43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0846 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0846  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 155 aa  315  2e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.321118 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0389  hypothetical protein  52 
 
 		 404 aa  149  1e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000587209  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2043  hypothetical protein  52.08 
 
 		 356 aa  147  7e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000980864  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0683  hypothetical protein  52.67 
 
 		 169 aa  142  1e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0430882  normal  0.218421 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0353  hypothetical protein  50.67 
 
 		 409 aa  141  3e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000000783451  normal  0.36441 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2398  hypothetical protein  56.41 
 
 		 167 aa  136  1e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2052  hypothetical protein  45.39 
 
 		 403 aa  135  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000379131  normal  0.0792841 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2054  hypothetical protein  44.44 
 
 		 407 aa  130  7.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.247121  normal  0.0331118 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1854  hypothetical protein  44 
 
 		 409 aa  123  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1856  hypothetical protein  43.66 
 
 		 407 aa  115  3e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1855  hypothetical protein  44.7 
 
 		 409 aa  111  4.0000000000000004e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1857  hypothetical protein  38.82 
 
 		 412 aa  103  9e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0585  hypothetical protein  44.54 
 
 		 413 aa  99  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.227182  normal  0.394141 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0142  hypothetical protein  38.67 
 
 		 421 aa  96.7  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0129237  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0522  sigma-70, region 4 type 2  38.73 
 
 		 408 aa  90.1  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2053  regulatory protein LuxR  42.45 
 
 		 410 aa  86.3  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00334599  normal  0.0797865 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0390  hypothetical protein  46.34 
 
 		 400 aa  84  8e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000281987  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2055  hypothetical protein  38.39 
 
 		 412 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0322363 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1214  hypothetical protein  46.38 
 
 		 411 aa  74.7  0.0000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.636618 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0216  response regulator receiver domain-containing protein  30.83 
 
 		 398 aa  67.4  0.00000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0122145  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1127  two component regulator propeller domain protein  35.44 
 
 		 924 aa  64.7  0.0000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4178  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  26.38 
 
 		 976 aa  64.7  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1046  transcriptional regulator, LuxR family  37.18 
 
 		 947 aa  61.2  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5110  Two component regulator three Y domain protein  31 
 
 		 966 aa  58.9  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.58811  normal  0.312264 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2430  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  37.04 
 
 		 918 aa  58.9  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.36505  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3526  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 921 aa  57.8  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3632  Two component regulator three Y domain protein  35.38 
 
 		 966 aa  56.6  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1559  two component regulator  35.62 
 
 		 959 aa  53.9  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6752  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.5 
 
 		 549 aa  49.3  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4457  transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 966 aa  46.6  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.547155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5363  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  27.14 
 
 		 607 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.423746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2397  TPR repeat-containing protein  28.75 
 
 		 571 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1033  TPR repeat-containing protein  24.76 
 
 		 545 aa  43.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1040  LuxR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 216 aa  42.4  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.723479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5044  LuxR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 230 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.263575  hitchhiker  0.00837426 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2254  transcriptional regulator, LuxR family  38.18 
 
 		 235 aa  41.6  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1932  transcriptional regulator, LuxR family  37.93 
 
 		 241 aa  41.6  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0592371 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1977  regulatory protein LuxR  38.89 
 
 		 235 aa  41.6  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0756  LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 228 aa  41.6  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.826443 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5351  transcriptional regulator, LuxR family  40.38 
 
 		 229 aa  41.6  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.649636  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2641  hypothetical protein  29.33 
 
 		 603 aa  41.2  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4976  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.29 
 
 		 218 aa  41.2  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.289575  normal  0.034027 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4624  hypothetical protein  26.6 
 
 		 638 aa  40.4  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.706425  normal  0.495642 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>