More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0156 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0156  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  100 
 
 		 1075 aa  2202    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000640114  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  25.55 
 
 		 1407 aa  230  9e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2140  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.27 
 
 		 1211 aa  211  4e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.382987 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0792  histidine kinase  25.09 
 
 		 1378 aa  211  5e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5621  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.97 
 
 		 1258 aa  211  8e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879931  normal  0.634334 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1301  two component regulator propeller domain protein  24.1 
 
 		 1008 aa  209  3e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.503431  normal  0.30236 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1225  diguanylate cyclase with beta propeller sensor  24.37 
 
 		 985 aa  203  9.999999999999999e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.90661  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  24.71 
 
 		 1370 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02778  GGDEF protein  24.03 
 
 		 946 aa  200  1.0000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2607  GGDEF domain-containing protein  24.81 
 
 		 1054 aa  199  2.0000000000000003e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.202674  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6165  histidine kinase  24.82 
 
 		 1397 aa  192  2.9999999999999997e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000541195 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3749  putative signal transduction histidine kinase  24.97 
 
 		 1018 aa  191  5.999999999999999e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0973084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0921  histidine kinase  23.29 
 
 		 1105 aa  190  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615746 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2733  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  24.46 
 
 		 965 aa  187  7e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.28 
 
 		 1030 aa  184  8.000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223882  normal  0.750566 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2648  response regulator receiver  23.49 
 
 		 1363 aa  181  5.999999999999999e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2605  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.16 
 
 		 1453 aa  180  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2019  histidine kinase  24.03 
 
 		 1316 aa  179  3e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523526  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4824  histidine kinase  24.28 
 
 		 1024 aa  178  4e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0714049  normal  0.112759 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1699  ATP-binding region, ATPase-like protein  23.15 
 
 		 1396 aa  178  5e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.170141  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1331  sensor histidine kinase/response regulator  23.1 
 
 		 1118 aa  177  9e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0275  histidine kinase  25.2 
 
 		 1070 aa  177  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0505  response regulator receiver  23.75 
 
 		 1334 aa  175  3.9999999999999995e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0967  GGDEF family protein  24.29 
 
 		 976 aa  174  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.1127  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_105  histidine kinase CheY-like domain protein  25.43 
 
 		 1070 aa  174  1e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4193  histidine kinase  25.06 
 
 		 1400 aa  172  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00660029  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0667  response regulator receiver domain-containing protein  24.04 
 
 		 1526 aa  172  3e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0280955  hitchhiker  0.000000898802 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  23.53 
 
 		 1346 aa  172  3e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0448  histidine kinase  24.19 
 
 		 1114 aa  169  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.823175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4560  histidine kinase  23.99 
 
 		 1313 aa  168  4e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.498007  normal  0.022289 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3999  adenylate/guanylate cyclase  40.28 
 
 		 351 aa  167  8e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5389  histidine kinase  24.12 
 
 		 1414 aa  166  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.157534 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1335  histidine kinase  23.33 
 
 		 1278 aa  164  7e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.820531 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3648  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  23.95 
 
 		 1511 aa  160  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2417  adenylate/guanylate cyclase  37.14 
 
 		 1207 aa  159  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.239282 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0559  histidine kinase  24.13 
 
 		 1327 aa  159  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00477073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0783  ATP-binding region ATPase domain protein  24.55 
 
 		 1374 aa  159  4e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2726  ATP-binding region ATPase domain protein  23.6 
 
 		 1355 aa  159  4e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2076  histidine kinase  23.47 
 
 		 1373 aa  158  5.0000000000000005e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3298  sensory box protein  25.12 
 
 		 1494 aa  158  5.0000000000000005e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.217559 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2667  histidine kinase  25.06 
 
 		 1017 aa  158  7e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.865327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2852  histidine kinase  24.04 
 
 		 1342 aa  158  7e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0012841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2339  histidine kinase  23.84 
 
 		 1009 aa  157  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1489  histidine kinase  23.99 
 
 		 1404 aa  155  5e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639294  normal  0.537564 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0622  histidine kinase  23.17 
 
 		 1013 aa  154  5.9999999999999996e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.378276 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0341  sensory box protein  23.56 
 
 		 1515 aa  154  7e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3762  putative adenylate/guanylate cyclase  35.38 
 
 		 520 aa  154  7e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.978534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  23.21 
 
 		 1374 aa  154  7e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1901  adenylate/guanylate cyclase  33.19 
 
 		 381 aa  154  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3993  adenylate/guanylate cyclase  37.96 
 
