More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_41040 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_41040  Two-component response regulator, LuxR family  100 
 
 		 208 aa  406  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.136918  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0083  two component LuxR family transcriptional regulator  67.68 
 
 		 210 aa  241  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1782  two component LuxR family transcriptional regulator  59.41 
 
 		 214 aa  223  1e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000360675 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1026  response regulator protein  55.45 
 
 		 217 aa  214  8e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3406  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.52 
 
 		 214 aa  206  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.588591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3729  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.57 
 
 		 214 aa  203  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3992  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.07 
 
 		 214 aa  201  7e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82671  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3419  LuxR response regulator receiver  50.49 
 
 		 231 aa  199  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.393456  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7761  two component LuxR family transcriptional regulator  49.75 
 
 		 213 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3576  two component LuxR family transcriptional regulator  51.49 
 
 		 228 aa  191  8e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2071  LuxR family DNA-binding response regulator  49.26 
 
 		 215 aa  189  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1463  LuxR family DNA-binding response regulator  49.26 
 
 		 215 aa  189  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1379  LuxR family DNA-binding response regulator  49.26 
 
 		 215 aa  189  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1100  LuxR family DNA-binding response regulator  49.26 
 
 		 215 aa  189  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2364  LuxR family DNA-binding response regulator  49.26 
 
 		 215 aa  189  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3248  LuxR family DNA-binding response regulator  49.26 
 
 		 215 aa  189  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.780539  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2335  LuxR family DNA-binding response regulator  49.26 
 
 		 215 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3133  LuxR family DNA-binding response regulator  49.26 
 
 		 215 aa  188  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6469  two component LuxR family transcriptional regulator  49.28 
 
 		 213 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.53826 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4476  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.06 
 
 		 215 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4563  two component LuxR family transcriptional regulator  49.26 
 
 		 214 aa  182  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0560765 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5187  two component LuxR family transcriptional regulator  49.26 
 
 		 214 aa  182  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5672  two component LuxR family transcriptional regulator  49.26 
 
 		 214 aa  182  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685344 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3523  two component LuxR family transcriptional regulator  48.04 
 
 		 224 aa  181  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0026  two component LuxR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 214 aa  180  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5498  two component LuxR family transcriptional regulator  49.26 
 
 		 214 aa  180  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509748 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4946  two component LuxR family transcriptional regulator  49.26 
 
 		 214 aa  180  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0203352 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0788  two component LuxR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 218 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.3296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1121  two component LuxR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 222 aa  174  7e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.864132  normal  0.872256 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1260  putative nitrate/nitrite DNA-binding response regulator  43.72 
 
 		 206 aa  173  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3186  two component LuxR family transcriptional regulator  48.77 
 
 		 214 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.10411 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2290  two component LuxR family transcriptional regulator  45.37 
 
 		 215 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0679  two component LuxR family transcriptional regulator  43.78 
 
 		 213 aa  171  6.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3747  two component LuxR family transcriptional regulator  43.5 
 
 		 206 aa  169  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0896  LuxR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 216 aa  168  5e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5322  two component LuxR family transcriptional regulator  45.67 
 
 		 220 aa  167  8e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.929677 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0876  two component LuxR family transcriptional regulator  45 
 
 		 233 aa  164  8e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.481499  normal  0.345787 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0905  putative nitrate/nitrite DNA-binding response regulator  43.22 
 
 		 206 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0826046  hitchhiker  0.00000533581 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1406  DNA-binding response regulator  41.79 
 
 		 215 aa  162  3e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.253896  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4229  two component LuxR family transcriptional regulator  48.51 
 
 		 219 aa  159  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.720334  normal  0.28913 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003136  transcriptional regulator LuxR family protein  40.39 
 
 		 212 aa  158  5e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12843  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2345  two component transcriptional regulator  42.64 
 
 		 220 aa  157  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.499423  normal  0.134206 
 
 
-
 
NC_004310  BR0342  LuxR family DNA-binding response regulator  40.69 
 
 		 213 aa  156  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0601944  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0358  LuxR family DNA-binding response regulator  40.69 
 
