More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0260 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0260  ammonium transporter  100 
 
 		 416 aa  827    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.647918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3120  ammonium transporter  70.29 
 
 		 414 aa  600  1e-170  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3240  Rh family protein/ammonium transporter  68.86 
 
 		 416 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.212447  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1500  ammonium transporter  72.06 
 
 		 414 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3531  Rh family protein/ammonium transporter  68.86 
 
 		 416 aa  558  1e-158  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3162  Rh-like protein/ammonium transporter  72.13 
 
 		 416 aa  557  1e-157  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0234598  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3361  Rh family protein/ammonium transporter  68.61 
 
 		 416 aa  557  1e-157  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0592  Rh family protein/ammonium transporter  68.61 
 
 		 416 aa  557  1e-157  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0624  Rh family protein/ammonium transporter  67.15 
 
 		 416 aa  556  1e-157  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0505999  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0642  putative ammonium transporter  69.91 
 
 		 426 aa  552  1e-156  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0760  ammonium transporter  68.61 
 
 		 408 aa  553  1e-156  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03436  hypothetical protein  69.57 
 
 		 409 aa  552  1e-156  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2589  ammonium transporter  67.63 
 
 		 409 aa  554  1e-156  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0798  ammonium transporter  67.97 
 
 		 416 aa  554  1e-156  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0469975  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3707  ammonium transporter  67.97 
 
 		 416 aa  554  1e-156  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00259002  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3649  ammonium transporter  67.97 
 
 		 416 aa  554  1e-156  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243704  hitchhiker  0.000385246 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3831  ammonium transporter  68.22 
 
 		 416 aa  552  1e-156  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0618394  normal  0.138544 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0847  Rh family protein/ammonium transporter  67.64 
 
 		 416 aa  546  1e-154  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.105757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0834  Rh family protein/ammonium transporter  66.67 
 
 		 416 aa  543  1e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.809964  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3657  ammonium transporter  70.85 
 
 		 421 aa  543  1e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0651  Rh-like protein/ammonium transporter  68.14 
 
 		 416 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.479861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0934  Rh family protein/ammonium transporter  67.4 
 
 		 416 aa  535  1e-151  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0980  Rh family protein/ammonium transporter  67.4 
 
 		 417 aa  532  1e-150  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.7151 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2347  Rh-like protein/ammonium transporter  69.62 
 
 		 420 aa  534  1e-150  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00480  putative ammonium transporter  71.43 
 
 		 415 aa  525  1e-148  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0196  putative ammonium transporter, marine subtype  69.36 
 
 		 417 aa  524  1e-147  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0079  ammonium transporter  65.69 
 
 		 416 aa  521  1e-147  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.376757  normal  0.798164 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2407  ammonium transporter  68.38 
 
 		 414 aa  520  1e-146  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002573  ammonium transporter  68.64 
 
 		 381 aa  512  1e-144  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000132513  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2044  ammonium transporter, AmtB  69.62 
 
 		 420 aa  506  9.999999999999999e-143  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0927087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1340  ammonium transporter  65.53 
 
 		 417 aa  505  9.999999999999999e-143  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2904  Rh-like protein/ammonium transporter  66.18 
 
 		 416 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.676438  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0136  putative ammonium transporter  68.86 
 
 		 411 aa  507  9.999999999999999e-143  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000107717  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0172  Rh family protein/ammonium transporter  68.09 
 
 		 417 aa  502  1e-141  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000030893  normal  0.412572 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3025  ammonium transporter  66.19 
 
 		 406 aa  498  1e-140  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.228412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0233  ammonium transporter  70.31 
 
 		 411 aa  499  1e-140  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0507426  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0522  Rh family protein/ammonium transporter  67.76 
 
 		 423 aa  497  1e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.395518  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0492  Rh-like protein/ammonium transporter  68.42 
 
 		 422 aa  487  1e-136  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.905318  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4057  ammonium transporter  58.23 
 
 		 435 aa  421  1e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.211238 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1303  ammonium transporter  55.91 
 
 		 447 aa  421  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.863538  normal  0.392639 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2630  ammonium transporter  56.4 
 
 		 440 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0144  ammonium transporter  55.56 
 
 		 437 aa  404  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0293  Rh family protein/ammonium transporter  52.08 
 
 		 449 aa  378  1e-104  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.825675  normal  0.151871 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0551  ammonium transporter  46.75 
 
 		 444 aa  350  4e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.138976  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0555  ammonium transporter  47.36 
 
 		 446 aa  332  8e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0442  ammonium transporter  45.43 
 
 		 497 aa  326  5e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.757816 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0973  ammonium transporter  48.14 
 
