More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0316 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_0316  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 341 aa  643    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0327  transcriptional regulator, LuxR family  94.13 
 
 		 341 aa  567  1e-160  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0338  transcriptional regulator, LuxR family  94.13 
 
 		 341 aa  548  1e-155  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0339  transcriptional regulator, LuxR family  43.92 
 
 		 285 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0317  LuxR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 285 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0328  transcriptional regulator, LuxR family  43.58 
 
 		 285 aa  143  3e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5898  transcriptional regulator, LuxR family  36.93 
 
 		 230 aa  92.4  9e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1823  transcriptional regulator, LuxR family  47.46 
 
 		 846 aa  55.1  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3098  transcriptional regulator, LuxR family  47.27 
 
 		 254 aa  53.9  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.521704  normal  0.269359 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2120  LuxR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 244 aa  53.9  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0535979  normal  0.194929 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1486  two component LuxR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 214 aa  53.5  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.108748  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1825  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.45 
 
 		 205 aa  53.1  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0736095 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3524  two component LuxR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 353 aa  53.5  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.406085  normal  0.428998 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1936  regulatory protein LuxR  50 
 
 		 218 aa  53.1  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.548655  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3796  two component LuxR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 209 aa  52.8  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2348  two component LuxR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 219 aa  52.8  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0791  LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 247 aa  52.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0182  LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 247 aa  52.4  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00268604  hitchhiker  0.00000585836 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0720  LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 247 aa  52.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1445  two component LuxR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 308 aa  52.4  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.446624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1499  LuxR family two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 209 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4359  transcriptional regulator, LuxR family  54.9 
 
 		 302 aa  52  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1878  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 208 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3112  regulatory protein, LuxR  50 
 
 		 250 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1485  transcriptional regulator, LuxR family  50.98 
 
 		 952 aa  51.2  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1513  LuxR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 246 aa  51.6  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3850  two component LuxR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 209 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2108  transcriptional regulator, LuxR family  36.99 
 
 		 516 aa  51.6  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00926757  normal  0.183235 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3606  two component LuxR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 208 aa  50.8  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3086  transcriptional regulator, LuxR family  52 
 
 		 695 aa  50.8  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0765  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.21 
 
 		 222 aa  51.2  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0157  transcriptional regulator, LuxR family  37.68 
 
 		 321 aa  50.8  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3745  response regulator receiver protein  53.19 
 
 		 203 aa  51.2  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.311585 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4238  transcriptional regulator, LuxR family  43.08 
 
 		 919 aa  50.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2166  response regulator receiver protein  44.83 
 
 		 247 aa  50.4  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1083  two component LuxR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 316 aa  50.8  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1385  two component LuxR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 212 aa  50.4  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27360  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  40.3 
 
 		 517 aa  50.4  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0445329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2326  two component LuxR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 210 aa  50.4  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000518478 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4238  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.25 
 
 		 356 aa  50.4  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0822  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 		 223 aa  50.4  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.628591  normal  0.692285 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4179  response regulator receiver protein  30.91 
 
 		 309 aa  50.4  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.15819 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0979  response regulator receiver protein  34.91 
 
 		 336 aa  50.4  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6032  response regulator receiver protein  47.06 
 
 		 218 aa  50.1  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3331  transcriptional regulator, LuxR family  58.33 
 
 		 429 aa  50.4  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.573332  normal  0.222542 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 228 aa  50.4  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1309  two component LuxR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 206 aa  50.4  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000148999  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0108  transcriptional regulator, LuxR family  37.88 
 
 		 493 aa  50.4  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.44109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2117  response regulator FixJ  39.33 
 
 		 205 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6902  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.19 
 
 		 210 aa  50.1  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.173656  normal  0.571333 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3397  two component LuxR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 328 aa  50.1  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4116  LuxR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 239 aa  50.1  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0201758  hitchhiker  0.00877352 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0123  transcriptional regulator, LuxR family  36.76 
 
 		 492 aa  50.1  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.891774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0615  transcriptional regulator, LuxR family  41.94 
 
 		 462 aa  49.7  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000110739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0443  LuxR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 845 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0453  LuxR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 845 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00902802  normal  0.164527 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1567  transcriptional regulator, LuxR family  30 
 
 		 323 aa  49.3  0.00009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0815521  normal  0.0242929 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05930  DNA-binding response regulator, LuxR family protein  33.33 
 
 		 207 aa  49.3  0.00009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1135  two component LuxR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 201 aa  48.5  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.564331  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3082  two component LuxR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 201 aa  48.9  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0470395  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1879  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  45.76 
 
 		 839 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1390  two component LuxR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 225 aa  48.9  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5474  two component LuxR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 212 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.344108  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  38.81 
 
 		 918 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3585  two component LuxR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 306 aa  49.3  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.295986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2911  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 		 209 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2400  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 210 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  48.94 
 
 		 967 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0430  LuxR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 845 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.32699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0198  autoinducer-binding domain-containing protein  43.86 
 
 		 235 aa  48.5  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00000129067  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0686  two component LuxR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 203 aa  48.5  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1715  LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 245 aa  48.1  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00270807  hitchhiker  0.000116776 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3372  two component LuxR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 212 aa  48.5  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383896 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0409  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.78 
 
 		 191 aa  48.1  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1547  LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 245 aa  48.1  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4087  LuxR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 183 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0386906 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1655  LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 245 aa  48.1  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2409  LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 272 aa  48.1  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3231  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 209 aa  48.5  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.229823  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1744  response regulator receiver protein  41.82 
 
 		 213 aa  48.1  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.933486  normal  0.721753 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003036  tetrathionate reductase two-component response regulator  29.93 
 
 		 200 aa  48.1  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2399  response regulator receiver protein  32.58 
 
 		 201 aa  48.5  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.635003 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0245  response regulator receiver protein  46.43 
 
 		 202 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0617  transcriptional regulator, LuxR family  48.15 
 
 		 505 aa  48.1  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0935525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2858  probable CsgAB operon transcriptional regulatory protein  30.56 
 
 		 215 aa  48.5  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.256874  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3275  response regulator FixJ  44.64 
 
 		 205 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0810  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 223 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2446  transcriptional regulator, LuxR family  39.56 
 
 		 188 aa  47.4  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0907  two component LuxR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 202 aa  47.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.285724  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1587  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.14 
 
 		 292 aa  47.8  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.522901  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3147  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.83 
 
 		 302 aa  47.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235206  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3395  LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 260 aa  47.8  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0475  regulatory protein LuxR  35.9 
 
 		 271 aa  47.8  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5362  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.19 
 
 		 643 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02220  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  45.1 
 
 		 862 aa  47.8  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.591408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0154  transcriptional regulator, LuxR family  36.23 
 
 		 320 aa  47.8  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1700  two component LuxR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 213 aa  47.4  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2635  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.1 
 
 		 217 aa  47.8  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000528497  hitchhiker  0.00476816 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2567  response regulator receiver protein  46.43 
 
 		 202 aa  47.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0922  transcriptional regulator, LuxR family  34.18 
 
 		 378 aa  47.8  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>