.0000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1673  sensory box protein  31.61 
 
 		 1346 aa  55.8  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.338574  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1813  two component LuxR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 249 aa  55.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.172477 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1031  transcriptional regulator, LuxR family  27.18 
 
 		 439 aa  54.7  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4664  two component LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 219 aa  55.1  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0256  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  26.56 
 
 		 703 aa  54.3  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.135026 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3729  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.79 
 
 		 214 aa  54.7  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41040  Two-component response regulator, LuxR family  41.67 
 
 		 208 aa  54.3  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.136918  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3406  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.79 
 
 		 214 aa  54.3  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.588591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3133  LuxR family DNA-binding response regulator  33.9 
 
 		 215 aa  53.9  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2071  LuxR family DNA-binding response regulator  33.9 
 
 		 215 aa  53.9  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1463  LuxR family DNA-binding response regulator  33.9 
 
 		 215 aa  53.9  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3531  LuxR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 257 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.272328  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3186  two component LuxR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 214 aa  53.5  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.10411 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3248  LuxR family DNA-binding response regulator  33.9 
 
 		 215 aa  53.9  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.780539  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1100  LuxR family DNA-binding response regulator  33.9 
 
 		 215 aa  53.9  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2364  LuxR family DNA-binding response regulator  33.9 
 
 		 215 aa  53.9  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1379  LuxR family DNA-binding response regulator  33.9 
 
 		 215 aa  53.9  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2688  putative PAS/PAC sensor protein  26.25 
 
 		 937 aa  53.5  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.139133 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4046  LuxR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 266 aa  53.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4320  LuxR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 266 aa  53.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4527  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.78 
 
 		 223 aa  53.5  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.658241 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0026  two component LuxR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 214 aa  53.1  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3018  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.61 
 
 		 522 aa  53.1  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0381782 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0050  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.52 
 
 		 871 aa  53.1  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0971682  decreased coverage  0.000571287 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4439  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.38 
 
 		 224 aa  52.8  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3711  LuxR family transcriptional regulator  23.28 
 
 		 637 aa  52.8  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.731459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5187  two component LuxR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 214 aa  52.8  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4946  two component LuxR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 214 aa  53.1  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0203352 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5672  two component LuxR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 214 aa  52.8  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685344 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4563  two component LuxR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 214 aa  52.8  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0560765 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5498  two component LuxR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 214 aa  52.8  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509748 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1686  LuxR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 266 aa  52.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2335  LuxR family DNA-binding response regulator  33.05 
 
 		 215 aa  52  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3576  two component LuxR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 228 aa  52.4  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1019  LuxR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 266 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1062  transcriptional regulator, LuxR family  41.27 
 
 		 234 aa  51.6  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0590  LuxR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 266 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822458  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15001  response regulator  37.84 
 
 		 193 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.608527  normal  0.0430708 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2190  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  26.47 
 
 		 963 aa  51.6  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4823  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.19 
 
 		 214 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.103693  normal  0.11387 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3735  LuxR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 266 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1104  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.06 
 
 		 215 aa  51.6  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1105  LuxR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 266 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6399  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.33 
 
 		 214 aa  51.2  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.139442 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2324  LuxR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 257 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2713  two component LuxR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 216 aa  50.8  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1652  LuxR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 257 aa  50.8  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1845  LuxR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 257 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.301448  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3201  LuxR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 266 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0878  LuxR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 257 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2945  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.65 
 
 		 848 aa  51.2  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2590  LuxR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 263 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.572263  normal  0.168073 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5915  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.43 
 
 		 207 aa  50.1  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00974735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4850  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.51 
 
 		 257 aa  50.1  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0778424  normal  0.0399542 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4290  LuxR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 266 aa  49.7  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.397968 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0168  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.48 
 
 		 352 aa  50.1  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4209  LuxR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 266 aa  49.7  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602642  normal  0.235438 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2402  transcriptional regulator, Fis family  30.65 
 
 		 641 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1884  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.89 
 
 		 219 aa  48.9  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0342  LuxR family DNA-binding response regulator  48.89 
 
 		 213 aa  49.3  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0601944  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0686  two component LuxR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 203 aa  48.9  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3842  putative transcriptional regulator  40.35 
 
 		 268 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 214 aa  49.3  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.140358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0385  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.55 
 
 		 224 aa  48.9  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45250  putative transcriptional regulator  40.35 
 
 		 268 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0358  LuxR family DNA-binding response regulator  48.89 
 
 		 213 aa  49.3  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.363  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2813  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.55 
 
 		 590 aa  49.3  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.218828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7761  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 213 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6441  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.65 
 
 		 213 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3419  LuxR response regulator receiver  34.82 
 
 		 231 aa  48.1  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.393456  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2852  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.63 
 
 		 1338 aa  48.5  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.216357  normal  0.0407933 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3186  two component LuxR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 215 aa  48.9  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0678517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1851  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  27.65 
 
 		 450 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6469  two component LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 213 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.53826 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0074  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  32.63 
 
 		 857 aa  48.5  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.102755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0306  two component LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 215 aa  48.5  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000161342  hitchhiker  0.00000159266 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1405  sensor histidine kinase/response regulator  34.71 
 
 		 1379 aa  48.9  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2415  two component LuxR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 217 aa  48.1  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2463  response regulator receiver  31.94 
 
 		 217 aa  48.1  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0443  two component LuxR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 213 aa  48.5  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2782  two component LuxR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 214 aa  47.8  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.834695  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4558  LuxR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 266 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0977  two component LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 223 aa  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00800748  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0728  two component LuxR family transcriptional regulator  34 
 
 		 217 aa  47.8  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1678  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  42.86 
 
 		 910 aa  47.8  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5542  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.53 
 
 		 212 aa  48.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.448293 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3747  two component LuxR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 206 aa  47.8  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1260  putative nitrate/nitrite DNA-binding response regulator  44.44 
 
 		 206 aa  47.4  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.8 
 
 		 553 aa  47.4  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1317  response regulator  46.81 
 
 		 220 aa  47.4  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.500574  normal  0.0503905 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>