 		 441 aa  323  3e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000814045  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0518  ammonium transporter  46.3 
 
 		 435 aa  322  7e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000597851  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0532  ammonium transporter  46.3 
 
 		 435 aa  322  7e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000756367  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4312  ammonium transporter  44.92 
 
 		 506 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3492  ammonium transporter  45.6 
 
 		 461 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24801  ammonium transporter  46.48 
 
 		 482 aa  313  2.9999999999999996e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0782  ammonium transporter  42.35 
 
 		 511 aa  313  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3791  ammonium transporter  43.47 
 
 		 468 aa  310  4e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0499  ammonium transporter  44.71 
 
 		 525 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0916  ammonium transporter  45.73 
 
 		 462 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.685309  normal  0.315253 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0265  ammonium transporter  45.16 
 
 		 487 aa  305  1.0000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1341  ammonium transporter  47.52 
 
 		 442 aa  305  1.0000000000000001e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000498095  unclonable  0.00000143333 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1163  ammonium transporter  45.41 
 
 		 441 aa  301  1e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000433758  normal  0.156813 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1499  ammonium transporter  43.29 
 
 		 584 aa  301  2e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907074  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2955  ammonium transporter  43.41 
 
 		 518 aa  301  2e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1018  ammonium transporter  42.86 
 
 		 445 aa  300  2e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00157851  normal  0.490999 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0247  ammonium transporter  45.86 
 
 		 490 aa  300  4e-80  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02851  ammonium transporter  47.38 
 
 		 486 aa  299  5e-80  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.64492  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1022  ammonium transporter  45.06 
 
 		 449 aa  299  5e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02861  ammonium transporter  47.38 
 
 		 486 aa  299  5e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1629  ammonium transporter  44.7 
 
 		 496 aa  298  8e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02961  ammonium transporter  47.14 
 
 		 486 aa  298  8e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03411  ammonium transporter  44.7 
 
 		 496 aa  298  8e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3049  ammonium transporter  42.42 
 
 		 460 aa  297  2e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3571  ammonium transporter  44.55 
 
 		 446 aa  298  2e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1229  ammonium transporter  43.72 
 
 		 515 aa  297  3e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1259  ammonium transporter  43.72 
 
 		 515 aa  297  3e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150003 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0113  ammonium transporter  44.26 
 
 		 458 aa  294  2e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4477  ammonium transporter  45.48 
 
 		 488 aa  294  2e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341446  normal  0.184801 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0276  ammonium transporter  44.68 
 
 		 489 aa  293  3e-78  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0643  Rh-like protein/ammonium transporter  40.92 
 
 		 391 aa  293  3e-78  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.32832  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2435  ammonium transporter  45.56 
 
 		 471 aa  292  7e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.127565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3305  ammonium transporter  43.49 
 
 		 408 aa  288  8e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.508137  normal  0.377224 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02901  ammonium transporter  44.34 
 
 		 476 aa  287  2e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1796  ammonium transporter  41.61 
 
 		 441 aa  287  2e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1138  ammonium transporter  46.29 
 
 		 442 aa  287  2e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.135685 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0486  ammonium transporter  43.48 
 
 		 483 aa  287  2e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1729  ammonium transporter  42.37 
 
 		 507 aa  283  6.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.427726  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3636  ammonium transporter  43.27 
 
 		 509 aa  283  6.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.348655 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2984  ammonium transporter  44.21 
 
 		 478 aa  281  2e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1902  ammonium transporter  43.97 
 
 		 478 aa  281  2e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0388203  hitchhiker  0.000364558 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2218  ammonium transporter  42.14 
 
 		 506 aa  280  3e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1757  ammonium transporter  42.93 
 
 		 437 aa  279  5e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.966665 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1656  ammonium transporter  42.6 
 
 		 507 aa  279  8e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0646033  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1530  ammonium transporter  42.92 
 
 		 512 aa  274  2.0000000000000002e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.595871  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3175  ammonium transporter  40.18 
 
 		 469 aa  267  2e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.640625  hitchhiker  0.0015046 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2018  ammonium transporter  40.14 
 
 		 478 aa  268  2e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.678584  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3089  ammonium transporter  40.42 
 
 		 441 aa  266  4e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.417967 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0663  ammonium transporter  41.34 
 
 		 407 aa  264  3e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2576  ammonium transporter  39.08 
 
 		 433 aa  260  2e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1639  ammonium transporter  40.09 
 
 		 489 aa  258  1e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.294546  normal  0.322365 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2528  ammonium transporter  40.93 
 
 		 461 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.26052  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3599  ammonium transporter  39.81 
 
 		 417 aa  253  7e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2650  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  38.93 
 
 		 1016 aa  249  6e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0326651 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>