More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3993 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_3993  adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 		 1209 aa  2471    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.787867  normal  0.246996 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1035  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  45.13 
 
 		 1262 aa  612  1e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1949  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  52.09 
 
 		 1264 aa  497  1e-139  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354443 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2650  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  51.81 
 
 		 1016 aa  481  1e-134  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0326651 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3988  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  49.8 
 
 		 1018 aa  478  1e-133  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  45.15 
 
 		 1322 aa  453  1.0000000000000001e-126  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1427  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.63 
 
 		 717 aa  441  9.999999999999999e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2151  ammonium transporter  46.81 
 
 		 611 aa  384  1e-105  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0766  ammonium transporter  42.86 
 
 		 644 aa  384  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.543841  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0551  ammonium transporter  46.08 
 
 		 444 aa  341  5e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.138976  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2156  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  41.36 
 
 		 904 aa  327  8.000000000000001e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.145891  normal  0.187979 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3791  ammonium transporter  44.42 
 
 		 468 aa  326  2e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1757  ammonium transporter  46.68 
 
 		 437 aa  319  2e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.966665 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3492  ammonium transporter  44.5 
 
 		 461 aa  318  3e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0555  ammonium transporter  44.53 
 
 		 446 aa  317  9.999999999999999e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2435  ammonium transporter  46.12 
 
 		 471 aa  308  3e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.127565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2417  adenylate/guanylate cyclase  37.85 
 
 		 1207 aa  306  1.0000000000000001e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.239282 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3089  ammonium transporter  43.18 
 
 		 441 aa  304  6.000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.417967 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0486  ammonium transporter  43.83 
 
 		 483 aa  304  8.000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3049  ammonium transporter  41.51 
 
 		 460 aa  303  1e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1022  ammonium transporter  43.46 
 
 		 449 aa  299  2e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3305  ammonium transporter  43.1 
 
 		 408 aa  299  3e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.508137  normal  0.377224 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0210  ammonium transporter  40.71 
 
 		 439 aa  296  1e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0532  ammonium transporter  42.62 
 
 		 435 aa  295  3e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000756367  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0518  ammonium transporter  42.62 
 
 		 435 aa  295  3e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000597851  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1902  ammonium transporter  42.07 
 
 		 478 aa  293  1e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0388203  hitchhiker  0.000364558 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2984  ammonium transporter  42.31 
 
 		 478 aa  292  3e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0499  ammonium transporter  40.49 
 
 		 525 aa  291  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0442  ammonium transporter  41.15 
 
 		 497 aa  291  7e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.757816 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1018  ammonium transporter  41.35 
 
 		 445 aa  287  8e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00157851  normal  0.490999 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4312  ammonium transporter  40.94 
 
 		 506 aa  285  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1796  ammonium transporter  43.91 
 
 		 441 aa  285  5.000000000000001e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0973  ammonium transporter  40 
 
 		 441 aa  283  1e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000814045  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2528  ammonium transporter  41.45 
 
 		 461 aa  282  3e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.26052  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3175  ammonium transporter  40.48 
 
 		 469 aa  281  5e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.640625  hitchhiker  0.0015046 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2955  ammonium transporter  40.47 
 
 		 518 aa  279  3e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0113  ammonium transporter  40.88 
 
 		 458 aa  277  8e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1259  ammonium transporter  41.22 
 
 		 515 aa  277  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150003 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1229  ammonium transporter  41.22 
 
 		 515 aa  277  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3999  adenylate/guanylate cyclase  61.3 
 
 		 351 aa  277  1.0000000000000001e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0663  ammonium transporter  39.8 
 
 		 407 aa  276  2.0000000000000002e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24801  ammonium transporter  42.04 
 
 		 482 aa  273  1e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0782  ammonium transporter  39.31 
 
 		 511 aa  271  4e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0565  ammonium transporter  42.82 
 
 		 422 aa  271  8e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000904674  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3636  ammonium transporter  40.33 
 
 		 509 aa  268  4e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.348655 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02901  ammonium transporter  39.22 
 
 		 476 aa  268  5e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2576  ammonium transporter  39.04 
 
 		 433 aa  268  5e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02961  ammonium transporter  41.63 
 
 		 486 aa  267  8e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1499  ammonium transporter  40.66 
 
 		 584 aa  267  8e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907074  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1341  ammonium transporter  39.32 
 
 		 442 aa  266  2e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000498095  unclonable  0.00000143333 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4477  ammonium transporter  41.11 
 
 		 488 aa  266  2e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341446  normal  0.184801 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02851  ammonium transporter  40.89 
 
