199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1823 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1823  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 846 aa  1662    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3197  transcriptional regulator, LuxR family  29.55 
 
 		 876 aa  213  9e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35370  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  30.17 
 
 		 881 aa  211  6e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.705533  normal  0.60935 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2829  transcriptional regulator, LuxR family  26.04 
 
 		 865 aa  156  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34130  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  26.65 
 
 		 853 aa  131  6e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1247  transcriptional regulator, LuxR family  30.85 
 
 		 871 aa  68.2  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1485  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 952 aa  58.2  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3560  transcriptional regulator, LuxR family  25.94 
 
 		 893 aa  56.6  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0327  transcriptional regulator, LuxR family  47.46 
 
 		 341 aa  55.1  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  32.75 
 
 		 927 aa  55.1  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1998  transcriptional regulator, LuxR family  50.91 
 
 		 956 aa  54.7  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120259  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 910 aa  54.7  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0316  LuxR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 341 aa  54.7  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0338  transcriptional regulator, LuxR family  47.46 
 
 		 341 aa  54.7  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1292  transcriptional regulator, LuxR family  27.24 
 
 		 845 aa  53.5  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000215082 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4479  regulatory protein, LuxR  25.42 
 
 		 865 aa  53.9  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00441631 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3668  response regulator receiver protein  36.46 
 
 		 541 aa  53.9  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.563914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3139  transcriptional regulator, LuxR family  52.63 
 
 		 879 aa  53.9  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00942978  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2457  LuxR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 554 aa  53.1  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0243  regulatory protein, LuxR  23.57 
 
 		 884 aa  53.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203716 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9261  ATPase-like protein  56.25 
 
 		 884 aa  53.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  46.15 
 
 		 919 aa  52.8  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3551  cyclic nucleotide-binding protein  55.77 
 
 		 1001 aa  52.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5780  ATPase-like protein  52.08 
 
 		 884 aa  52.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.673084  normal  0.283038 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0929  transcriptional regulator, LuxR family  32.35 
 
 		 498 aa  52.8  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.661011 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0920  response regulator receiver protein  26.37 
 
 		 880 aa  52  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.563129  normal  0.106306 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1879  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  47.27 
 
 		 839 aa  52.4  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 228 aa  52  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0011  AAA ATPase  26.01 
 
 		 292 aa  52  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.40888 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0068  regulatory protein LuxR  25.52 
 
 		 867 aa  51.6  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.289946  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5781  transcriptional regulator, LuxR family  44.78 
 
 		 895 aa  51.6  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1221  LuxR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 910 aa  51.2  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5143  transcriptional regulator, LuxR family  43.55 
 
 		 903 aa  51.2  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497829  normal  0.980659 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4236  transcriptional regulator, LuxR family  47.46 
 
 		 905 aa  51.2  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427598  normal  0.524249 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2725  LuxR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 211 aa  50.4  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4238  transcriptional regulator, LuxR family  49.02 
 
 		 919 aa  50.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0244  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 868 aa  50.4  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140274 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  50 
 
 		 919 aa  50.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4439  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.08 
 
 		 224 aa  50.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3579  two component LuxR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 217 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.393396  normal  0.0540104 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  45.1 
 
 		 929 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4086  transcriptional regulator, LuxR family  46.3 
 
 		 959 aa  50.1  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.105743  hitchhiker  0.000559176 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2465  LuxR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 273 aa  49.3  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.54611  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2594  transcriptional regulator, LuxR family  47.92 
 
 		 920 aa  49.3  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2316  LuxR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 211 aa  49.3  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2386  LuxR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 211 aa  49.3  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2509  LuxR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 211 aa  49.3  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.592216  hitchhiker  0.00000482381 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0350  LuxR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 259 aa  49.3  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0630  LuxR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 273 aa  49.3  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0768185  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2332  response regulator receiver protein  35.8 
 
 		 211 aa  49.3  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  44.9 
 
 		 940 aa  49.3  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1366  LuxR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 235 aa  48.9  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0942  LuxR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 235 aa  48.9  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.232709  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4559  LuxR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 877 aa  48.9  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 918 aa  48.5  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4606  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.92 
 
 		 207 aa  48.5  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.296562 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2575  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  47.92 
 
 		 917 aa  48.5  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3071  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.02 
 
 		 232 aa  48.5  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0523  transcriptional regulator, LuxR family  41.94 
 
 		 122 aa  48.1  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1493  transcriptional regulator, LuxR family  46.3 
 
 		 198 aa  48.5  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2836  two component LuxR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 207 aa  48.5  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.644859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  47.06 
 
 		 932 aa  48.1  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2759  response regulator receiver protein  40.62 
 
 		 211 aa  48.1  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.550861  normal  0.145492 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2108  two component LuxR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 218 aa  48.1  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3417  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.1 
 
 		 232 aa  48.1  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.901274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1538  LuxR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 288 aa  47.8  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4558  transcriptional regulator, LuxR family  47.06 
 
 		 952 aa  47.8  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.025168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0406  transcriptional regulator, LuxR family  35.29 
 
 		 486 aa  47.8  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0269651 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26510  transcriptional regulator, luxR family  45.71 
 
 		 903 aa  48.1  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.427696 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0258  LuxR response regulator receiver  42.25 
 
 		 230 aa  47.8  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.752946  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0218  two component LuxR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 339 aa  47.8  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0562  two component LuxR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 297 aa  47.8  0.0009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3614  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.92 
 
 		 201 aa  47  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.765091  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  43.75 
 
 		 917 aa  47.4  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1634  DNA-binding response regulator  42.25 
 
 		 230 aa  47.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.723228  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0265  transcriptional regulator, LuxR family  41.38 
 
 		 946 aa  47.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3812  transcriptional regulator, LuxR family  41.38 
 
 		 927 aa  47.8  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142204  normal  0.0901624 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  47.06 
 
 		 998 aa  47.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  46.3 
 
 		 913 aa  47.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3576  two component LuxR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 228 aa  47  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3785  ATPase-like protein  52.08 
 
 		 937 aa  47.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1056  two component LuxR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 219 aa  47.4  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1223  LuxR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 907 aa  47.4  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4918  metal-dependent phosphohydrolase  41.94 
 
 		 516 aa  47.4  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.401687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4823  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.35 
 
 		 214 aa  47.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.103693  normal  0.11387 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1072  two component LuxR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 219 aa  47.4  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.562029  normal  0.0679961 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4334  transcriptional regulator, LuxR family  35 
 
 		 160 aa  47  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1273  LuxR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 273 aa  47.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0925384  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1083  two component LuxR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 219 aa  47.4  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.605869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0170  capsular synthesis regulator component B  42.25 
 
 		 230 aa  47.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.443347  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1199  LuxR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 235 aa  47.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.791762  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3154  transcriptional regulator, LuxR family  50.98 
 
 		 1089 aa  47.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.639432 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0388  transcriptional regulator, LuxR family  48.08 
 
 		 916 aa  47.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0286476 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0756  LuxR family transcriptional regulator  54.35 
 
 		 228 aa  47.4  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.826443 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5044  LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 230 aa  47.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.263575  hitchhiker  0.00837426 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03511  putative transcriptional regulator, LuxR family protein  42.86 
 
 		 103 aa  46.6  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0867403  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2630  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.98 
 
 		 243 aa  46.2  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2482  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 208 aa  46.6  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0211915  normal  0.642006 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1796  response regulator receiver protein  36.51 
 
 		 211 aa  47  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02220  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  41.94 
 
 		 862 aa  46.2  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.591408  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>