 		 213 aa  156  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.363  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0894  two component LuxR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 217 aa  156  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4527  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.29 
 
 		 223 aa  156  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.658241 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0590  two component LuxR family transcriptional regulator  42.58 
 
 		 215 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0581  two component LuxR family transcriptional regulator  42.58 
 
 		 215 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0603  two component LuxR family transcriptional regulator  42.58 
 
 		 215 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 221 aa  152  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.273145  hitchhiker  0.00000136124 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1873  response regulator receiver protein  40.76 
 
 		 215 aa  153  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.56104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5717  two component LuxR family transcriptional regulator  41.09 
 
 		 220 aa  152  5e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.873964  hitchhiker  0.00405289 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0829  two component LuxR family transcriptional regulator  38.65 
 
 		 219 aa  151  7e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121621 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1311  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.78 
 
 		 226 aa  150  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.165019  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0306  two component LuxR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 215 aa  149  2e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000161342  hitchhiker  0.00000159266 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.83 
 
 		 213 aa  149  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6399  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.3 
 
 		 214 aa  149  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.139442 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0105  two component LuxR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 215 aa  149  3e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0303042  normal  0.309888 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0443  two component LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 213 aa  148  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1317  response regulator  35.38 
 
 		 220 aa  147  8e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.500574  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1103  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.83 
 
 		 216 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1266  two-component response regulator  37.14 
 
 		 227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.847879  normal  0.913346 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1664  two component LuxR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.49018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3042  two component LuxR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 222 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.280021 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.54 
 
 		 224 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1966  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.13 
 
 		 218 aa  145  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1881  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.13 
 
 		 218 aa  145  3e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0160211  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1850  two component LuxR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 216 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0983  two component LuxR family transcriptional regulator  40.8 
 
 		 213 aa  145  5e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1588  two component LuxR family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 215 aa  145  5e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.731747  normal  0.987016 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1987  two component LuxR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 215 aa  145  5e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0949899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4290  two component LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 218 aa  145  5e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3229  LuxR family DNA-binding response regulator  35.1 
 
 		 229 aa  145  6e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1997  two component LuxR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 218 aa  144  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1987  two component LuxR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 213 aa  144  8.000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.429674  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1369  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.5 
 
 		 218 aa  144  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.380225  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1293  LuxR family DNA-binding response regulator  37.68 
 
 		 216 aa  144  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4628  two component LuxR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 219 aa  144  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0154  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.11 
 
 		 244 aa  144  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  40.49 
 
 		 228 aa  143  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7047  two component LuxR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 215 aa  144  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.976007 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3105  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.75 
 
 		 223 aa  143  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5451  two component LuxR family transcriptional regulator  36.06 
 
 		 223 aa  143  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.761649  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0728  two component LuxR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 217 aa  143  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1563  two component LuxR family transcriptional regulator  38.92 
 
 		 214 aa  142  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.241819 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0977  two component LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 223 aa  142  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00800748  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2295  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.23 
 
 		 222 aa  142  3e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.031577  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0945  two component LuxR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 210 aa  142  4e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1089  two component LuxR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 210 aa  142  4e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2299  two component LuxR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 221 aa  142  5e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1810  two component LuxR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 218 aa  141  6e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1743  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.46 
 
 		 214 aa  141  6e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370009  normal  0.039988 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2943  two component LuxR family transcriptional regulator  41.87 
 
 		 215 aa  141  6e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0700  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.03 
 
 		 218 aa  141  7e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00980919  normal  0.316207 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0127  LuxR family DNA-binding response regulator  37.93 
 
 		 215 aa  141  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.914848  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1247  LuxR family DNA-binding response regulator  37.44 
 
 		 215 aa  141  7e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32702  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1551  LuxR family DNA-binding response regulator  37.93 
 
 		 215 aa  141  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1634  LuxR family DNA-binding response regulator  37.93 
 
 		 215 aa  141  7e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3747  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.38 
 
 		 221 aa  141  8e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0790  two component LuxR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 214 aa  141  8e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.870503  normal  0.997505 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>