 		 486 aa  262  3e-68  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.64492  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02861  ammonium transporter  40.89 
 
 		 486 aa  262  3e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1163  ammonium transporter  39.58 
 
 		 441 aa  261  5.0000000000000005e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000433758  normal  0.156813 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0916  ammonium transporter  40.91 
 
 		 462 aa  259  1e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.685309  normal  0.315253 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1729  ammonium transporter  39.39 
 
 		 507 aa  260  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.427726  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0276  ammonium transporter  37.59 
 
 		 489 aa  259  2e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2218  ammonium transporter  39.39 
 
 		 506 aa  259  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1656  ammonium transporter  39.16 
 
 		 507 aa  258  5e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0646033  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4247  ammonium transporter  37.95 
 
 		 495 aa  257  1.0000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0572561  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0265  ammonium transporter  39.56 
 
 		 487 aa  256  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6567  ammonium transporter  38.29 
 
 		 474 aa  254  7e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.510498 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1138  ammonium transporter  40.48 
 
 		 442 aa  253  2e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.135685 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1629  ammonium transporter  36.38 
 
 		 496 aa  253  2e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0247  ammonium transporter  37.56 
 
 		 490 aa  253  2e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2018  ammonium transporter  38.81 
 
 		 478 aa  253  2e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.678584  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03411  ammonium transporter  36.38 
 
 		 496 aa  253  2e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3571  ammonium transporter  37.5 
 
 		 446 aa  250  1e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6414  adenylate cyclase  55.13 
 
 		 395 aa  247  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0293466  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1562  adenylate/guanylate cyclase  55.02 
 
 		 435 aa  244  9e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.165048 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0144  ammonium transporter  40.85 
 
 		 437 aa  243  2e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1901  adenylate/guanylate cyclase  51.33 
 
 		 381 aa  241  5.999999999999999e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4446  ammonium transporter  38.41 
 
 		 541 aa  239  2e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4745  ammonium transporter  35.4 
 
 		 514 aa  238  8e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000955224 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2092  adenylate/guanylate cyclase  39.58 
 
 		 395 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.498255  normal  0.305178 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4057  ammonium transporter  36.49 
 
 		 435 aa  235  4.0000000000000004e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.211238 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28535  Amt family transporter: ammonium  34.5 
 
 		 433 aa  235  5e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2248  ammonium transporter  37.62 
 
 		 433 aa  233  2e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3120  ammonium transporter  35.38 
 
 		 414 aa  232  4e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3414  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  50.41 
 
 		 431 aa  231  7e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.138432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1639  ammonium transporter  38.97 
 
 		 489 aa  231  7e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.294546  normal  0.322365 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0260  ammonium transporter  37.5 
 
 		 416 aa  230  1e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.647918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3657  ammonium transporter  36.38 
 
 		 421 aa  228  4e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2954  ammonium transporter  35.63 
 
 		 488 aa  228  7e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0079  ammonium transporter  35.87 
 
 		 416 aa  227  1e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.376757  normal  0.798164 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3576  putative adenylate/guanylate cyclase  46.98 
 
 		 396 aa  226  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0204141 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11641  membrane-anchored adenylyl cyclase cya  48 
 
 		 443 aa  226  3e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.512599 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1303  ammonium transporter  36.3 
 
 		 447 aa  224  4.9999999999999996e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.863538  normal  0.392639 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2869  ammonium transporter  36.21 
 
 		 395 aa  224  8e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54981  predicted protein  33.26 
 
 		 539 aa  223  9.999999999999999e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.458082  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1571  adenylate/guanylate cyclase  48.65 
 
 		 426 aa  223  1.9999999999999999e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000352613  hitchhiker  0.00000380859 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1788  Rh-like protein/ammonium transporter  38.86 
 
 		 496 aa  223  1.9999999999999999e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0293  Rh family protein/ammonium transporter  36.15 
 
 		 449 aa  221  5e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.825675  normal  0.151871 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3240  Rh family protein/ammonium transporter  36.45 
 
 		 416 aa  221  8.999999999999998e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.212447  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3361  Rh family protein/ammonium transporter  35.09 
 
 		 416 aa  221  8.999999999999998e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0592  Rh family protein/ammonium transporter  35.09 
 
 		 416 aa  221  8.999999999999998e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3084  adenylate cyclase  45.09 
 
 		 439 aa  221  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0535498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2630  ammonium transporter  38.31 
 
 		 440 aa  220  1e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3025  adenylate/guanylate cyclase  45.09 
 
 		 439 aa  221  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3531  Rh family protein/ammonium transporter  35.24 
 
 		 416 aa  220  1e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>