177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4178 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4178  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  100 
 
 		 976 aa  2001    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3632  Two component regulator three Y domain protein  32.18 
 
 		 966 aa  523  1e-147  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5110  Two component regulator three Y domain protein  32.48 
 
 		 966 aa  507  9.999999999999999e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.58811  normal  0.312264 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1559  two component regulator  30.2 
 
 		 959 aa  454  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2430  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  29.66 
 
 		 918 aa  419  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.36505  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1127  two component regulator propeller domain protein  29.36 
 
 		 924 aa  410  1e-113  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4457  transcriptional regulator, LuxR family  27.96 
 
 		 966 aa  373  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.547155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1046  transcriptional regulator, LuxR family  26.4 
 
 		 947 aa  296  2e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1852  histidine kinase  26.49 
 
 		 1074 aa  278  4e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.496494  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1607  histidine kinase  26.92 
 
 		 1366 aa  253  2e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89561 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1719  histidine kinase  22.01 
 
 		 1257 aa  182  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0583268  normal  0.402469 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3526  response regulator receiver protein  23.85 
 
 		 921 aa  162  3e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4246  histidine kinase  21.65 
 
 		 1280 aa  133  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.921248  normal  0.11404 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1836  two component AraC family transcriptional regulator  20.74 
 
 		 1341 aa  125  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4161  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  20.47 
 
 		 1295 aa  107  8e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.086012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2397  TPR repeat-containing protein  32.54 
 
 		 571 aa  107  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  21.56 
 
 		 1346 aa  101  8e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2852  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  18.44 
 
 		 1338 aa  100  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.216357  normal  0.0407933 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3862  histidine kinase  23.82 
 
 		 1384 aa  99.4  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0448  histidine kinase  21.8 
 
 		 1114 aa  94.7  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.823175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1033  TPR repeat-containing protein  32.12 
 
 		 545 aa  94.4  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3543  Hpt sensor hybrid histidine kinase  26.26 
 
 		 1498 aa  91.7  6e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.476146  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4722  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 560 aa  91.3  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0559  histidine kinase  21.86 
 
 		 1327 aa  90.5  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00477073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6752  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.21 
 
 		 549 aa  87.8  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1764  sensor histidine kinase/response regulator  21.79 
 
 		 1093 aa  87  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.412354  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2019  histidine kinase  21.92 
 
 		 1316 aa  86.7  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523526  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3373  histidine kinase  20.61 
 
 		 1048 aa  86.3  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.228028  normal  0.520662 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0505  response regulator receiver  23.29 
 
 		 1334 aa  84  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1857  hypothetical protein  29.17 
 
 		 412 aa  84  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4560  histidine kinase  35.59 
 
 		 1313 aa  83.2  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.498007  normal  0.022289 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2726  ATP-binding region ATPase domain protein  24.62 
 
 		 1355 aa  83.6  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5621  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.26 
 
 		 1258 aa  82.8  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879931  normal  0.634334 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0667  response regulator receiver domain-containing protein  25.1 
 
 		 1526 aa  82  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0280955  hitchhiker  0.000000898802 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3230  histidine kinase  20.55 
 
 		 1033 aa  82  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.704109  normal  0.047539 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2168  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  20.22 
 
 		 1204 aa  80.9  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172741 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1010  histidine kinase  25.54 
 
 		 1347 aa  80.1  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0363668  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2318  histidine kinase  23.54 
 
 		 1298 aa  80.5  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  22.01 
 
 		 1378 aa  79.7  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3648  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  22.86 
 
 		 1511 aa  78.6  0.0000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1493  sensor histidine kinase/response regulator  23.98 
 
 		 1086 aa  78.2  0.0000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0890895  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0536  histidine kinase  20.09 
 
 		 1324 aa  77  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0692259  normal  0.421547 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3872  histidine kinase  27.05 
 
 		 1373 aa  76.6  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459124  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0783  ATP-binding region ATPase domain protein  21.62 
 
 		 1374 aa  75.5  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2648  response regulator receiver  22.99 
 
 		 1363 aa  74.7  0.000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1280  signal transduction histidine kinase, LytS  20.55 
 
 		 1015 aa  74.7  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0152278  normal  0.38856 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3829  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  25.53 
 
 		 1505 aa  73.9  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  25.43 
 
 		 1093 aa  73.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0341  sensory box protein  21.9 
 
 		 1515 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1489  histidine kinase  29.94 
 
