30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1366 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1366  probable regulatory protein, LuxR domain protein  100 
 
 		 324 aa  660    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2294  histidine kinase  36 
 
 		 381 aa  114  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.02124  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1158  putative PAS/PAC sensor protein  41.91 
 
 		 753 aa  107  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1355  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.44 
 
 		 582 aa  99.4  8e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0499  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  35.04 
 
 		 933 aa  89.4  8e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.292591  normal  0.21261 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0038  transcriptional regulator, LuxR family  32.9 
 
 		 307 aa  89  9e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1348  putative PAS/PAC sensor protein  28.09 
 
 		 888 aa  84  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2443  histidine kinase  31.65 
 
 		 578 aa  79  0.00000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1769  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  32.28 
 
 		 1343 aa  78.6  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.221131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2173  LuxR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 269 aa  76.3  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1031  transcriptional regulator, LuxR family  30.88 
 
 		 439 aa  71.6  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0929  transcriptional regulator, LuxR family  27.91 
 
 		 498 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.661011 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0947  two component LuxR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 310 aa  66.2  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00385235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1231  transcriptional regulator, LuxR family  31.51 
 
 		 441 aa  60.1  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0692085  normal  0.545036 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0664  putative response regulator protein  24.68 
 
 		 508 aa  59.7  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3322  transcriptional regulator, LuxR family  26.38 
 
 		 375 aa  57.4  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.304808  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2244  transcriptional regulator, LuxR family  27.27 
 
 		 446 aa  57.4  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.793377  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1328  histidine kinase  29.37 
 
 		 672 aa  56.6  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0727  putative signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 		 476 aa  56.2  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3740  LuxR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 403 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4895  DNA polymerase beta domain protein region  25.21 
 
 		 254 aa  54.3  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.856716 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13453  sensor histidine kinase/response regulator  27.54 
 
 		 364 aa  52.4  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.264615  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1236  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.32 
 
 		 692 aa  49.3  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2246  regulatory protein, LuxR  26.2 
 
 		 899 aa  44.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3526  response regulator receiver protein  33.75 
 
 		 921 aa  44.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0844  transcriptional regulator, LuxR family  41.3 
 
 		 234 aa  44.3  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5322  two component LuxR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 220 aa  43.1  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.929677 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4220  response regulator receiver protein  41.82 
 
 		 251 aa  42.7  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  37.29 
 
 		 913 aa  43.1  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2526  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.31 
 
 		 219 aa  42.7  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.413807  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>