 		 1209 aa  152  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.787867  normal  0.246996 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5544  histidine kinase  24.91 
 
 		 1306 aa  153  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3633  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  24.42 
 
 		 1504 aa  152  3e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3829  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  23.73 
 
 		 1505 aa  152  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0755  GGDEF domain-containing protein  23.22 
 
 		 1053 aa  152  4e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2832  ATP-binding region ATPase domain protein  23.3 
 
 		 1340 aa  152  4e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201204  hitchhiker  0.008817 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0993  ligand-binding sensor domain-containing protein  23.03 
 
 		 1250 aa  152  4e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3543  Hpt sensor hybrid histidine kinase  23.36 
 
 		 1498 aa  151  7e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.476146  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6436  histidine kinase  23.36 
 
 		 1418 aa  150  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0311  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  24.33 
 
 		 1504 aa  149  3e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3862  histidine kinase  23.87 
 
 		 1384 aa  148  6e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0812  histidine kinase  22.74 
 
 		 1335 aa  147  8.000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3424  GGDEF domain-containing protein  23.01 
 
 		 1502 aa  147  8.000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4321  histidine kinase  25.46 
 
 		 1355 aa  147  8.000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0605  adenylate/guanylate cyclase  37.56 
 
 		 355 aa  147  9e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.657653  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4026  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  24.14 
 
 		 1508 aa  146  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0415  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  23.84 
 
 		 1486 aa  146  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05925  GGDEF domain protein  23.33 
 
 		 1005 aa  145  5e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3414  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  35.22 
 
 		 431 aa  145  6e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.138432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1316  diguanylate cyclase  23.44 
 
 		 1004 aa  145  6e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.730261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4145  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  24.14 
 
 		 1508 aa  144  6e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4159  histidine kinase  23.18 
 
 		 1017 aa  144  8e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0934723  normal  0.139569 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  23.54 
 
 		 1378 aa  142  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3950  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  23.77 
 
 		 1508 aa  142  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1571  adenylate/guanylate cyclase  34.44 
 
 		 426 aa  142  3.9999999999999997e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000352613  hitchhiker  0.00000380859 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3872  histidine kinase  22.73 
 
 		 1373 aa  140  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459124  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5256  histidine kinase  23.17 
 
 		 1063 aa  140  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.015523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2791  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.73 
 
 		 1226 aa  138  5e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.544858 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4052  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  23.82 
 
 		 1508 aa  138  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0550  histidine kinase  22.13 
 
 		 1388 aa  137  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23656  normal  0.89256 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1528  adenylate/guanylate cyclase  34.3 
 
 		 350 aa  135  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1562  adenylate/guanylate cyclase  32.81 
 
 		 435 aa  134  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.165048 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1006  histidine kinase  23.46 
 
 		 967 aa  134  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3120  histidine kinase  23.16 
 
 		 1344 aa  134  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.628446  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0536  histidine kinase  23.36 
 
 		 1324 aa  133  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0692259  normal  0.421547 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6414  adenylate cyclase  33.33 
 
 		 395 aa  133  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0293466  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1493  sensor histidine kinase/response regulator  24.14 
 
 		 1086 aa  132  3e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0890895  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3041  adenylate cyclase  30.89 
 
 		 439 aa  131  6e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.14332  normal  0.182676 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1010  histidine kinase  22.25 
 
 		 1347 aa  131  7.000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0363668  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1764  sensor histidine kinase/response regulator  23.44 
 
 		 1093 aa  131  8.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.412354  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3025  adenylate/guanylate cyclase  30.89 
 
 		 439 aa  130  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3084  adenylate cyclase  30.89 
 
 		 439 aa  130  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0535498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.65 
 
 		 1079 aa  129  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2092  adenylate/guanylate cyclase  31.01 
 
 		 395 aa  129  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.498255  normal  0.305178 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1027  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  22.14 
 
 		 1276 aa  128  7e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2107  two component transcriptional regulator, AraC family  22.63 
 
 		 1349 aa  127  8.000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000288147  normal  0.419692 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4600  two component regulator propeller domain protein  22.59 
 
 		 1194 aa  127  9e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.779291 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0533  adenylate/guanylate cyclase  30.34 
 
 		 422 aa  127  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.549362  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0215  adenylate/guanylate cyclase  33.2 
 
 		 351 aa  126  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.354021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01175  GGDEF domain protein  23.54 
 
 		 1351 aa  126  3e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11641  membrane-anchored adenylyl cyclase cya  32.21 
 
 		 443 aa  124  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.512599 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>