 		 1404 aa  73.6  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639294  normal  0.537564 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2497  histidine kinase  19.33 
 
 		 1031 aa  73.2  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0918719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  24.2 
 
 		 1370 aa  73.6  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2054  hypothetical protein  29.08 
 
 		 407 aa  72  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.247121  normal  0.0331118 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4824  histidine kinase  20.13 
 
 		 1024 aa  72  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0714049  normal  0.112759 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2733  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  20.29 
 
 		 965 aa  72  0.00000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2107  two component transcriptional regulator, AraC family  20.52 
 
 		 1349 aa  72  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000288147  normal  0.419692 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0216  response regulator receiver domain-containing protein  28.98 
 
 		 398 aa  71.6  0.00000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0122145  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  27.91 
 
 		 1407 aa  71.2  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0921  histidine kinase  28.37 
 
 		 1105 aa  70.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615746 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0792  histidine kinase  26.58 
 
 		 1378 aa  70.5  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2980  histidine kinase  24.57 
 
 		 1311 aa  70.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229379  normal  0.450681 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1944  histidine kinase  26.03 
 
 		 1278 aa  70.1  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.866742 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0156  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  24.88 
 
 		 1075 aa  69.7  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000640114  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2852  histidine kinase  26.34 
 
 		 1342 aa  68.9  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0012841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0550  histidine kinase  24.49 
 
 		 1388 aa  68.9  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23656  normal  0.89256 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2667  histidine kinase  19.11 
 
 		 1017 aa  68.6  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.865327  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4681  GGDEF domain-containing protein  21.25 
 
 		 1034 aa  67.8  0.0000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05925  GGDEF domain protein  22.61 
 
 		 1005 aa  67.8  0.0000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01692  histidine kinase-response regulator hybrid protein  23.98 
 
 		 921 aa  67.8  0.0000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.803557  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1617  ATP-binding region ATPase domain protein  21.56 
 
 		 975 aa  67.4  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.269144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6165  histidine kinase  20.22 
 
 		 1397 aa  67.8  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000541195 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2832  ATP-binding region ATPase domain protein  25.28 
 
 		 1340 aa  67.4  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201204  hitchhiker  0.008817 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0812  histidine kinase  25.57 
 
 		 1335 aa  67  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0311  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  24.41 
 
 		 1504 aa  67  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_105  histidine kinase CheY-like domain protein  20.45 
 
 		 1070 aa  66.6  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5363  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  27.54 
 
 		 607 aa  66.6  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.423746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2641  hypothetical protein  25.68 
 
 		 603 aa  65.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1316  diguanylate cyclase  21.88 
 
 		 1004 aa  66.2  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.730261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4026  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  25.89 
 
 		 1508 aa  65.9  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1854  hypothetical protein  27.72 
 
 		 409 aa  65.9  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5544  histidine kinase  24.84 
 
 		 1306 aa  65.9  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1699  ATP-binding region, ATPase-like protein  25 
 
 		 1396 aa  65.5  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.170141  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3633  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  24.02 
 
 		 1504 aa  65.9  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  24.15 
 
 		 1374 aa  65.9  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3354  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  20 
 
 		 1242 aa  65.9  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3950  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  24.82 
 
 		 1508 aa  65.5  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4052  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  25.54 
 
 		 1508 aa  65.5  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3120  histidine kinase  22.28 
 
 		 1344 aa  65.5  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.628446  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0415  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  22.7 
 
 		 1486 aa  65.1  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6436  histidine kinase  32.76 
 
 		 1418 aa  65.1  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0846  response regulator receiver domain-containing protein  26.38 
 
 		 155 aa  64.7  0.000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.321118 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_84  histidine kinase  30.2 
 
 		 1084 aa  64.7  0.000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4145  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  24.82 
 
 		 1508 aa  63.9  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2076  histidine kinase  24.9 
 
 		 1373 aa  63.5  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2052  hypothetical protein  26.78 
 
 		 403 aa  63.5  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000379131  normal  0.0792841 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0275  histidine kinase  22.6 
 
 		 1070 aa  62.8  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4321  histidine kinase  22.32 
 
 		 1355 aa  62.8  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1856  hypothetical protein  33.33 
 
 		 407 aa  62.8  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2043  hypothetical protein  40.91 
 
 		 356 aa  62.4  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000980864  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2600  diguanylate cyclase with beta propeller sensor  30.65 
 
 		 977 aa  62  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>