152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0929 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0929  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 498 aa  1007    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.661011 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2244  transcriptional regulator, LuxR family  44.95 
 
 		 446 aa  402  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.793377  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1231  transcriptional regulator, LuxR family  40.9 
 
 		 441 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0692085  normal  0.545036 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0664  putative response regulator protein  47.19 
 
 		 508 aa  159  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3740  LuxR family transcriptional regulator  48.99 
 
 		 403 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3322  transcriptional regulator, LuxR family  35.52 
 
 		 375 aa  104  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.304808  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0947  two component LuxR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 310 aa  80.9  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00385235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0038  transcriptional regulator, LuxR family  32.97 
 
 		 307 aa  79  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2173  LuxR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 269 aa  73.2  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1555  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.79 
 
 		 1172 aa  70.5  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0698206 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1366  probable regulatory protein, LuxR domain protein  27.91 
 
 		 324 aa  68.6  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.95 
 
 		 1271 aa  67.8  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0103  sensory box histidine kinase  24.6 
 
 		 703 aa  65.9  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1277  Hpt sensor hybrid histidine kinase  24.84 
 
 		 811 aa  60.8  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3044  DMSO/TMAO-sensor hybrid histidine kinase  26.4 
 
 		 813 aa  60.5  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0728  two component LuxR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 217 aa  55.8  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3979  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 220 aa  55.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.487116  normal  0.704163 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1031  transcriptional regulator, LuxR family  28.87 
 
 		 439 aa  53.5  0.000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1823  transcriptional regulator, LuxR family  32.35 
 
 		 846 aa  52.4  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2180  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.56 
 
 		 222 aa  51.2  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.384012 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0385  two component transcriptional regulator, LuxR family  24.86 
 
 		 224 aa  50.8  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3576  two component LuxR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 228 aa  50.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5542  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 212 aa  50.4  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.448293 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0590  two component LuxR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 215 aa  50.4  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0603  two component LuxR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 215 aa  50.4  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0581  two component LuxR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 215 aa  50.4  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0306  two component LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 215 aa  50.4  0.00008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000161342  hitchhiker  0.00000159266 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4823  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.66 
 
 		 214 aa  50.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.103693  normal  0.11387 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3239  two component LuxR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 274 aa  50.1  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3729  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.25 
 
 		 214 aa  50.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6032  response regulator receiver protein  37.04 
 
 		 218 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3406  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.25 
 
 		 214 aa  49.3  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.588591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39970  transcriptional regulatory protein AcoK, LuxR family  40.58 
 
 		 900 aa  48.9  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1691  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 208 aa  48.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0637899 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4735  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.83 
 
 		 229 aa  48.5  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.261027  hitchhiker  0.000239774 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3390  LuxR family two component transcriptional regulator  38.27 
 
 		 228 aa  48.5  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.269937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0829  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 219 aa  48.5  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121621 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4290  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 218 aa  47.8  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1026  response regulator protein  47.27 
 
 		 217 aa  48.1  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2345  two component transcriptional regulator  45 
 
 		 220 aa  48.1  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.499423  normal  0.134206 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0409  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.04 
 
 		 191 aa  47.8  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 214 aa  47.8  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.140358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0029  two component LuxR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 214 aa  47.8  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.317943  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3105  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.34 
 
 		 223 aa  47.8  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1151  two-component response regulator  35.23 
 
 		 248 aa  47.4  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1977  regulatory protein LuxR  47.92 
 
 		 235 aa  47.4  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2359  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.9 
 
 		 247 aa  47.4  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0990205  decreased coverage  0.00133027 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1932  transcriptional regulator, LuxR family  34.25 
 
 		 241 aa  47.4  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0592371 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0876  two component LuxR family transcriptional regulator  48.89 
 
 		 233 aa  47.4  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.481499  normal  0.345787 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6399  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.81 
 
 		 214 aa  47  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.139442 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2254  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 235 aa  47  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1293  LuxR family DNA-binding response regulator  41.79 
 
 		 216 aa  46.2  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2887  LuxR family two component transcriptional regulator  35.85 
 
 		 225 aa  46.2  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.526109  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 225 aa  46.2  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.717242  normal  0.142765 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2713  two component LuxR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 216 aa  46.6  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0977  two component LuxR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 223 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00800748  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0894  two component LuxR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 217 aa  46.6  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0367  transcriptional regulator, LuxR family  28.07 
 
 		 556 aa  46.6  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4296  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 214 aa  46.2  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0062  LuxR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 275 aa  46.2  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0679  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 213 aa  46.6  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15001  response regulator  38.46 
 
 		 193 aa  46.6  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.608527  normal  0.0430708 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5322  two component LuxR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 220 aa  46.6  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.929677 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1294  LuxR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 252 aa  46.6  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5044  LuxR family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 230 aa  46.6  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.263575  hitchhiker  0.00837426 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1782  two component LuxR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 214 aa  46.6  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000360675 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4527  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.81 
 
 		 223 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.658241 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3229  LuxR family DNA-binding response regulator  39.58 
 
 		 229 aa  45.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1406  DNA-binding response regulator  38.3 
 
 		 215 aa  45.8  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.253896  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1484  DNA-binding response regulator, LuxR family  40.58 
 
 		 208 aa  45.8  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5287  transcriptional regulator, LuxR family  40.32 
 
 		 206 aa  45.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1884  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.82 
 
 		 219 aa  45.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5363  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  36.21 
 
 		 607 aa  46.2  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.423746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0026  two component LuxR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 214 aa  45.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5351  transcriptional regulator, LuxR family  47.73 
 
 		 229 aa  45.8  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.649636  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5187  two component LuxR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 214 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4946  two component LuxR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 214 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0203352 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5672  two component LuxR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 214 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685344 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2093  two component LuxR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 206 aa  45.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000328625  normal  0.180863 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4229  two component LuxR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 219 aa  45.8  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.720334  normal  0.28913 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3992  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.64 
 
 		 214 aa  45.8  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82671  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0896  LuxR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 216 aa  45.8  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38740  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  39.71 
 
 		 250 aa  45.8  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1062  transcriptional regulator, LuxR family  46.94 
 
 		 234 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41040  Two-component response regulator, LuxR family  40.58 
 
 		 208 aa  45.8  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.136918  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3186  two component LuxR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 214 aa  45.8  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.10411 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2685  two component LuxR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 222 aa  45.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.120511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0756  LuxR family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 228 aa  45.8  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.826443 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4563  two component LuxR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 214 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0560765 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5498  two component LuxR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 214 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509748 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7761  two component LuxR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 213 aa  45.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1382  two component LuxR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 232 aa  45.1  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4439  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 		 224 aa  44.7  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0788  two component LuxR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 218 aa  45.1  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.3296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003136  transcriptional regulator LuxR family protein  44.68 
 
 		 212 aa  45.1  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12843  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2829  transcriptional regulator, LuxR family  38.57 
 
 		 865 aa  45.1  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4178  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  26.28 
 
 		 976 aa  45.1  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1633  two component LuxR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 254 aa  45.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2589  LuxR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 262 aa  45.4  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.658278  normal  0.222146 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6469  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 213 aa  45.1  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.53826 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>